- 集群python环境安装
- 自行安装:可以在自己home目录下安装anaconda或者miniconda
- 调用HPC已经安装好的公用python环境 :在bashrc中加入
source /public/software/profile.d/apps_anaconda3-2021.05.sh
然后source ~/.bashrc之后使用conda新建一个自己的环境
- 任务提交
- 任务调试:集群禁止在登陆节点运行任何除编译配置环境以外的程序,不支持直接登陆到计算节点调试程序,slurm调度系统中可以使用salloc临时申请计算节点访问,调试程序可以通过
salloc -N 1 --cpus-per-task=4 -t 5:00 -p bme_gpu --gres=gpu:1
调度系统会暂时返回计算节点shell可以通过srun运行需要调试的代码
srun python test.py - 提交任务
sbatch XXX.job