Cell | 融合影像组学与microRNA构建预测模型,机器学习助力个性化治疗

Cell Reports Medicine近期的研究结合microRNA与影像组学,提出一种面向患者术后腹膜后肿块组织学性质的分类算法。该研究将研究重点放在解决单一方法缺陷的思路极具参考价值。

引言

过度化疗是非精原细胞肿瘤患者常见的问题,特别是在接受过铂类化疗后的残余腹膜后肿块患者中。过度化疗不仅增加了患者的治疗负担,还可能引发严重的副作用。通过预测模型区分坏死/纤维化组织、活性生殖细胞肿瘤以及畸胎瘤,对于降低患者的治疗风险至关重要。

通过影像组学将医学影像转化为高维数据,能够提高机器学习算法的预测准确性。然而,由于影像组学可解释性较差且在畸胎瘤、活性生殖细胞肿瘤区分任务中存在局限性,使得单凭影像组学难以实现精准的预测。

Cell Reports Medicine近期的研究结合microRNA与影像组学进行综合诊断,显著提升了肿块成分的区分能力,对辅助制定个性化治疗方案起到积极的促进作用。

数据及方法

该研究纳入了2014年9月至2022年8月期间的105名患者进行预测模型的开发,其中75名患者作为训练集,30名患者作为验证集。同时,该研究纳入了2022年10月至2024年6月期间34名患者作为测试集。该研究首先基于多种机器学习算法构建影像组学评分,然后利用Logistic回归构建影像组学-miRNA的融合模型,最后通过统计分析方法对预测模型的效果进行评估。

影像组学模型构建主要包括ROI勾画、特征工程和机器学习模型构建三个关键环节。在ROI勾画环节中,该研究通过经验丰富的放射科医生手动选择CT影像中最具代表性的肿瘤切面,实现对患者残余后腹膜肿块精确的三维区域勾画。在特征工程环节中,该研究使用Pyradiomics提取了包括一阶统计特征、纹理特征在内的1130个特征,并通过一系列数据预处理和筛选步骤(如一致性检验、相关性分析、LASSO回归等)进一步筛选出与组织病理结果相关的特征。在机器学习模型构建环节中,该研究选定了六种机器学习算法,通过贝叶斯优化、网格搜索等调参手段构建了预测模型。

该研究采用晚期融合方法构建融合模型。该研究基于影像组学模型的预测概率与miRNA数据,使用逻辑回归方法建立新的模型。该模型综合了影像组学与miRNA信息的优势,能够有效地区分患者术后腹膜后肿块的组织学性质。

该研究采用多种指标评估模型效果,包括ROC曲线、校准曲线、决策曲线、DeLong检验、Brier得分以及AIC等。

总结

该研究针对单一方法的局限性,融合影像组学与血清microRNA提出了一种面向患者术后腹膜后肿块组织学性质的分类算法。该研究的参考价值在于其针对影像组学单一方法的缺陷,提出结合microRNA构建融合模型的解决方案。参照这种思路,各位读者在自己的研究中并不需要追求建模方法的新颖性,大可以将重点放在挖掘单一方法的局限性。针对这种局限性,即便是通过常规的、简单的方法融合多组学特征,依旧可以发表高水平研究成果。

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