R Markdown的使用教程---rmd格式

Rita的程序bug

于 2024-08-31 20:08:17 发布

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分类专栏： R语言文章标签： github

原文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43843918/article/details/128060062?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522171670652316800215089885%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334..%2522%257D&request_id=171670652316800215089885&biz_id=0&ut

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1.介绍

Markdown是⼀种轻量级标记语⾔，它允许我们可以通过简单的⽂本格式编写⽂档，语法简单、上⼿容易，所以越来越多的人都在使用它，而且现在还有有很多可以⽀持Markdown编辑的应⽤软件，例如Typora、Notion等，通过这些⼯具可以便捷地完成Markdown编辑，并且⽀持导出PDF、HTML等多种格式。

对于经常使⽤R语⾔（不止R，也支持其他语言，如Python、SQL、Stan等）的人来说，比如我们，别人偶尔可能会需要复现我们的工作，那么这个时候，R Markdown就可以助我们一臂之力，以便于他人实现工作复现。可以说Rmd是又便捷又实用！

| 名称        | 显示|
|:-----------|:----------|
| 常规        | default|
| 斜体        | *italics* and _italics_|
| 粗体        | **bold** and __bold__|
| 上标        | superscript^2^|
| 下标        | HO~2~|
| 代码        | `code`|
| 删除线      | ~~strikethrough~~|
| 链接        | [Markdown官网](https://markdown.com.cn/)|
| 标题        | ## H2 |
| 短横线      | - |
| 长横线      |  ---|
| 省略号      | ...|
| 水平线      | ***|
| 图片        | ![caption](pictures/mua.jpg)|
| 表格        | 这不就是嘛|
| 有序列表    | 1.  第一点|
| 无序列表    | -   第一点|

2. R Markdown 的使用

2.1 安装

R Markdown不需要R Studio，但建议使⽤R Studio，因为如果没有安装R Studio，就必须安装Pandoc，而R Studio已和它捆绑在⼀起，所以无需对其进行单独安装。

Rstudio中安装R Markdown软件包，可以通过下⾯任意⼀种⽅式：

点击Rstudio左上⾓的新建项⽬，选择R markdown⽂件格式，就可以建⽴⼀个R Markdown的编辑⽂件。像这样：

在弹出的框⾥，可以填写R Markdown的Title、Author以及默认的输出⽂件格式，⼀般可以选择HTML、PDF、Word格式。

在新建的R Markdown⽂件⾥，主要包含三块内容：1.YAML；2.R Markdown⽂本；3.代码块。

YAML ------ R Markdown的头部⽂件（红），YAML定义了R Markdown的性质，⽐如title、author、date、指定 output⽂件类型等。
Markdown文本 ------ Markdown⽂本是R Markdown⾥的主要内容（黄），是使用者按照Markdown语法⾃⾏编写的⽂本内容。
代码块 ------ R Markdown的⼀个主要功能是可以执⾏⽂件内的代码块（蓝），并且将代码执⾏结果展⽰在Markdown⾥。这对撰写分析报告带来了极⼤滴便利。Rmd⽂件中除了R代码段以外，还可以插⼊Python、SQL等许多编程语⾔的代码段，常⽤编程语⾔还可以与R代码段进⾏信息交换。

3.R代码块

⼀般通过{r}来插⼊，也可以使用快捷键：Ctrl+Alt+I / option + cmd + I，也可以直接点击右上方绿色的+C。

eval: 加选项eval=FALSE,可以使得代码仅显⽰⽽不实际运⾏。这样的代码段如果有标签，可以在后续代码段中被引⽤。

include: 加选项include=FALSE，则本代码段仅运⾏，但是代码和结果都不写⼊到⽣成的⽂档中。

echo: echo参数控制了Markdown是否显⽰代码块。若echo=TRUE，则表⽰代码块显⽰在markdown⽂档显⽰代码块；反之，代码块不出现在输出结果中。

collapse: ⼀个代码块的代码、输出通常被分解为多个原样⽂本块中，如果⼀个代码块希望所有的代码、输出都写到同⼀个原样⽂本块中，加选项collapse=TRUE。

prompt: prompt=TRUE代码⽤R的>提⽰符开始。

comment:如果希望结果不⽤#号保护，使⽤选项comment=''。

results: ⽤选项results=选择⽂本型结果的类型。取值有：

markup，这是缺省选项，会把⽂本型结果变成HTML的原样⽂本格式;
hide，运⾏了代码后不显⽰运⾏结果;
hold，⼀个代码块所有的代码都显⽰完，才显⽰所有的结果。
asis，⽂本型输出直接进⼊到HTML⽂件中，这需要R代码直接⽣成HTML标签，knitr包的kable()函数可以把数据框转换为HTML代码的表格。