morphology.remove_small_objects输入数组的数据类型对结果的影响

Radio_PaPa

已于 2023-01-09 14:36:18 修改

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文章标签： python 图像处理

于 2023-01-09 14:04:58 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/Radio_PaPa/article/details/128604436

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当ar数据类型为int时：

当ar数据类型为bool时：

总结：

skimage中morphology.remove_small_objects 用以去除小于指定size的小物体（Remove objects smaller than the specified size）.

skimage.morphology.remove_small_objects(ar, min_size=64, connectivity=1, in_place=False, *, out=None)

官方文档指出：

Expects ar to be an array with labeled objects, and removes objects smaller than min_size. If ar is bool, the image is first labeled. This leads to potentially different behavior for bool and 0-and-1 arrays.

ar可以是int型，也可以是bool型。但是经本人试验，当ar分别为这两种数据类型时，结果差异还是比较明显的。

当ar数据类型为int时：

创建img_1和img_2两个数组。数组中0为背景，非0元素为objects。img_1中包含背景0和object 67；img_2中包含背景0、object67、object1、object2。使用morphology.remove_small_objects分别处理img_1和img_2，以除去size小于3的objects。

import numpy as np
from skimage import morphology
img_1 = np.array([
            [0,0,0,67,67,67],
            [0,67,0,67,0,67],
            [0,0,0,0,67,0],
            [0,67,67,0,0,67],
            ])
img_2 = np.array([
            [0,0,0,67,67,67],
            [0,1,0,67,0,67],
            [0,0,0,0,67,0],
            [0,67,2,0,0,67],
            ])
img_1_small_removed = morphology.remove_small_objects(img_1,min_size=3,connectivity=1)
print('img_1_small_removed =')
print(img_1_small_removed)
img_2_small_removed = morphology.remove_small_objects(img_2,min_size=3,connectivity=1)
print('img_2_small_removed =')
print(img_2_small_removed)

结果如下：

img_1_small_removed =
[[ 0  0  0 67 67 67]
 [ 0 67  0 67  0 67]
 [ 0  0  0  0 67  0]
 [ 0 67 67  0  0 67]]
img_2_small_removed =
[[ 0  0  0 67 67 67]
 [ 0  0  0 67  0 67]
 [ 0  0  0  0 67  0]
 [ 0 67  0  0  0 67]]

由结果可见，img_1中第二行第二列的孤立object 67未被去除，但是，img_2中第二行第二列孤立的object 1被去除了。此外，img_2中第四行第三列的object 2也被去除了，注意object 2周围的元素并非都是0，其左侧存在object 67。

由上例可见，当ar数据类型为int时，morphology.remove_small_objects去除的是数组中个数少于min_size的objects（img_2中的object 1和object 2）。无论被去除的object周围元素是0还是其他object，只要该object在数组中的个数少于min_size，它就要被remove。img_1中第二行第二列元素是孤立的，其周围元素都是背景0，但是该元素所属的object 67在数组中的总量是大于min_size的，所以即便该元素是孤立的，其也未被remove。

当ar数据类型为bool时：

首先，将img_1和img_2数据类型转化为bool，大于0的元素为True，等于0的元素为False。即之前的objects是现在的True，之前的背景0为现在的False。

然后，使用morphology.remove_small_objects分别处理img_1_bools和img_2_bools，以除去size小于3的objects。

import numpy as np
from skimage import morphology
img_1 = np.array([
            [0,0,0,67,67,67],
            [0,67,0,67,0,67],
            [0,0,0,0,67,0],
            [0,67,67,0,0,67],
            ])
img_2 = np.array([
            [0,0,0,67,67,67],
            [0,1,0,67,0,67],
            [0,0,0,0,67,0],
            [0,67,2,0,0,67],
            ])
img_1_bools = img_1 > 0
img_2_bools = img_2 > 0
img_1_small_removed = morphology.remove_small_objects(img_1_bools,min_size=3,connectivity=1)
img_2_small_removed = morphology.remove_small_objects(img_2_bools,min_size=3,connectivity=1)
print('img_1_bools =')
print(img_1_bools)
print('img_1_small_removed =')
print(img_1_small_removed)
print('img_2_bools =')
print(img_2_bools)
print('img_2_small_removed =')
print(img_2_small_removed)

结果如下：

img_1_bools =
[[False False False  True  True  True]
 [False  True False  True False  True]
 [False False False False  True False]
 [False  True  True False False  True]]
img_1_small_removed =
[[False False False  True  True  True]
 [False False False  True False  True]
 [False False False False False False]
 [False False False False False False]]
img_2_bools =
[[False False False  True  True  True]
 [False  True False  True False  True]
 [False False False False  True False]
 [False  True  True False False  True]]
img_2_small_removed =
[[False False False  True  True  True]
 [False False False  True False  True]
 [False False False False False False]
 [False False False False False False]]

由于img_1_bools和img_2_bools两个数组一模一样，所以对二者处理后结果也一模一样。

img_1_bools中第二行第二列的True被移除了（对应img_1中同位置的67），第三行倒数第二列的True被移除了（对应img_1中同位置的67），第四行第二列和第三列的True被移除了（对应img_1中同位置的67和67），第四行最后一列的True被移除了（对应img_1中同位置的67）。

img_2_bools中第二行第二列的True被移除了（对应img_2中同位置的1），第三行倒数第二列的True被移除了（对应img_2中同位置的67），第四行第二列和第三列的True被移除了（对应img_2中同位置的67和2），第四行最后一列的True被移除了（对应img_2中同位置的67）。

注意：在img_1_bools中元素True的数量是远多于min_size的，但是孤立的True们都被remove了。与之对应的，数组数据类型为int时，孤立的object 67并未被remove。