超算使用杂乱笔记

前言

第一次使用超算时在登陆节点上运行程序被老师打电话问候，略感愧疚。现在把所学都整理整理，相同的错误就不能犯第二次。

虚拟环境

我们超算的虚拟环境使用env/module进行管理。

例如，在使用intel的mkl库前应使用

module load mkl

运行Shell命令

一般将一系列的Shell命令写成*.sh的文件来运行。在提交任务时，也一般用sbatch提交写好的*.sh文件。

循环

Shell语言中的for循环：

for ncfile in `ls *.nc`
do
./run $ncfile
done

后台运行

使用nohup命令后台运行程序很方便。

nohup ./download &
#使用&来使断开ssh连接时能够继续运行

如果运行的程序需要交互，并且从标准输入流stdin输入的信息是已预定的，可用命令：

nohup ./download < input.txt &
#input.txt中预先写好了对download的标准输入流