poj 1080 Human Gene Functions 动态规划(最长公共子序列)

#include<iostream>
#include<string>
#include<stdio.h>
#include<string.h>
using namespace std;
char str1[105],str2[105];
int map[5][5]={5,-1,-2,-1,-3,-1,5,-3,-2,-4,-2,-3,5,-2,-2,-1,-2,-2,5,-1,-3,-4,-2,-1,0};
int dp[105][105];
int pd(char x,char y)
{
    int i,j;
    switch(x)
    {
        case 'A':i=0;
            break;
        case 'C':i=1;
            break;
        case 'G':i=2;
            break;
        case 'T':i=3;
            break;
        case ' ':i=4;
            break;
    }
    switch(y)
    {
        case 'A':j=0;
            break;
        case 'C':j=1;
            break;
        case 'G':j=2;
            break;
        case 'T':j=3;
            break;
        case ' ':j=4;
            break;
    }
    return map[i][j];
}
int max1(int a,int b,int c)
{
    int max;
    if(a>b)
    {
        max=a;
    }
    else
    {
        max=b;
    }
    if(c>max)
    {
        max=c;
    }
    return max;

}

void work(int len1,int len2)
{
    for(int j=1;j<=len2;j++)
    {
        dp[0][j]=dp[0][j-1]+pd(' ',str2[j]);
    }
    for(int i=1;i<=len1;i++)
    {
        dp[i][0]=dp[i-1][0]+pd(str1[i],' ');
    }
    for(int i=1;i<=len1;i++)
    {
        for(int j=1;j<=len2;j++)
        {
            if(str1[i]==str2[j])
            {
                dp[i][j]=dp[i-1][j-1]+pd(str1[i],str2[j]);
            }
            else
            {
                dp[i][j]=max1(dp[i-1][j-1]+pd(str1[i],str2[j]),dp[i][j-1]+pd(' ',str2[j]),dp[i-1][j]+pd(str1[i],' '));
            }
        }
    }
}
int main()
{
    int t,len1,len2;
    scanf("%d",&t);
    while(t--)
    {
        memset(dp,0,sizeof(dp));
        scanf("%d%s",&len1,str1+1);
        scanf("%d%s",&len2,str2+1);
        work(len1,len2);
        printf("%d\n",dp[len1][len2]);

    }
    return 0;
}

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