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2018-12-17 17:13:30 2017

原创 Ubuntu18.04下Bio3D2.3的基本安装

官方网站点这里 官方拥有比较完善的英文安装教程 这里我记录以下我的安装过程   1.安装R和前置 Bio3D是R程序包,安装Bio3D需要R和一些前置的程序包 根据官方文档,运用如下命令 apt-get install r-base-core netcdf-bin libnetcdf-dev libxml2-dev \ libcurl3-dev se...

2018-09-01 18:18:33 1036

原创 JGromacs 在 ubuntu18.04 的安装

JGromacs官方网站:http://sbcb.bioch.ox.ac.uk/jgromacs/ JGromacs是一个Java库,旨在促进分子动力学(MD)模拟的跨平台分析应用程序的开发。该软件包包含由GROMACS(GROningen MAchine for Chemical Simulations)应用的文件格式解析器,这是最广泛使用的MD仿真软件包之一。JGromacs提供多级面向对象...

2018-09-01 00:06:08 743

原创 MD-TASK在ubuntu 18.04上的安装

官方手册点这里     一.安装运行环境 1.安装软件依赖 sudo apt-get install virtualenvwrapper python-dev libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran libpng-dev libfreetype6-dev python-tk r-base 在ubuntu16.04 下l...

2018-08-24 19:56:17 514

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