VMTK 读取DCM文件，选择合适的区域，使用marching cudes 重建3D 图像

最新推荐文章于 2024-03-08 18:18:58 发布
最新推荐文章于 2024-03-08 18:18:58 发布
阅读量1.8k 收藏 4
点赞数 1
分类专栏： VMTK 文章标签： VMTK
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Jane_yuhui/article/details/84327560
版权 
vmtkimagereader -f dicom -d "DICOM_folder_path" --pipe \
vmtkimagevoiselector -ofile image_volume_voi.vti

# 按下 i 键，进行交互，选择合适的体绘制区域或者
# vmtkimagevoiselector -ifile image_volume_voi.vti -ofile select_volume_voi.vti


# 180 可以改为你想要重建的表面的灰度值
vmtkmarchingcubes -ifile image_volume_voi.vti -l 180 -ofile mc_surface.vtp --pipe \
vmtksurfaceviewer

张大饼的最爱
关注
  • 1
    点赞
  • 踩
  • 4
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 3
    评论
专栏目录
Ubuntu18.04 --- VMTK安装
oucc257的博客
10-14 516
vmtk Scripts | vmtk - the Vascular Modelling Toolkit
Windows系统——VMTK安装教程
未来可期
01-02 2832
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录一、VMTK简介二、官网安装教程 一、VMTK简介 vmtk（The Vascular Modeling Toolkit）是用于基于图像的血管建模的3D重建，几何分析，网格生成和表面数据分析的库和工具的集合。 官网：http://www.vmtk.org/ 二、官网安装教程 VMTK最新版本（1.4.0） 安装说明： 1）确保系统上安装了Anaconda或Miniconda（最好是python 3.6版本）。 2.
VTK对DICOM三维重建代码
07-25
利用VTK编程语言，对dcm序列进行三维重建
VMTK Tutorials
03-12
自己整理的一个关于VMTK的文档，详细介绍了关于VMTK的使用情况。VMTK是一个使用ITK，VTK用于血管结构分割、提取、分析的开源C++库。对三维医学图像处理有兴趣的人可以好好研究一下。
VTK(四)---VMTK血管中心线提取
老邹的博客
03-14 4843
测试模型获取： lumen.stl 代码： CMakeLists.txt cmake_minimum_required(VERSION 3.5) project(VesselCenterline LANGUAGES CXX) set(CMAKE_CXX_STANDARD 11) set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON) # VMTK find_package( VMTK REQUIRED) include(${VMTK_USE_FILE}) # ITK find_pack
VMTK学习——02.基本的PYPES教程
未来可期
03-14 1411
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录基本的PYPES教程 基本的PYPES教程 最新的稳定版本和开发版本 本教程将使您开始使用PypeS。建议的第一步是有效使用vmtk的第一步。 PypeS是vmtk脚本之间的粘合剂。它允许轻松编写新脚本并具有通用接口，但是最重要的是，它允许单个vmtk脚本相互交互，从而使vmtk模块化且灵活。 原始链接：http://www.vmtk.org/tutorials/PypesBasic.html 让我们键入vmtk.
推荐开源项目：vmtk
最新发布
gitblog_00001的博客
03-08 408
推荐开源项目：vmtk 项目简介 vmtk 是一个基于 Python 的血管建模工具包，用于血管的分割、重建、分析等任务。 应用场景 vmtk 可以应用于医学影像处理、生物医学工程等领域。具体应用场景包括： 血管分割：将血管从 MRI 或 CT 图像中分割出来。 血管重建：根据分割得到的图像数据，构建三维血管模型。 血管分析：对血管进行各种量化分析，如直径、长度、分支点数量等。 项目特点 以下...
VMTK-thesis good.pdf
04-19
根据提供的文件信息，本文将围绕“血管处理软件VMTK”的使用和开发进行详细讲解。本文档描述了一篇关于VMTK界面开发的论文，目的是开发一个工具，以便能够处理医学影像数据，特别是DICOM（数字医学通讯）格式的数据...
vmtk-master.7z
04-19
2. **血管分割**：VMTK提供了一套基于水平集和区域生长的算法，帮助用户从CT或MRI图像中精确地分割出血管结构。这对于临床诊断和手术规划至关重要。 3. **表面重建**：从二值图像中提取血管中心线后，VMTK能生成...
vmtk:血管建模工具包
05-14
介绍 血管建模工具包是用于基于图像的血管建模的3D重建，几何分析，网格生成和表面数据分析的库和工具的集合。...查看“水平集分割”教程，了解如何使用水平集从CT或MR图像重建血管段的3D表面。 // Image seg
matlab 心脏血管中心线提取
08-25
基于Matlab程序，对心脏血管中心线进行提取，并实现心血管分割
VMTK（1）——安装
weixin_42040046的博客
11-16 4173
VMTK——The Vascular Modeling Toolkit（血管建模工具包）1、安装 官网：http://www.vmtk.org/ 1、安装 http://www.vmtk.org/download/ 版本：VMTK最新版本(1.4.0) 兼容和依赖（Compatibility and Dependencies）： VMTK 1.4+的一般依赖关系由anaconda包管理器自动安装...
VMTK学习——01.入门
未来可期
03-14 2597
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录入门读取和显示图像关于文件名的注释图像格式转换档案格式感兴趣体积（VOI）提取使用Marching Cubes进行表面提取 入门 本教程演示了如何在vmtk中打开数据集，导航到3D体积并设置图像以进行进一步处理。 原始链接：http://www.vmtk.org/documentation/getting-started.html 读取和显示图像 第一步是读取图像并将其显示在屏幕上。vmtkimagereader能够.
Windows10完美安装VMTK（血管建模工具包）
未来可期
01-02 1992
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录 安装说明： 1）Win10系统上先安装了Anaconda（最好是python 3.6版本）。 2）打开anaconda prompt 3）输入以下命令以创建安装了vmtk的新虚拟环境（将名称“ foo”替换为您要调用的环境）： conda create -n foo -c vmtk python=3.6 itk vtk vmtk 4）请记住，您需要先激活此虚拟环境，然后才能使用该库。使用命令启动环境source a.
python & vmtk 提取血管中心线
qq_33551423的博客
03-30 3125
基于VMTK提取血管中心线
VMTK【1】Getting Started
qq_27234457的博客
09-20 3846
%date:2016/9/20 %author:lingling不吃鱼VMTK是直接安装可用的，提前只需要配置python2.7的环境即可，故安装过程不做赘述。 附上官网学习网址： http://www.vmtk.org/documentation/getting-started.html 不习惯看英文的同学且为刚接触医学软件的新手可以结合这篇博客学习。第一步：Reading and dis
VTK(五)---内窥镜漫游（基于VMTK血管中心线提取）
老邹的博客
03-14 2514
在使用VMTK血管中心线提取之后，实现内窥镜的漫游： VTK(四)—VMTK血管中心线提取 本文测试模型： lumen.stl： https://github.com/jackyko1991/Vessel-Centerline-Extraction/tree/master/test_data/right 前言 对提取的中心线进行曲线插值，使得路径平滑，并跟随中心线完成内窥镜的漫游。 实现效果： 代码 CMakeLists.txt: cmake_minimum_required(VERSION 3.5)
Ubuntu18-安装vmtk
小可爱的博客
09-22 648
官网教程：http://www.vmtk.org/download/ ubuntu 配置 vmtk :https://www.jianshu.com/p/c3bd28972ca0 按照这下面的流程一步一安装： 安装 python 依赖包(等会 VMTK 要用) sudo apt-get install python-dev libqt4-dev sudo mkdir /usr/lib/python2.7/config/ sudo cp /usr/lib/python2.7/config-x86_64-
python webdriver脚本例子_selenium_webdriver(python)的第一个脚本
weixin_39639040的博客
12-05 165
首先要感谢一下“虫师”的教程(“http://fnng.cnblogs.com”)，讲解的很细致，让我这个第一次接触selenium的菜鸟成功的完成环境的搭建(当然是连带场外支援)和教程中的第一个脚本。1.环境搭建的波折经历firstly，python的安装，包括python.org、setuptools(基础包工具)、pip(安装包管理工具)。第一个困难就是cmd中，python不是内部命令，要...
评论 3
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值