Relion安装依赖cmake,fftw以及fltk
$ sudo apt install cmake build-essential mpi-default-bin mpi-default-dev
libfftw3-dev
如果在使用relion中,需要用到GPU进行加速的话,需要安装CUDA和cuDNN。
在编译relion时,gcc、g++和CUDA版本的选择也有讲究,
以Ubuntu16.04为例,系统安装后自带的gcc、g++版本是5.4.0,对应于CUDA8以后的版本。
可以通过下面的命令查看自己linux系统的gcc、g++版本
$ gcc --version
$ g++ --version
如果是CUDA7.5,那么gcc、g++的版本是4.9及之前版本
以gcc4.8为例,想要升级到gcc5.4,那么可以这样做
1.用apt安装gcc-5.4
$ sudo apt install gcc-5
2.查看默认的gcc版本
$ gcc --version
3.查看当前已有的gcc版本, 确认下刚