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原创 slurm 有节点一直是down*状态

gres.conf 文件(/opt/slurm/etc/gres.conf)里表明该节点有个tesla的GPU卡,它引用了/dev/nvidia0文件。4. 神奇的是,执行完这个nvidia-smi后,/dev/里有nvidia0了。NodeName=节点名 Type=tesla Name=gpu File=/dev/nvidia0。在该节点ls /dev 确实是没有看到/dev/nvidia0文件。3. 在该节点执行以下命令后,确实是显示了GPU卡的信息。2. 登录有问题节点后,

2024-02-01 17:26:41 1500

原创 配置RStudio server和shiny server 以指定LD_LIBRARY_PATH

【代码】配置RStudio和shiny以指定LD_LIBRARY_PATH。

2023-05-16 17:05:13 390

原创 我的R编译选项

-with-tcl-config=/路径到/tcltk/tcl8.5.19/unix/mybuild/lib/tclConfig.sh \。LDFLAGS="-L/路径到/Intel_oneAPI/mybuild/mkl/latest/lib/intel64 -l mkl_rt"--with-tk-config=/路径到/tcltk/tk8.5.19/unix/mybuild/lib/tkConfig.sh \。

2022-12-09 22:27:47 181

原创 R编译带tcltk选项及安装R包gWidgets2tcltk

需要将putty的“Enable X11 forwarding"打开,运行Xming,再用putty登录服务器,重新安装gWidgets2tcltk。2. 安装R包gWidgets2tcltk。该包依赖于软件tcktk(

2022-12-09 22:24:53 670

原创 配置RStudioServer,避免占用/home空间

配置RStudioServer,避免占用/home空间

2022-09-14 17:06:41 824 1

原创 using jupyter

0. install python and jupyterIn my ~/.bashrc, I have:. /tools/software/Modules/modules-4.7.1/init/profile.shexport MODULEPATH="/tools/modulefiles:/workspace/japrin/05.setting/modulefiles":$MODULEPATHmodule purgemodule load python/3.9.51. gener

2022-02-10 09:56:48 413

原创 安装harfbuzz遇到的报错与解决方法

重新安装ggrastr,需要先安装harfbuzz。0)报错: ./autogen.sh 出现undefined symbol: Perl_xs_handshake解决方法: 重装 autoconf (automake, libtool)1)报错: 0)解决后, ./autogen.sh 又出现src/hb-ucdn/Makefile.am:3: error: Libtool library used but 'LIBTOOL' is undefinedsrc/hb-ucdn/M.

2020-10-30 18:36:19 2131

原创 Cannot build gcc-6.4.0: fenv_t has not been declared

solutionadd this option to./configure:--disable-libstdcxx-pch

2020-02-06 17:26:23 976

原创 st_tissue_recognition安装

1. openCV装4.0.1.openCV 4.0.1有个小布丁(https://github.com/opencv/opencv/pull/13969/files)要根据它修改下:modules/videoio/src/cap_v4l.cpp 的245行后加上:// https://github.com/opencv/opencv/issues/13929#ifndef V4L...

2019-03-23 23:14:55 459

原创 Error: modulecmd: malloc(): memory corruption: memory corruption

出现error:modulecmd: malloc(): memory corruption: memory corruption检查发现是modulecmd的版本不对在没问题的节点上是3.2.10,并且/usr/bin/modulecmd  --> /usr/local/Modules/3.2.10/bin/modulecmd而在有问题的节点上是3.2.7,/u...

2018-08-06 11:03:44 1084

原创 安装R包

报错:configure: error: Need GSL version >= 1.12ERROR: configuration failed for package ‘gsl’                                                                                                           ...

2018-06-20 09:11:44 817

原创 error related with autoconfig

Errors as follow:./configure: line 2140: AX_CHECK_ENABLE_DEBUG: command not foundchecking build system type... x86_64-unknown-linux-gnuchecking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu./configure:...

2018-04-11 17:08:41 764

原创 Can't connect to local MySQL server through socket ...

solution: service mysqld restart

2017-02-14 10:09:54 353

原创 vim笔记(1)

:mksession [file]:source session-file:wviminfo [file]:rviminfo [file]‘sessionoptions’选项和‘viminfo’选项set path=.,/usr/include,,/Share/BP/zhenglt/01.bin/vi/vim/src*.c:help starstar-wildcard

2016-12-21 20:57:43 342

原创 安装软件spams时报错error: template with C linkage

安装 spams 这个软件时报错In file included from /....../R/R-3.3.0/mybuild/lib64/R/include/R.h:43,                 from spams.cpp:1277:/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.6/../../../../include/c++/4.4.6/c

2016-07-28 22:12:52 1307

原创 网络带宽查看并找出占用大的进程

1)iftop -i eth1  找到网卡eth1上占带宽大的端口号;2)lsof -i :55775 找到监听端口号55775的进程3)/proc/21879/目录下是进程号为21879的进展的信息文件,如/proc/21879/cmdline是执行的命令行

2016-07-26 09:41:30 3127

原创 ssh自动认证

以下是步骤:在$HOME/.ssh下   ssh-keygen  -t rsa -f id_rsa   这将生成密钥对 id_rsa, id_rsa.pub将id_rsa.pub上传到集群$HOME/.ssh将id_rsa.pub的内容追加到authorized_keys    cat id_rsa.pub>> authorized_keys  

2016-07-26 08:18:17 392

原创 安装graphviz

git 最新版graphviz,autogen.sh报错configure.ac:33: error: possibly undefined macro: AC_SUBST      If this token and others are legitimate, please use m4_pattern_allow.      See the Autoconf document

2016-06-17 23:38:40 1119

原创 how to use cmake

1. cmake 的几个变量:CMAKE_INSTALL_PREFIX, CMAKE_CXX_FLAGS, CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS   /PROJ/GR/share/Software/cmake/current/bin/cmake ../ -DCMAKE_BUILD_TYPE=release -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../mybin/ -DCMAKE

2016-06-13 10:44:45 451

原创 how to compile neovim

how to compile neovim

2016-06-13 10:42:19 705

原创 python笔记

1. 列表、字典排序参考: https://wiki.python.org/moin/HowTo/Sorting

2015-11-30 10:25:34 380

原创 CFileDialog多选文件问题

        CFileDialog多选文件 受到m_ofn.nMaxFile(缓冲区的大小)和lpstrFile(存放文件名的缓冲区)的限制。默认情况下,CFileDialog的m_ofn.nMaxFile是260;开始改:TCHAR *pBuffer=new TCHAR[MAX_PATH*100]; m_ofn.lpstrFile=pBuffer; m_ofn.nMaxFile=MAX_PA

2008-01-27 20:41:00 1852

原创 声卡问题记

昨天第一次戴上耳机,自买这个新电脑以来。没想到竟播放不了!没有音频设备!!!马上再装一次声卡驱动程序。可我记得,电脑城装机回来又重装系统时把所有的驱动都装过了的呀。再装一次,都没用!设备管理器-声音、视频和游戏控制器里,都有传统音频驱动程序,音频编码解码器等。只能在网上搜下。搜了半天,无非是说装声卡驱动。可我装了N次,重启N次,还到BIOS里查看了,都不行。我确定不会是硬件方面的问题。因为从电脑城

2007-12-09 09:23:00 1303

原创 初次使用Gdi+

今天第一次使用Gdi  plus(VC6下),想显示一张图像。折腾 了半天,就是显示不出来。在网上找了一些相关帖子,难道Gdi+没初始化?不可能啊。仔细检查,没问题。图像有问题?也不可能吧……但还是试试换了张图像。竟然显示出来了!!真是图像问题?检查下。晕呢!原来是文件名搞错了!!文件名本来是要命名为“01.jpg”的。但一不小心命名为“01..jpg”了!而在程序中仍是“01.jpg”!!!

2007-12-04 11:43:00 484

空空如也

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