igraph 来把牛郎织女牵
igraph 包是可视化网络关系图的强大软件,有 python
、C语言
和 R
版本的。
安装和加载:
## Download and install the package
install.packages("igraph")
## Load package
library(igraph)
参数很多很多...。需要改哪个再去查阅会方便一些。简单画个图,可视化基因间的相互关系。
创建数据:
# 构建数据
da <- data.frame(from = rep('gene1',16),to = paste('gene',LETTERS[1:16],sep = ''),
value = seq(-2,2,length.out = 16))
da
from to value
1 gene1 geneA -2.0000000
2 gene1 geneB -1.7333333
3 gene