在Jupyter Notebook中运行R (附一系列疑难解答）

在Jupyter notebook中使用R

虽然R也有notebook，但是用起来感觉没有Jupyter notebook方便？？？而且R notebook中的图片总是无法显示，修改了输出设置也没有图片显示。之后再看看是哪里出了问题。

Jupyter notebook在默认情况下只有python内核，现在要使Jupyter notebook里支持R内核。
Step1： 在R中安装工具：

# 可以直接安装
install.packages("IRkernel")

# 或者通过github
devtools::install_github("IRkernel/IRkernel")

没有devtools的，install.packages("devtools")安装devtools。

Step2： 安装IRkernel:

# 在当前用户下安装
IRkernel::installspec()

# 或者在系统中安装
IRkernel::installspec(user = FALSE)

如果这一步之后返回以下提示：

# 在当前用户下安装
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in C:\Users\user\AppData\Roaming\jupyter\kernels\ir 

或者

# 在系统中安装
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in C:\ProgramData\jupyter\kernels\ir

说明安装成功了，打开jupyter notebook发现可以成功支持R了，如下：

至此就成功了。

疑难解答

但事实永远不会这么顺利，在安装IRkernel的时候就可能会出现各种问题导致安装失败，比如会提醒你：cannot … the installaion of “XXX” (一个包的名字)，诸如此类的Error。
这个时候它提示你哪个包出问题你就重新安装哪个包，安装完之后继续Step 1中的代码。循环几次，直到所有的依存包都没有问题了，就可以安装上IRkernel了。

接下来，在执行IRkernel::installspec()可能比较麻烦：
通常会报错：

Error in IRkernel::installspec() : jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 1.

这里汇总一下可以解决上述问题的方法：

方法一 不要使用Rstudio执行这一步，按以下操作：

• 如果是通过anaconda安装的Jupyter，先确保把 Anaconda\Lib\site-packages\jupyter_client以及Anaconda3\Scripts添加到系统变量PATH中。

• 打开cmd或者Anaconda Prompt，如果已经在系统变量中添加了R的安装路径，直接键入R。如果没有添加系统变量，需要先进入R的安装路径，比如：

cd C:\Program Files\R\R-4.0.1\bin

• 然后在命令行中敲R进入R。

• 最后输入IRkernel::installspec()

以cmd为例，Anaconda Prompt类似，具体操作界面大概是这个样子：

方法二 如果以上的都行不通，可以用这种方法。找到原生R，右键，选择”以管理员身份运行“，在console中直接输入IRkernel::installspec()或者IRkernel::installspec(user = FALSE)，如下