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RSS订阅原创 wsl2 Ubuntu20 安装vasp lammps
一、安装编译器sudo apt-get install -y gpg-agent wgetwget -qO - https://repositories.intel.com/graphics/intel-graphics.key | sudo apt-key add -sudo apt-add-repository 'deb [arch=amd64] https://repositories.intel.com/graphics/ubuntu focal main'sudo apt-get upd
2021-07-27 16:43:20
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原创 wsl2 远程桌面设置
效果图：来源：在Windows 10 WSL2中使用图形界面（GUI）安装好wsl Ubuntu20 后，采用默认软件安装源，很多时候改安装源后，安装容易出错。安装sudo apt-get purge xrdpsudo apt install -y xrdpsudo apt install -y xfce4sudo apt install -y xfce4-goodies优化sudo sed -i 's/max_bpp=32/#max_bpp=32\nmax_bpp=128/g
2021-07-27 10:04:50
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原创 让 wls 拥有可视化功能
我个人看来，wls的发展，让虚拟机渐渐失去价值。不过由于虚拟机拥有可视化的界面，让半吊子的使用者，用起来更舒适。这里给出一个方法，可以让wls具有可视化界面，单不包含桌面，当需要有图形输出时，才会调用，输出图像，比如可以用linux版本的pycharm。这里使用的是wls-2、Ubuntu 20.04.1 LTS。同理，其他版本也应该可行。首先下载xming 显示软件，装在win系统下。下载地址：https://sourceforge.net/projects/xming/国外下载地址，非常慢
2021-03-14 14:46:20
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原创 解决github.com 的响应时间过长
github.com 的响应时间过长又不想麻烦的去倒腾翻墙。这里给出一个解决办法。windows系统打开目录C:\Windows\System32\drivers\etc找到host文件，右键-属性，把只读取消勾选。利用一下任一网站查询github.com的IP地址站长之家 http://ip.tool.chinaz.com/github.com便民查询网 https://ip.51240.com/github.com__ip/IPAdress.com https://github.c
2021-03-06 11:15:40
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原创 MDAnalysis 安装及使用
MDAnalysis 不作介绍。上官网链接：https://www.mdanalysis.org/pages/installation_quick_start/conda 安装及使用安装前注意：matplotlib库版本问题，需要卸载重新安装低版本，否则有参数无法运行The ‘warn’ parameter of use() is deprecated since Matplotlib 3.1 and will be removed in 3.3. If any parameter follo
2021-03-01 17:38:01
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原创 conda 安装及使用
conda不愧为环境管理神器，不过多介绍。下载地址：https://www.anaconda.com/products/individual官网介绍：https://docs.conda.io/en/latest/win10安装过程：未截图，注意事项：选择all user添加环境变量 PYTH如果点错了，卸载重新安装即可。换源：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/问题：Solving environment: fa
2021-02-23 15:28:10
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原创 linux系统报错汇总
在运行packmol过程中突然报错，可能是前几天在安装其他软件是不小心动了什么东西：error while loading shared libraries: libgfortran.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory解决办法：sudo add-apt-repository ppa:jonathonf/gcc-7.1sudo apt-get updatesudo apt-get install gcc-.
2021-01-06 15:41:26
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原创 lammps 报错总结
ERROR on proc 0: Neighbor list overflow, boost neigh_modify one or page出现这个错误的直接原因是体系中某些原子的近邻数超过了2000个（除非你使用neigh_modify命令增加了允许的近邻数），而导致这个错误的可能因素有：初始结构有问题，比如原子分布过于密集。这种情况在一开始就会出错。截断半径设置的太大了，比如大于10A。可以通过命令neighbor，减小截断半径来解决。势参数设置有问题，这种情况一般是在运行一些步后才会出错。
2020-09-14 16:41:42
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8
原创 lammps学习记录（一）CG（粗粒化）模型建模
以下均在wsl 1-Ubuntu 20.04中操作一、建模部分软件安装及准备所用软件：moltemplate http://www.moltemplate.org/visual_examples.htmlpackmol http://sobereva.com/473安装软件：moltemplate：a. 安装pip https://linux.cn/article-10110-1.htmlpython2 –version # 查看python版本sudo apt install
2020-08-12 11:18:55
10205
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原创 vasp在win10子系统Ubuntu下的安装过程
子系统Ubuntu安装过程请参考lammps在win10子系统（Ubuntu）下的简易安装。一、安装Intel® Parallel Studio XE在安装Intel® Parallel Studio XE之前需要安装一系列依赖包：sudo apt-get install libgtk-3-0 libxss1 libnss3 libgtk2.0 libpango-1.0-0 libasoun...
2020-07-23 20:35:38
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原创 福昕阅读器 自定义注释快捷键
前言：作为一名研究僧，我选择国产福昕阅读器来作为我的PDF默认阅读器。单从功能实用性来说，对于天天阅读文献的我，有自定义快捷键的功能简直不要太完美。其他阅读器我就不作评价了，毕竟萝卜白菜各有所爱。最近新换了电脑，高高兴兴从福昕官网上下载了最新版的阅读器。发现在准备自定义快捷键的时候，注释哪里竟然没了 打字机、高亮、下划线、波浪线。这简直对我来说是一个晴天霹雳啊，谷歌、必应、百度到处寻求方法，发现并没有相关问题的存在。从改注册表，到安装老版本都试过了，还是不行。本来是这样的现在变成了这样：
2020-07-05 15:34:08
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原创 VASP学习之结构优化OPT计算
一、所需文件简单介绍VAPS所需四个文件POSCAR、POTCAR、KPOINTS、INCAR。1.POSCAR结构文件，一般由Materials Studio软件和VESTA生成。2.POTCAR赝势文件，可利用cat命令生成，也可利用vaspkit程序直接生成（需要编译设置）这里不详述。3.KPOINTSk点路径文件，可以利用vaspkit程序生成，也可查看文件自行设置，这里不详...
2020-04-29 19:56:39
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原创 在wsl2 Ubuntu上编译VASP
提要：在win 10 子系统Ubuntu上利用Intel Parallel Studio XE编译VASP。此教程理论上可适用于其他Ubuntu、Centos其他版本，并且已在虚拟机Cenos 8上安装成功。（注意改变安装命令）一、准备工作1. wsl2中Ubuntu安装见另一篇博文lammps在win10子系统（Ubuntu）下的简易安装，建议安装18.04版本，20.04版本未测试，...
2020-04-29 18:52:43
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原创 王者荣耀开黑语音突然没声音解决办法
本人使用的是小米8屏幕指纹版。其他机型建议尝试，由于网上一堆这个问题，解决办法都需要尝试。最近和朋友王者荣耀开黑时经常遇到，游戏玩着，突然我听不到朋友的声音了，朋友还能听到我的声音，这就很尴尬了，这还这么交流配(liao)合(sao)。每次这样只能老实的重启游戏，这样就很烦了。解决办法：1. 检查手机系统权限设置问题；2. 重新安装王者荣耀。都没有解决，我的解决办法来了：关闭省电模式...
2020-04-11 11:45:55
8435
原创 虚拟机VMware未能检索客户机IP解决办法
WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATION HAS CHANGED!首先确定虚拟机已连网，并且联网方式为桥接。在设置中再点击连接到SSH，将会出现一下报错。是因为IP被占用的原因，我们需要根据报错中的信息，在本地计算机目录找到Add correct host key in C:\\Users\\Jasonkun/.ssh/known_hosts这个文件，并且删除...
2020-04-09 21:13:16
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原创 lammps在win10子系统（Ubuntu）下的简易安装
我是一名初学者，有不对的地方，请大家多多指教。我看过很多安装教程，搜索引擎上面一搜索就让我们眼花缭乱。作为一位linux的小白，我们必须自立更生！其实大多数的教程都是把lammps官网的安装教程翻译成了中文，当然，作为一名小白，我也不会例外，毕竟还是要相信官方。凡是从简到繁，从易到难，这是目前最简单的安装方法（不包括编译，我还没学会编译!）。接下来是lammps官方提供的专用于win10子系...
2020-04-01 19:49:57
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原创 Materials Studio报错及解决方法（持续更新）
报错一：The folder could not be created:BSTR could not be converted to narrow CP_ACP string without use of surrogate pairs, in BSTRToString()解决方式：找出这个Project所在目录及所有子目录中是否有中文字符，改成英文名。PS：此问题可能由于微软账号名为中文导致...
2020-03-30 10:24:37
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原创 VASP报错及解决办法汇总（20.4.8已更新）
报错：VERY BAD NEWS! internal error in subroutine SGRCON: Found some non-integer element in rotation matrix*解决办法：*在INCAR中添加SYMPREC参数 ，改变体系的对称性精度。默认值为1E-5。值越大，精度越低。建议改为1E-4，也可改为1E-6。...
2020-03-28 19:25:55
25653
ovito手册与总结
2020-11-07
空空如也
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