发文新方向:孟德尔随机化+多组学的联合套路模板

汇集六项大型数据集,设定多达五个研究目标,开发代谢组关联研究(MWAS)框架。

年龄相关性黄斑变性(AMD)是导致视力丧失的主要原因,但其潜在致病机制仍不清楚。为了探究代谢物与AMD之间的因果关系,作者进行了一项开创性研究,对六项多祖先和多液体数据进行了大规模综合遗传和代谢组学分析。文章的亮点包括:

1. 首次进行大规模代谢物全基因组关联研究,鉴定血浆和尿液中的mQTL;

2. 通过双样本MR分析揭示了与AMD相关的血浆代谢物;

3. 发现与AMD相关的代谢物富含脂质相关途径;

4. 系统性探索代谢物与AMD亚型及脂质生物标志物的联系。

这项研究不仅为AMD的致病机制提供了新见解,还为生信分析领域的小伙伴们提供了宝贵的学习资源。

今天要给大家分享的文章如下:↓

题目:Integrating genetics and metabolomics from multi-ethnic and multi-fluid data reveals putative mechanisms for age-related macular degeneration

杂志:Cell Reports Medicine 

影响因子:IF=14.3

中科院分区:医学一区

发表时间:2023年7月

一、研究背景

年龄相关性黄斑变性(AMD)是50岁及以上成年人视力丧失的主要原因,全球患病率达8.7%。目前,AMD已被明确为一种复杂的疾病,涉及环境和遗传风险因素的组合。全基因组关联研究(GWAS)已识别出50多个与AMD风险相关的单核苷酸多态性(SNP),并且遗传学研究还发现了一些与AMD易感性相关的脂质和炎症生物标志物。然而,AMD的潜在致病机制仍然不清楚。

二、数据来源

六个大型数据集分别来自以下研究:护士健康研究(NHS)、NHSII、卫生专业人员随访研究(HPFS)、加拿大老龄化纵向研究(CLSA)、芬兰代谢物研究(男性代谢综合征 [METSIM])和西班牙社区健康研究/拉丁裔研究(HCHS/SOL),以及Schlosser等人的尿液代谢组数据。

1. 在NHS、NHSII和HPFS中,共有346种血浆代谢物的数据,来自6610名参与者。

2. CLSA中有1437种血浆代谢物的数据,来自9021名参与者。

3. METSIM中有1391种血浆代谢物的数据,来自6136名参与者。

4. HCHS/SOL中有640种血浆代谢物的数据,来自4926名参与者。

5. Schlosser等人的研究中,有1172种尿液代谢物的数据

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值