分子生物学数据库

本文介绍了分子生物学的重要数据库,如NCBI、EMBL、EBI等,详细讲解了GenBank的内容和检索工具Entrez、BLAST。通过实例展示了如何在NCBI中查找并筛选特定序列,例如humanVANGL2的RefSeqtranscripts(NM_020335.3)。这些数据库包含了EST、GSS、RefSeq等多种类型的数据,为科研工作者提供了宝贵的资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

核酸研究(NAR)对所有的分子生物学数据库进行分类, 见 NAR Database Summary Paper Category List,包括:

Nucleotide Sequence Databases (核酸数据库)
RNA sequence databases (RNA序列数据库)
Protein sequence databases  (蛋白质序列数据库)
Structure Databases  (结构数据库)
Genomics Databases (non-vertebrate) (非脊椎动物基因组数据库)
Metabolic and Signaling Pathways  (代谢和信号通路数据库)
Human and other Vertebrate Genomes (人类及其他脊椎动物基因组数据库)
Human Genes and Diseases (人类基因和疾病数据库)
Microarray Data and other Gene Expression Databases (微阵列数据和其他基因表达数据库) 
Proteomics Resources (蛋白质组学资源数据库) 
Other Molecular Biology Databases  (其他分子生物学数据库)
Organelle databases  (细胞器数据库)
Plant databases (植物数据库)
Immunological databases  (免疫学数据库)
Cell biology (生物学数据库)

一些著名的机构有

NCBI

National Center for Biotechnology Information
美国国家生物技术信息中心
收录:GenBank、PubMed、dbSNP等数据库
提供:Entre、BLAST等检索工具

EMBL

European Molecular Biology Laboratory
欧洲分子生物学实验室

EBI

European Bioinformatics Institute
欧洲生物信息学研究所
EMBL于1992年创立的一个分支机构

EMBnet

European Molecular Biology Network
欧洲分子生物学网络

NIG

National Institute of Genentics
日本国立遗传学研究所
管理 DDBJ 数据库:
Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan

SIB

Swiss Institute of Bioinformatics
瑞士生物信息学研究所

国内网站

北京大学生物信息中心

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值