R语言画森林图展示Logistic回归分析的结果

最新推荐文章于 2024-08-07 02:09:39 发布
最新推荐文章于 2024-08-07 02:09:39 发布
阅读量3.9k 收藏 15
点赞数 1
CC 4.0 BY-SA版权
分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/122762154
本文介绍了如何用R语言进行Logistic回归分析，并利用forestplot包生成森林图来展示分析结果，包括系数、95%置信区间和P值。在数据准备过程中，可能需要手动添加信息，读者被邀请分享简化步骤的方法。

第一步是准备数据

森林图展示的数据通常是Logistic回归分析的系数和95%置信区间以及显著性检验的P值，那么如何获得这些结果呢？

logistic回归分析的代码

data(Affairs,package = "AER")
df<-Affairs
df$ynaffairs<-ifelse(df$affairs>0,1,0)
df$ynaffairs<-factor(df$ynaffairs,
                     levels = c(0,1),
                     labels = c("No","Yes"))
fit.full<-glm(ynaffairs~gender+age+yearsmarried+
                children+religiousness+education+occupation+rating,
&
了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
R语言Logistic回归模型亚组分析森林图(forest plot)绘制
statistics+insight+vista+power
03-24 1516
R语言Logistic回归模型亚组分析森林图(forest plot)绘制
R语言使用glm函数构建logistic回归模型，使用forestmodel包的forest_model函数可视化逻辑回归模型对应的森林图
data+scenario+science+insight
08-09 2417
R语言使用glm函数构建logistic回归模型，使用forestmodel包的forest_model函数可视化逻辑回归模型对应的森林图
r语言逻辑回归森林图绘制
weixin_36887048的博客
08-07 671
R语言中逻辑回归的森林图绘制 逻辑回归是一种广泛应用于统计学和机器学习中的分类模型工具，主要用于二元分类问题。通过逻辑回归，我们可以了解输入变量（特征）如何影响结果变量（响应）。为了更好地可视化逻辑回归的结果，森林图（Forest Plot）是一种理想的展示形式。 本文将介绍如何在R语言中绘制逻辑回归的森林图，并包含必要的...
使用R语言绘制Logistic回归模型的亚组分析森林图
PixelNinja的博客
08-24 1838
亚组分析是一种常用的统计方法，用于探索不同亚组之间的差异，并确定是否存在某些变量对结果的调节作用。在本文中，我们将使用R语言来绘制Logistic回归模型的亚组分析森林图。在该图中，每个亚组都用一个点表示，点的位置表示亚组的均值，而线段表示亚组的置信区间。垂直参考线用于表示效应值为0的点，帮助我们判断亚组之间的差异。希望本文对你有所帮助，让你能够使用R语言绘制Logistic回归模型的亚组分析森林图。是一个二分类的变量，我们希望在亚组分析中探索它与响应变量之间的关系。函数来计算每个亚组的均值，并使用。
使用R语言绘制森林图展示Logistic回归分析结果
2301_79330513的博客
08-31 1566
而森林图是一种直观且具有可视化效果的图表形式，可以用于展示Logistic回归模型的结果。在本文中，我们将使用R语言来绘制森林图，以展示Logistic回归的分析结果。包，我们可以方便地绘制森林图来展示Logistic回归分析的结果。通过运行上述代码，我们可以得到一张漂亮的森林图，其中展示了Logistic回归模型的系数估计值及其置信区间。森林图可以直观地显示每个变量对响应变量的影响程度，并提供了关于系数估计值的统计显著性信息。得到模型的系数估计值后，我们可以使用这些值来绘制森林图。接下来，我们可以使用。
R语言广义线性模型Logistic回归模型亚组分析及森林图绘制
data+scenario+science+insight
08-10 7350
R语言广义线性模型Logistic回归模型亚组分析及森林图绘制 #Logistic回归案例 6 亚组分析森林图 library(forestplot) rs_forest <- read.csv('rs_forest.csv',header = FALSE) # 读入数据的时候大家一定要把header设置成FALSE，保证第一行不被当作列名称。 # tiff('Figure 1.tiff',height = 1600,width = 2400,res= 300) forestplot(l
R语言广义线性模型：Logistic回归模型的亚组分析及森林图绘制
laugh666的博客
08-11 3868
亚组分析则是在Logistic回归模型基础上进行的一种统计方法，用于探究某个特定因素对不同亚组之间的影响是否存在差异。本文将介绍如何使用R语言进行Logistic回归模型的亚组分析，并使用森林图来可视化结果。通过以上步骤，我们成功完成了R语言广义线性模型Logistic回归模型的亚组分析，并使用森林图进行了结果的可视化。接下来，我们将使用一个示例数据集来演示Logistic回归模型的亚组分析。函数将年龄分为不同的亚组。这段代码将根据年龄的亚组计算每个亚组内发生心脏病事件的概率均值，并使用森林图进行可视化。
广义线性模型——Logistic回归模型简单绘图（2）
m0_61206827的博客
04-10 4687
使用R语言绘制超级实用的logistic回归模型图。 library(AER)# 数据 library(ggplot2)# 作图 library(ggsci)# 修饰图片风格 没有上述安装包的，自己安装一下。 data(Affairs,package ="AER")#提取使用的数据集 Affairs$chugui[Affairs$affairs>0]<-1#将出轨次数大于零的结果定为二分类变量（1：出轨） Affairs$chugui[Affairs$affairs==0]&lt...
【SAS】逻辑斯回归画图 Logistic Procedure（不定期更新）
大头山猪的窝
03-25 3545
目录请看下面[↓_↓]EFFECTPLOT编程代码FIT示例SLICEFIT示例文章来源 EFFECTPLOT 编程代码 EFFECTPLOT < 绘图类型 <(具体设置)>> </ 添加选项>; 绘图类型 类型说明 具体设置 设置类型 BOX 绘制不同分类变量的盒图 PLOTBY= 变量或CLASS效应 并通过预估值连接成线 X= C...
Logistic回归 R语言
weixin_64589302的博客
09-01 5039
logisit回归 r语言 卡方分布检验 ROC曲线
R语言中Logistic回归
热门推荐
muli
05-31 2万+
Logistic回归 # 设置工作空间 # 把“数据及程序”文件夹拷贝到F盘下，再用setwd设置工作空间 setwd(&amp;quot;E:\\R_workspace\\R语言数据分析与挖掘实战\\chp5&amp;quot;) # 读入数据 Data &amp;amp;lt;- read.csv(&amp;quot;./data/bankloan.csv&amp;quot;)[2:701, ] View(Data) # 查看数据框中 完整的记录数 su
画logistic_【R语言】logistic回归+nomogram绘制+c-index+校正曲线
weixin_35801916的博客
01-09 7688
大家新年快乐！！！！我难得元旦有个假期，还来给各位录视频，各位不觉得感动吗。。。。。。知乎视频​www.zhihu.com这期视频主要是我之前帮助的那个同门非要我把上次给他做的回归的C-index弄出来，我跟他解释了说对现在做的这个二元logistic回归模型，我给你画的ROC曲线的曲线下面积AUC值的大小就可以评价了。然鹅他不听然鹅他之前请我吃了顿大餐所以我还是给他把C-index弄出来了顺带还...
R语言进行Logistic回归分析
weixin_48521526的博客
09-28 4352
Logistic回归分析探索某结局变量的危险因素或保护因素。
logistic回归列线图（nomogram）的多种绘制方法
医学和生信笔记的博客
08-30 2万+
获取更多R语言知识，请关注公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 列线图（Alignment Diagram），又称诺莫图（Nomogram图），用来把多因素回归分析结果（logistic回归和cox回归）用图形方式表现出来，将多个预测指标进行整合，然后采用带有刻度的线段，按照一定的比例绘制在同一平面上，从而用以表达预测模型中各个变量之间的相互关系。 根据
R语言可视化：森林图绘制
Mrrunsen的博客
01-28 3364
森林图绘制 清除当前环境中的变量 rm(list=ls()) 设置工作目录 setwd("C:/Users/Dell/Desktop/R_Plots/39forest/") 使用survminer包中的ggforest函数绘制森林图 require("survival") ## Loading required package: survival library(survminer) ## Warning: package 'survminer' was built under R v
语言中要输出表格_R语言绘制 医学分析中常用的 森林图 forestplot（方法1）
weixin_42531588的博客
01-12 2516
对于统计分析的结果，表格展示必不可少，但如果在必要的时候可以加上可视化的展示，往往会更直观的展现结果，对于结果的阅读者是友好的。森林图就是统计结果可视化的一种，抛开复杂的先不提，常见的logistic回归、cox回归结果也常常可以用森林图来直观呈现。ggplot2相较于普通的R包，更像是一个绘图生态系统，功能覆盖非常全面。在做cox回归的时候，survminer包的ggforest可以非...
R-forestplot包| HR结果绘制森林图
weixin_39556044的博客
10-14 1万+
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。 上一篇简单的介绍了COX生存分析结果绘制森林图Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化，本文将介绍根据数据集合的基本信息以及点估计值（置信区间区间）的结果直接绘制森...
R语言logistic回归的细节解读
医学和生信笔记的博客
11-02 1万+
完美观看体验请至公众号查看本文。，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。
r语言绘制logistic回归森林图
最新发布
07-22
使用R语言绘制Logistic回归模型的森林图是一种有效展示回归分析结果的方法，尤其是对于展示变量的影响程度和显著性具有重要意义。以下是绘制森林图的详细步骤和方法： ### 数据准备与Logistic回归模型构建 首先，需要准备数据并构建Logistic回归模型。以`AER`包中的`Affairs`数据集为例，展示如何进行数据预处理和模型构建： ```r # 加载必要的包和数据 library(AER) # 加载数据 data(Affairs) df <- Affairs # 创建二分类变量ynaffairs df$ynaffairs <- ifelse(df$affairs > 0, 1, 0) df$ynaffairs <- factor(df$ynaffairs, levels = c(0, 1), labels = c("No", "Yes")) # 构建Logistic回归模型 fit.full <- glm(ynaffairs ~ gender + age + yearsmarried + children + religiousness + education + occupation + rating, data = df, family = binomial()) ``` ### 提取模型结果 接下来，提取模型结果以便后续绘制森林图： ```r # 提取模型结果 fit.result <- summary(fit.full) # 提取系数 df1 <- fit.result$coefficients # 计算置信区间 df2 <- confint(fit.full) # 合并系数和置信区间 df3 <- cbind(df1, df2) # 数据整理 df4 <- data.frame(df3[-1, c(1, 4, 5, 6)]) df4$Var <- rownames(df4) colnames(df4) <- c("OR", "Pvalue", "OR_1", "OR_2", "Var") df5 <- df4[, c(5, 1, 2, 3, 4)] df5$OR_mean <- df5$OR df5$OR <- paste0(round(df5$OR, 2), "(", round(df5$OR_1, 2), "~", round(df5$OR_2, 2), ")") df5$Pvalue <- round(df5$Pvalue, 3) # 保存结果 write.csv(df5, file = "forestplot_example.csv", quote = FALSE, row.names = FALSE) ``` ### 绘制森林图 使用`forestplot`包绘制森林图： ```r library(forestplot) # 读取数据 rs_forest <- read.csv('forestplot_example.csv', header = FALSE) # 绘制森林图 forestplot(labeltext = as.matrix(rs_forest[, 1:3]), mean = rs_forest$V4, lower = rs_forest$V5, upper = rs_forest$V6, is.summary = c(TRUE, TRUE, TRUE, FALSE, FALSE, TRUE, FALSE, FALSE, TRUE, FALSE, FALSE), zero = 1, boxsize = 0.4, lineheight = unit(10, 'mm'), colgap = unit(3, 'mm'), lwd.zero = 2, lwd.ci = 1.5, col = fpColors(box = '#458B00', summary = "#8B008B", lines = 'black', zero = '#7AC5CD'), xlab = "The estimates", graph.pos = 3) ``` ### 相关问题 1. 如何解释Logistic回归中的OR值？ 2. `forestplot`包中的参数`is.summary`的作用是什么？ 3. 如何调整森林图的图形颜色和样式？ 4. 在进行亚组分析时，如何处理不同亚组的数据？ 5. 如何在R中导出森林图为图片文件？ 以上步骤展示了如何使用R语言进行Logistic回归分析并绘制森林图。每一步都至关重要，确保最终能够生成清晰且具有信息量的图表[^3]。
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

Mrrunsen

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值