我和spark有个约会(2)-spark 的shuffle过程

shuffle被称为是神奇发生的地方,分为三个部分了解下shuffle的过程:
概览,spark write,spark read

为什么需要 shuffle write

job example

按照stage划分后的rdd:
这里写图片描述
详细的任务执行的流程:
这里写图片描述
从图上可以看出,有依赖的stage之间的数据互通,是通过上个stage的shufflemaptask write 之后,将源数据同步,再由下一个stage的shufflemaptask 读取源数据在read获取到。
spark shuffle的进化史:

  • Spark 0.8及以前 Hash Based Shuffle

  • Spark 0.8.1 为Hash Based Shuffle引入File Consolidation机制

  • Spark 0.9 引入ExternalAppendOnlyMap

  • Spark 1.1 引入Sort Based Shuffle,但默认仍为Hash Based Shuffle

  • Spark 1.2 默认的Shuffle方式改为Sort Based Shuffle

  • Spark 1.4 引入Tungsten-Sort Based Shuffle

  • Spark 1.6 Tungsten-sort并入Sort Based Shuffle

  • Spark 2.0 Hash Based Shuffle退出历史舞台

Hash Based Shuffle, 这时候每一个Mapper会根据Reducer的数量创建出相应的bucket,bucket的数量是M R ,其中M是Map的个数,R是Reduce的个数。这样会产生大量的小文件,对文件系统压力很大,而且也不利于IO吞吐量。后面忍不了了就做了优化,把在统一core上运行的多个Mapper 输出的合并到同一个文件,这样文件数目就变成了 cores R 个了
例如:
3个maptask 3个reducetask 这样的话就会产生9个小文件:
这里写图片描述

优化之后:
这里写图片描述
4个maptask 4个redueetask 如果不使用 Consolidation机制,会产生16个小文件。
优化之后,4个map运行在2个core上,这样只会产生8个小文件。
在同一个 core 上先后运行的两个 map task的输出, 对应同一个文件的不同的 segment上, 称为一个 FileSegment, 形成一个 ShuffleBlockFile。
后面就引入了 Sort Based Shuffle, map端的任务会按照Partition id以及key对记录进行排序。同时将全部结果写到一个数据文件中,同时生成一个索引文件, 再后面就就引入了 Tungsten-Sort Based Shuffle, 这个是直接使用堆外内存和新的内存管理模型,节省了内存空间和大量的gc, 是为了提升性能。
现在2.1 分为三种writer, 分为 BypassMergeSortShuffleWriter, SortShuffleWriter 和 UnsafeShuffleWriter,顾名思义,大家应该可以对应上, Hash Based Shuffle 已经退出历史舞台了,我就不讲了。

三种shuffle write的分类:
这里写图片描述

上面是使用哪种 writer 的判断依据, 是否开启 mapSideCombine 这个判断,是因为有些算子会在 map 端先进行一次 combine, 减少传输数据。 因为 BypassMergeSortShuffleWriter 会临时输出Reducer个(分区数目)小文件,所以分区数必须要小于一个阀值,默认是小于200。

UnsafeShuffleWriter需要Serializer支持relocation,Serializer支持relocation:原始数据首先被序列化处理,并且再也不需要反序列,在其对应的元数据被排序后,需要Serializer支持relocation,在指定位置读取对应数据。

分别分析下三种write方式:
BypassMergeSortShuffleWriter 实现细节

BypassMergeSortShuffleWriter和Hash Shuffle中的HashShuffleWriter实现基本一致, 唯一的区别在于,map端的多个输出文件会被汇总为一个文件。 所有分区的数据会合并为同一个文件,会生成一个索引文件,是为了索引到每个分区的起始地址,可以随机 access 某个partition的所有数据。
这里写图片描述

但是需要注意的是,这种方式不宜有太多分区,因为过程中会并发打开所有分区对应的临时文件,会对文件系统造成很大的压力。

具体实现就是给每个分区分配一个临时文件,对每个 record的key 使用分区器(模式是hash,如果用户自定义就使用自定义的分区器)找到对应分区的输出文件句柄,直接写入文件,没有在内存中使用 buffer。 最后copyStream方法把所有的临时分区文件拷贝到最终的输出文件中,并且记录每个分区的文件起始写入位置,把这些位置数据写入索引文件中。

SortShuffleWriter 实现细节

我们可以先考虑一个问题,假如我有 100亿条数据,但是我们的内存只有1M,但是我们磁盘很大, 我们现在要对这100亿条数据进行排序,是没法把所有的数据一次性的load进行内存进行排序的,这就涉及到一个外部排序的问题,我们的1M内存只能装进1亿条数据,每次都只能对这 1亿条数据进行排序,排好序后输出到磁盘,总共输出100个文件,最后怎么把这100个文件进行merge成一个全局有序的大文件。我们可以每个文件(有序的)都取一部分头部数据最为一个 buffer, 并且把这 100个 buffer放在一个堆里面,进行堆排序,比较方式就是对所有堆元素(buffer)的head元素进行比较大小, 然后不断的把每个堆顶的 buffer 的head 元素 pop 出来输出到最终文件中, 然后继续堆排序,继续输出。如果哪个buffer 空了,就去对应的文件中继续补充一部分数据。最终就得到一个全局有序的大文件。

如果你能想通我上面举的例子,就差不多搞清楚sortshufflewirter的实现原理了,因为解决的是同一个问题。
SortShuffleWriter 中的处理步骤就是:

  • 使用PartitionedAppendOnlyMap或PartitionedPairBuffer在内存中进行排序,排序的K是(partitionId, hash(key))这样一个元组

  • 如果超过内存limit,会spill到一个文件中,这个文件中元素也是有序的,首先是按照partitionId的排序,如果partitionId相同,再根据 hash(key)进行比较排序

  • 如果需要输出全局有序的文件的时候,就需要对之前所有的输出文件 和 当前内存中的数据结构中的数据进行 merge sort, 进行全局排序

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