如何计算 R 中的 Phi 系数

最新推荐文章于 2023-12-19 16:57:29 发布
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分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言 开发语言
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Phi 系数是衡量二元变量间关联的指标，可在R的psych包中使用phi()函数计算。值范围从-1到1，越远离零表示关系越强。类似于Pearson相关， Phi 系数可用于分析两个变量是否存在系统性的关联。

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Phi 系数（有时称为均方列联系 数）是衡量两个二元变量之间关联的指标。

对于两个随机变量 x 和 y的给定 2×2 表：

在这里插入图片描述
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#create 2x2 table
data = matrix(c(4, 8, 9, 4), nrow =
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如何在R语言中计算Phi系数
PixelLoom的博客
08-29 761
在上述代码中，contingencyMatrix函数将数据集中的两个变量创建为列联表。在这里，我们提取了第2行第1列的元素，即Phi系数。它适用于两个二元变量同时取两个值的情况，并可以衡量它们之间的相关程度。在R语言中，我们可以使用以下步骤计算Phi系数。在R中，我们可以使用contingencyMatrix函数从数据集中创建列联表，然后使用rcorr函数计算Phi系数。运行上述代码，你将会得到计算得到的Phi系数作为输出结果。最后，我们可以将计算得到的Phi系数打印出来。步骤2：计算Phi系数。
R语言使用vcd包的assocstats函数计算两个分类变量的相关性的强弱、计算列联表的Phi系数、列联系数和Cramer’s V系数
statistics+insight+vista+power
04-30 1588
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相关性分析
LSEC小陆的博客
08-16 4775
在概率论和统计学中，相关（Correlation，或称相关系数或关联系数），显示两个随机变量之间线性关系的强度和方向。在统计学中，相关的意义是用来衡量两个变量相对于其相互独立的距离。在这个广义的定义下，有许多根据数据特点而定义的用来衡量数据相关的系数。 对于不同测量尺度的变数，有不同的相关系数可用： Pearson相关系数（Pearson’s r）：衡量两个等距尺度或等比尺度变数之相关性。是最常见的
r语言相关性分析_R语言数据分析系列相关性
m0_46047369的博客
12-19 5219
以上只是提到如何进行其中两种基因的相关性分析，但如果我们想探索PTEN与其他基因之间的相关性分析，就要改代码进行进一步的计算，我们想到，R语言中可以进行循环计算。如果我们对其中某两个变量的相关性感兴趣，就可以利用先前讲到的ggplot2，如果我们想探索所有基因的相关性，那我们就可以利用corrplot或者PerformanceAnalytics了。上图中，我们可以看到两种基因的表达情况之间的相关性，随着PTEN的表达升高，Gli的表达也同样呈上升趋势，因此两者具有正相关性。这样的图形可能会更加美观一点。
R计算两列数据的相关系数_【R语言】相关性分析、相关系数的显著性检验及可视化...
weixin_39895283的博客
11-21 7183
本篇文章介绍基于R语言的相关性分析、相关系数的显著性检验及可视化，该教程为个人笔记，大家也可参考学习，不足之处也欢迎大家批评指正！相关性分析用于评估两个或多个变量之间的关联，能通过定量指标描述变量之间的强弱、直接或间接联系。相关系数是对变量之间的相关程度的定量描述，相关系数值介于-1~1之间，越接近0相关性越低，越接近-1或1相关性越高；正负号表明相关方向，正号为正相关、负号为负相关。当...
R语言分类变量关联度分析（Measures of association）、使用vcd包的assocstats函数对分类变量进行关联度分析、并输出phi系数、列联表系数、以及Cramer’s V系数
data+scenario+science+insight
10-13 585
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R 语言相关性的度量
Mrrunsen的博客
12-18 669
显著性检验评估了是否存在充分的证据以拒绝变量间相互独立的原假设。如果可 以拒绝原假设，那么你的兴趣就会自然而然地转向用以衡量相关性强弱的相关性度量。vcd包中 的assocstats()函数可以用来计算二维列联表的phi系数、列联系数和Cramer’s V系数 > library(vcd) > mytable <- xtabs(~Treatment+Improved, data=Arthritis)` > assocstats(mytable) 总体来说，较大的值意味着较强的相关
二分类变量相关性分析spss_SPSS分析技术：两个定类变量的相关系数(1)
weixin_39594080的博客
12-30 1万+
基础准备前面草堂君给大家详细介绍了各种相关系数种类，不同的相关系数用来表示不同类型变量之间的相关关系强弱，大家可以点击下方文章链接回顾：统计理论深度阅读：相关系数家谱(第一部)统计理论深度阅读：相关系数家谱(第二部)接下来草堂君将给大家详细介绍不同相关系数的实际应用场景以及如何使用统计软件进行计算。知其然知其所以然，才能融会贯通和触类旁通。相关分析的作用开始正式文章前，草堂君先帮大家回顾...
马修斯相关系数（Matthews correlation coefficient）
Winnycatty的博客
10-08 3万+
马修斯相关系数是在使用机器学习作为二进制（2类）的质量的度量的分类，通过生物化学引入布赖恩W. 马修斯在1975年 它考虑到真和假阳性和假阴性，并且通常是被视为一种平衡的措施，即使这些班级的规模大小不同也可以使用。 MC实质上是观察到的和预测的二元分类之间的相关系数; 它返回介于-1和+1之间的值。系数+1表示完美预测，0表示不比随机预测好，-1表示预测和观察之间的完全不一致。统计数据也称为ph...
R语言-2*2卡方检验与效应量
Yang_psy的博客
03-08 2999
R语言2*2基础卡方检验及效应量。
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weixin_39530288的博客
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今天这一期的内容主要是如何在R中进行数据之间的相关性分析，其实这一部分的内容和独立性检验的有点类似，大家可以对比着学习！1. 相关性度量的assocstats()函数在这里，我想和大家简单介绍一下如何度量列联表里分类变量之间的相关性。我们可以使用“vcd”包里的assocstats(x) 函数，这里x是一个列联表，示例如下：A <- c(rep("male",15),rep("female"...
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相关系数种类   （一） Pearson积差相关（K. Pearson product-moment correlation ；r） 1. X变数：等距、比率变量（连续变量） 2. Y变数：等距、比率变量（连续变量） 3. 公式： 4. 特性：数值稳定、标准误小。 5. 例：工作时数与收入的关系。 （二） Spearman等级相关（Spear
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EchoCaiCai的专栏
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Part1 相关统计量说明 峰度系数Coefficientof kurtosis http://baike.baidu.com/link?url=gS_sgtNYSRdjLnadNWDDa357DIzJma-tdheAx5eKp0WzTvuH_PYg8hnMNIiP4-DRmewtftVQXXUbtIYzvz4bTq 峰度系数（Kurtosis）用来度量数据在中心聚集程度。在正态分布情况下，
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很多时候我们做数据分析就是为了分析出每个变量之间的关系，并且做出相应的指导方向，落实到执行，有哪些分析方法了？ 一、描述性统计分析 1）方法云集 用summary()函数来获取描述性统计量 apply()函数或sapply()函数计算所选择的任意描述性统计量 函数fivenum()可返回图基五数总括（Tukey’s five-number summary，即最小值、下四分位数、中位数、上...
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红豆和绿豆的博客
02-20 1万+
（1）描述性分析 （2）频数表和列联表 （3）相关系数和协方差 （4）t检验 （5）非参数统计 具体的实现以上各个数据项 （1）描述性分析 若干用户贡献包都提供了计算描述性统计量的函数，其中包括Hmisc、pastecs psych。 summary（） apply(x,1/2,FUN) sapply(x,FUN,Options) FUN=sum/mean,sd,var,m
phi如何计算，加在这个代码里
最新发布
11-03
在R语言中，要计算两个变量之间的关联度（比如二分类变量），可以使用 Phi 指数（也称为Cramér's V）。以下是计算过程的一个完整示例[^1]: 1. 首先，创建一个包含两个分类变量的数据集，例如`x`和`y`： ```r x <- c(0, 1, 0, 1, 0) y <- c(0, 0, 1, 1, 1) dataset <- data.frame(x, y) ``` 2. 导入`psych`包，它包含了计算 Phi 的功能： ```r library(psych) ``` 3. 使用`contingencyMatrix()`函数创建列联表（cross-tabulation）： ```r contingency <- contingencyMatrix(dataset$x, dataset$y) ``` 4. 调用`rcorr()`函数计算相关性矩阵，其中包括 Phi 指数： ```r phi_coefficient <- rcorr(contingency)$r[2] # 注意这里索引为2是因为我们需要的是 Phi 指数，不是皮尔逊相关系数 ``` 5. 最后，打印出计算得到的 Phi 值： ```r print(phi_coefficient) ``` 这个代码片段将会输出 Phi 指数，表示变量 `x` 和 `y` 之间关联性的强度。
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