docker: 将一个普通用户owner的文件夹挂载入容器，新建的文件为root的解决方法

在某台服务器上，一个普通用户（假设用户名为szw，用户组ID与用户ID相同，均为1026）使用docker，将自己拥有的一个文件夹挂载入容器，进行计算任务。
计算完成后，新建的文件为root的解决方法，普通用户无法删除。

1. build一个镜像，在这个镜像中新建一个用户

为了解决这个问题，我们首先要对于原有的镜像进行改造，让这个镜像增加一个用户。
首先要知道我在这个服务器上的gid与uid

在终端中输入命令：

cat /etc/passwd

看到uid与gid均为1026

新建new_user.Dockerfile

FROM harbor.atompai.com/nitrogen/xdock:v1
MAINTAINER qichun.tang@xtalpi.com
ENV NEW_UNAME="szw"   # 填入你的用户名
ENV NEW_UID="1026"        # 填入你的uid
RUN groupadd -g  $NEW_UID $NEW_UNAME
RUN useradd -d /home/$NEW_UNAME -u $NEW_UID -g $NEW_UID $NEW_UNAME  -m -s /bin/bash 

终端中运行：

docker -H 0.0.0.0 build -t xdock:szw --file new_user.Dockerfile .    #xdock后的tag改为你的用户名

2.新的使用方式

完成后，以后单机使用scorefunc注意两点：

1. 使用用户镜像（如xdock:szw）
2. 退出前记得执行chown -R szw:szw /root/c204_test（szw表示用户名，/root/c204_test表示容器中的项目路径）

这是一个具体案例：

docker -H 0.0.0.0 run -it --rm -v $PWD/scorefunc:/home/scorefunc -v $PWD/c204_test:/root/c204_test xdock:szw  /bin/bash

----进入镜像-----

cd /home/scorefunc
python setup.py install
scorefunc create -n c204_test -p /root/c204_test/
scorefunc prepare ligand csv --csv example/c204_test --pdbcode RET1 --gen_id
scorefunc prepare complex example/RET_complex.pdb
scorefunc pose generate -m rdock -j -1
scorefunc pose export -m rdock

重点：

chown -R szw:szw /root/c204_test/
chown -R szw:szw /home/scorefunc/

----退出镜像-----