【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

在使用R的clusterProfiler包进行GO富集分析时,遇到气泡图和柱形图中标签重叠的问题。该问题与R版本有关,特别是在R 4.1.2版本中。通过研究发现,`dotplot`函数新增了`label_format`参数,默认值为30,导致长标签被折叠。通过调整`label_format`参数为100,可以使标签完整显示在同一行,从而改善图表的可读性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候,发现GO条目的名字都重叠在一起了。

气泡图

柱形图

这个图别说美观了,简直不忍直视。经过小编的认真研究,发现跟R版本有关。前面小编给大家展示的基本都是R 3.6.3做出来的图。很多粉丝可能用的都是最新版本的R 4.1.2。

我们知道R的版本在不停的更新,相应的R包也在不停的更新。小编把绘制气泡图和柱形图相关的函数拿出来认真的研究了一下,终于发现的症结所在。

dotplot这个函数,多了个label_format参数

我们来看看这个参数究竟是干什么用的,看看

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