Ubuntu server 18.04 anaconda 安装+配置系统环境变量+创建环境

虽然网上也有挺多安装anaconda的教程，但是大多用的是ubuntu 桌面版本。在服务器上安装需求不一样，比如因为要很多账户都要用于是就不能安装在默认路径下，所以安装的过程有些差异。鼓捣了半天，然后写了这篇博客。
我的第一篇博客。废话可能有点多，排版可能有点丑，内容可能有点错

刚接手管理一台服务器，实验室用的。由于使用的人很多，大家的对各种软件及其版本的需求不一样，安装anaconda可以很方便地管理环境变量。服务器使用的操作系统是Ubuntu server 18.04.1。

PS：接下来的操作都是在xShell上，用命令行完成的。
建议上手之前通读一遍全文
实践表明，本教程同样适用于ubuntu server 16.04

安装

到官网上下载安装包，python 3.x还是python 2.x的自己选择。在下载按钮上右键，复制链接地址。

然后用wget下载。下载路径无所谓，安装完后就可以把安装包删掉了。代码例如

wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh

下载好了后，启动安装程序。代码为bash 安装程序名字。例如

bash Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh

接下来就进入安装界面了。下图为欢迎界面，按回车（ENTER）

然后是许可协议，一直按回车，或者按q直接跳过

协议看完了问你是否同意。同意（yes）

然后最重要的一步来了——安装路径的选择。默认的安装路径是当前操作用户的个人文件夹。因为我是用root进行操作，而root的个人文件夹是根目录下的/root，所以这里的默认路径是/root/anaconda3。 因为服务器是很多人都要用的，所以建议不要安装到某个用户的个人文件夹里面。可以安装到根目录下的/opt。（/opt的用途可以参见这篇博客）。

当然，也可以安装到默认路径下后，把整个文件夹挪到/opt。但是你需要修改一大堆配置文件中的路径，因为按照默认路径安装，安装器会在配置文件中需要的地方填上默认路径。所以安装好后最好不要随便挪动整个anaconda3文件夹。（现在回顾一下当初写的段话，不知道是不是有“一大堆配置文件”）

所以，安装路径我选择/opt/anaconda3

如果你下载的安装包是python 2.x的，那你路径中应该是anaconda2而不是anaconda3

接下来就是一大段自动执行的安装代码。
接着让你选择是否要让安装器修改你个人的bash的环境变量文件。这个选择yesorno都无所谓，因为待会儿要修改系统的环境变量来让所有用户都可以用。

安装结束！
但是安装器还会问你想不想安装VSCode，我拒接了ta！

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配置系统环境变量

为了让所有用户在登录以后可以直接使用anaconda，需要将anaconda的路径添加到系统环境变中。
编辑系统环境变量文件/etc/bash.bashrc

也有可能文件名为/etc/bashrc。
此外，你也可以选择编辑另一个系统环境变量文件/etc/profile。如果你选择这个文件的话，切换了账号，需要重新注入环境变量，会比较麻烦！
各种系统环境变量文件的加载顺序如下，可以参考这个视频

在最后一行加入如下代码。其中/opt/anaconda3是你的安装路径

export PATH=/opt/anaconda3/bin:$PATH

如果你在上面安装的时候，在“让你选择是否要让安装器修改你个人的bash的环境变量文件”选择了yes，那你可以把~/.bashrc中关于anaconda的一大段代码都复制出来，添加到环境变量文件中。
我也不知道那一大段代码跟上面那一行export ...有什么区别:)

保存退出，重新注入环境变量

source /etc/bash.bashrc

注意：

1. 注入变量的时候最好不要用fish等其他shell，而是用默认的shell。如果你看不懂前面那句话的话就不要管它啦

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更换镜像源

我一般都使用清华镜像源。建议进入它们的官网查看最新的更换镜像源命令，因为可能会有变动。注意：只能修改用户自己的镜像源，即便root用户也是如此（全局的方法我目前还不知道）
为了方便大家，我搬运过来了：编辑~/.condarc文件，内容替换为如下

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
channel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

运行 命令conda clean -i 清除索引缓存，保证用的是镜像站提供的索引。
运行命令conda info查看是否更换成功

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创建公用环境

创建公用环境的时候要把路径选择到安装路径/opt下面，使用root账号

#在/opt/anaconda3/envs/里创建一个名为py27的环境，其使用的python版本为2.7
conda create -p /opt/anaconda3/envs/py27 python=2.7

原因如下：添加的环境要求所有人都可以用。但是如果用conda create -n python27 python=2.7这个命令将会在用户的个人文件加下创建环境（root账户也算是“个人账户”），导致其他人不可以用这个环境。比如下图，我用xzf的账号创建了一个叫python36的环境，用test账号就不能检测到那个环境（但是root好像可以检测到）。

如此做的优点：

1. 普通账户只能在自己的个人文件下创建环境，不能在/opt/anaconda3/envs/里创建
2. 普通账户可以使用创建在/opt/anaconda3/envs/里的所有环境，但是不能对其进行修改（安装or删除软件等）

问题

1. 若普通用户安装软件的时候发现搜不到一些版本的软件，但是root下可以，例如
   
   这个是因为前面在更改镜像源的时候只改了操作者（也就是root）的镜像源，其他用户需要自己手动修改，方法一样。

作者：Zephyr
最后修改于：2020年7月9日