国科大实用生物信息学期末复习

期末考题题型老师会说（以大象为例）

考题是 选择、列举、简答、实验设计

23年选择题有10道，列举题3道，简答题2道，实验设计题是给4道自选一道题回答

接下来敲黑板：

复习可以买东区打印店的资料，因为老师讲课ppt基本上都是英文的，打印店的资料相当于把英文翻译了一下，对于英语不那么好的同学可以买来看看，ppt过一遍之后基本上列举题三道题都能写出来了，23年列举题（3个题 不难）：其中有一个“基因数据存储的常用格式两个

另外：

建议大家重点看一下DNA测序、RNA测序以及转录组测序的内容，了解一下具体的测序流程，这个对以后的研究也是挺有用的，因为我自己是非生物专业转过来的，所以生物大佬可以忽略这一条！！

简答题 隐约记得是：

双端序列对接是指库长低于二倍 reads 长度的 paired-end reads 拼合成一条序列，请 简要回答为何需要对 paired-end reads 做对接？如何对 paired-end reads 做对接？对接 过程中可能产生什么样的问题？

23年没有考计算题，但是22年听师姐说考了UPGMA，所以还是要看看的！！！

实验设计：四选一或者五选一，每个题给的例子不一样，有真核生物的，微生物的等等，但是问题差不多，基本是要：阐述采样方面需要进行哪些方面的注意，可以做哪些方面的研究， 进行何种测序，在研究过程中需要用的哪些方面的生物信息学数据分析。

祝学弟学妹考出成绩，别忘了给学姐点点👍喔！！！

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具体重点内容及答案参考：

1. 双端序列对接是指库长低于二倍 reads 长度的 paired-end reads 拼合成一条序列，请

简要回答为何需要对 paired-end reads 做对接？如何对 paired-end reads 做对接？对接

过程中可能产生什么样的问题？（18 分）

为何需要对 paired-end reads 做对接？

• 提高序列覆盖度：通过对接，可以将两个较短的 reads 拼合成一个更长的序列，从而提高对基因组或转录组的覆盖度。
• 提升序列连续性：对接可以帮助重建原始的 DNA 或 RNA 分子，尤其是在存在重复序列或复杂区域时。
• 增强数据质量和精