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RSS订阅转载 【附下载】20556本杂志2023最新影响因子预测，SCI结束普涨生涯，14011本杂志影响因子下跌，最高跌幅高达99%....
马上6月，又到了科睿唯安公布最新期刊影响因子的时候。理论上，2022年12月31日以后就能计算当年的影响因子了，但是由于部分出版商延期提交数据等原因，官方每年6月中下旬才发布初版期刊影响因子。心急的小伙伴们已经迫不及待了，小编专门为大家整理了最新的预测数据，数据放在文末，大家别忘了领取哦！本次预测统计共包含21442本杂志，其中既有旧影响因子也有最新影响因子数据的杂志共20556本。整体上看，与去...
2023-05-28 07:02:28
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转载 Microbiome | 西农韦革宏揭示根际细菌对甘草化感作用的响应及解毒作用
基于宏基因组揭示根际细菌对甘草化感作用的响应及解毒作用Metagenomics insights into responses of rhizobacteria and their alleviation role in licorice allelopathyArticle，2023-5-22，Microbiome，[IF 16.837]DOI：https://doi.org/10.1186/s...
2023-05-28 07:02:28
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转载 4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...
生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。下面再分享7个我们承建发表的数据库，4篇NAR，一篇BIB，一篇Nature protocols，一篇Science Bulletin，总计影响因子100+，以飨读者。中医药方剂的数据库，收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息，网站古色古香，设计精美，交互探索，网络大气，高颜值是很好的敲门砖，于201...
2023-05-28 07:02:28
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转载 多项新增；国家自然科学基金项目评审请托行为禁止清单正式发布！
国家自然科学基金项目评审请托行为禁止清单（2023 年 5 月 23 日国家自然科学基金委员会委务会议审议通过）为扎实开展评审专家被“打招呼”顽疾专项整治工作，更好地维护国家自然科学基金（以下简称科学基金）项目科学公正的评审环境，压实和规范科研人员、依托单位、评审专家、自然科学基金委工作人员等“四方主体”的责任和行为，大力营造风清气正的科研生态，推动基础研究高质量发展，依据《国家自然科学基金条例》...
2023-05-27 07:03:56
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转载 华大等机构共同研制的宏基因组数据处理国际标准发布
5月19日，由深圳华大生命科学研究院联合中国科学院微生物研究所共同提出，中国食品发酵工业研究院有限公司、深圳华大智造科技股份有限公司等共同参与研制的国际标准《ISO/TS 24420:2023 Biotechnology — Massively parallel DNA sequencing—General requirements for data processing of shotgun m...
2023-05-27 07:03:56
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转载 Brief Bioinform | 农科院深圳基因组所王怡雯组提出一种去除微生物组数据中批次效应的多元算法框架...
PLSDA-batch：去除微生物组数据中批次效应的多元算法框架PLSDA-batch: a multivariate framework to correct for batch effects in microbiome dataArticle，2023-1-18，Briefings in Bioinformatics，[IF 13.994]DOI：https://doi.org/10.109...
2023-05-27 07:03:56
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转载 aBIOTECH |『植物微生物互作』主题文章
本期精选aBIOTECH2023年发表的『植物微生物互作』相关文章，点击文章图片、题目可阅读、下载全文。（点击图片查看原文）Epigenetic regulation of plant immunity: from chromatin codes to plant disease resistance文章介绍：aBIOTECH | 段成国课题组综述植物免疫调控中的表观遗传机制（点击图片查看原文...
2023-05-26 07:05:42
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转载 iMeta | 河南农业大学姚文组开发绘制Circos图的交互式Web应用程序
点击蓝字 关注我们shinyCircos‐V2.0: 易用性提高和功能增强的Circos图绘制工具iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.109●2023年5月8日，河南农业大学姚文团队在iMeta在线发表了题为 “shinyCircos-V2.0: Leveraging the ...
2023-05-26 07:05:42
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原创 Protein & Cell | 中国农科院基因组所刘永鑫组综述微生物组研究的过去、现在和未来(大众评审截止26号20点）...
微生物组研究展望：过去、现在和未来Microbiome research outlook: past, present, and future2023-5-23，Protein & Cell，[IF 15.328]DOI：10.1093/procel/pwad031原文链接：https://academic.oup.com/proteincell/advance-article/doi/1...
2023-05-25 07:02:31
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转载 转录组高级分析和数据可视化技术研讨会(2023.9)
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现安排《高级转录组分析和R数据可视化》于2023年5月12日线上/线下课程 (线上课是通过腾讯会议实时直播线下课，实时互动，并录制有视频回放，无限期观看)。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下相识。扩增子线上/线下开课时间：2023/6/9-11临床基因组学线上/线下开课时间：202...
2023-05-25 07:02:31
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转载 New Phytologist | 中科院南土所孙波/梁玉婷组揭示促进低肥力土壤中作物生长的微生物策略...
低肥力土壤中促进作物生长：基于主场优势的微生物解决方案Home-based microbial solution to boost crop growth in low-fertility soilArticle，2023-5-07，New Phytologist，[IF 10.32]DOI：https://doi.org/10.1111/nph.18943 原文链接：https://nph.on...
2023-05-23 07:02:31
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转载 【LorMe云讲堂•国际版】特邀Ashley Shade教授
●海报信息●●观看指南●1. 长按海报，直接扫码进入“微信小程序腾讯会议”观看课程。2.可通过下载“bilibili app”，搜索：凌恩生物，观看课程。错过直播的小伙伴不用难过，点击下面链接让您一期都不落下！https://space.bilibili.com/526897465/channel/collectiondetail往期回顾【第7讲】Paolina Garbeva教授：Volat...
2023-05-23 07:02:31
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转载 Cell Host & Microbe｜李娟/周宏伟团队揭示肠道菌群来源外膜囊泡促进类风湿关节炎发病新机制...
类风湿关节炎（RA）致残率高，我国患病人数超过600万，给社会带来沉重的负担。近年来研究提示肠道微生态的改变可能参与了RA免疫紊乱，但其中的因果性及具体机制有待进一步阐明。2023年4月12日，来自南方医科大学南方医院风湿病诊疗中心李娟团队以及南方医科大学珠江医院检验科周宏伟团队在Cell Host & Microbe 杂志发表题为Fusobacterium nucleatum aggra...
2023-05-22 07:04:02
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转载 【高被引论文】没有好的科学问题，来看看微生物生态学领域五十个最重要研究问题...
点击上方蓝字“全球微生态”关注我们！！！标题：微生物生态学五十个重要研究问题作者：Rachael E. Antwis, Sarah M. Griffiths, Xavier A. Harrison, Paz Aranega-Bou, Andres Arce, Aimee S. Bettridge, Francesca L. Brailsford, Alexandre de Menezes, An...
2023-05-22 07:04:02
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转载 《热心肠日报》2022-23年全球肠道菌群研究十大人物
在过去的一年多时间里，全球肠道领域研究继续高歌猛进，取得了颇多令人瞩目的进展。2023肠道大会来临之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2022年5月以来一年期间（2022年5月1日至2023年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2022-2023年度榜单。2022-2023年度榜单参评的文章共有3388篇，发表在420个不同的期刊上，累计影响因子达到了8290...
2023-05-21 07:01:41
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转载 Nature Microbiology | 浙江大学王蒙岑等发现微生物组调控植物抗病防御新机制
叶际微生物组诱导水稻对稻曲病的代谢防御Phyllosphere microbiome induces host metabolic defence against rice false-smut diseaseArticle，Nature Microbiology，2023-05-04， [IF 30.964]第一作者：刘晓玉（西澳大学博士研究生）、Matsumoto Haruna（浙江大学博士生...
2023-05-21 07:01:41
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转载 iMeta | 引用7000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp更快更好地质控FASTQ数据
点击蓝字 关注我们使用fastp进行超快的FASTQ数据预处理、质量控制和去重iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.107● 2023年5月8日，海普洛斯生物科技有限公司陈实富在iMeta在线发表了题为“Ultrafast one-pass FASTQ data preproces...
2023-05-20 07:04:04
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转载 重磅呈现！2023肠道大会Protein & Cell微生物组综述专刊 | 热心肠日报
今天是第2536期日报。刘宏伟团队：肠菌细胞壁的免疫原性分子（综述）Protein & Cell[IF:15.328]① 源自肠道细菌细胞壁的免疫原性分子肽聚糖和脂质相关分子等，具有不同的结构特征，在健康和疾病中塑造固有免疫和适应性免疫应答；② 肽聚糖及其衍生物通过与细胞内固有免疫受体NOD1/2结合，调节宿主免疫和炎症反应；③ 肠菌细胞壁衍生的脂质相关分子（糖脂类、磷酯类等）可通过调节细...
2023-05-20 07:04:04
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转载 Cell Host & Microbe | 王璋揭示呼吸道菌群紊乱促进慢性阻塞性肺疾病肺功能下降的分子机制...
呼吸道菌群紊乱加速慢阻肺的肺功能下降Airway dysbiosis accelerates lung function decline in chronic obstructive pulmonary diseaseClinical and Translational ReportCell Host & Microbe，2023-05-18， [IF 31.316]DOI：https:/...
2023-05-19 07:03:02
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转载 iMeta封面 | 中农胡永飞组揭示鸡肠道微生物发育轨迹及其与宿主代谢的关系
点击蓝字 关注我们肠道菌群之歌。研究通过定量微生物组分析揭示了鸡肠道微生物群体的时空变化规律及其与宿主代谢的关系。音乐中的高音谱号代表肠道，高音谱号加时钟代表肠道微生物的时空动态变化；高音谱号加丝带状五线谱及其中的化合物代表鸡肠道微生物的动态变化“演奏”出宿主代谢产物变化的美妙乐章；鸡“注视”这一过程代表鸡生长发育过程中，其生理代谢时刻受到肠道微生物的影响。画面构思反应研究主旨，也体现艺术与科学的...
2023-05-18 07:03:20
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转载 Cell Metab | 刘星吟组揭示肠道微生物及其代谢物吲哚-3-乳酸抗肿瘤免疫的新机制...
结直肠癌(Colorectal cancer, CRC)是世界范围内普遍存在的胃肠道恶性肿瘤，具有很高的发病率和死亡率。CRC的发病是一个复杂且多因素的过程，受遗传和环境因素的影响，具有不同的发病机制。在环境因素中，慢性肠道炎症是导致结直肠癌发生的重要因素。越来越多的证据表明，肠道微生物群的失衡以及肠道微生物衍生代谢物的改变与结直肠癌有关。肠道益生菌是一种活的微生物，大量文献显示其对肠道微生态平衡...
2023-05-17 07:03:18
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转载 中国肠道大会宏基因组培训后天开讲！5月19日连讲7小时
微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，微生物组学数据分析方法、前沿技术和科研思路是广大同行持续追求的。为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组领域的发展，2023肠道大会与“宏基因组”公众号联合举办本次培训班。▶ 特别提醒：肠道大会报名时可选“我要报名《宏基因组》培训班”一键报名。己报名大会或只参加培训的用户也可以单独报名“《宏基因组》培训班”，课程将在大会开幕前一天（5月19日）9:...
2023-05-17 07:03:18
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转载 The Innovation | Volume 4 Issue 3 Live Now
Volume 4 Issue 32023年05月15日The Innovation第四卷第三期正式出版On the CoverIn recent years, driven by the new round of scientific and technological revolution coupled with carbon neutrality, the energy structure ...
2023-05-16 07:01:25
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转载 iMeta | 累计发文过百篇，2022年文章平均被引12.2次
点击蓝字 关注我们iMeta 累计发文过百篇，2022年文章平均被引12.2次截止2023年5月13日，iMeta 发表论文破百，被引744次，平均被引7.44次，标志着 iMeta 期刊文章量实现了里程碑式增长。如下图：值得注意的是，iMeta 在2022年发文60篇，被引732次，文章平均被引12.2次，如下图：立即指数12是个什么水平呢，我们拿知名期刊Science、Nature及Natur...
2023-05-16 07:01:25
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转载 Frontiers in Immunology | 鲁东大学研究解析杀鱼爱德华氏菌诱发海马肠炎的组合毒力因子作用机制...
杀鱼爱德华氏菌侵染重塑膨腹海马肠道微生物和代谢：毒力因子协同作用的机制解析Edwardsiella piscicida infection reshapes the intestinal microbiome and metabolome of big-belly seahorses: mechanistic insights of synergistic actions of virulence...
2023-05-15 09:28:35
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原创 Nat. Commun | 中国海洋大学张伟鹏组揭示海洋生物被膜群落硫氧化主要菌群及其作用机制...
海洋生物被膜玫瑰杆菌的厌氧硫氧化机制Anaerobic thiosulfate oxidation by the Roseobacter group is prevalent in marine biofilmsArticle，2022-04-11，Nature Communications，[IF 17.7]DOI：10.1038/s41467-023-37759-4原文链接：https://w...
2023-05-14 07:01:47
178
转载 肠道大会 | 3小时研修班：深度聚焦微生物单细胞多组学
微生物单细胞多组学研修班单个细胞是微生物组（菌群）的功能单元和进化单位。因此，单细胞多组学研究，通过在单细胞精度构建从基因组、转录组、蛋白组、代谢物组到代谢表型组的关联，能在最“深”的水平剖析菌群的遗传多样性和功能异质性、揭示菌群-宿主互作的机制、挖掘功能元件和底盘细胞、监测微生态过程、乃至重塑与设计人工菌群。“微生物单细胞组学研修班”将基于对科学文献与产业技术的梳理与剖析，系统地介绍微生物单细胞...
2023-05-14 07:01:47
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转载 4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...
生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。下面再分享7个我们承建发表的数据库，4篇NAR，一篇BIB，一篇Nature protocols，一篇Science Bulletin，总计影响因子100+，以飨读者。中医药方剂的数据库，收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息，网站古色古香，设计精美，交互探索，网络大气，高颜值是很好的敲门砖，于201...
2023-05-13 07:01:50
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原创 Protein Cell：基于R语言的微生物组数据挖掘最佳流程（大众评审截止14号晚6点）...
Protein & Cell综述：基于R语言的微生物组数据挖掘的最佳流程近日，中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊 Protein & Cell (IF = 15.3) 发表了题为”“The best practice for microbiome analysis using R”的综述论文，建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR，助力微...
2023-05-13 07:01:50
414
转载 iMeta | 华中科技大学杨操组综述细胞外囊泡和微生物组的互作：疾病治疗新策略...
点击蓝字 关注我们细胞外囊泡和微生物组的互作：疾病治疗新策略iMeta主页：http://www.imeta.science综 述●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.86● 2023年2月6日，华中科技大学杨操团队在iMeta在线发表了题为“Interactions between extracellular vesicles and microb...
2023-05-11 07:03:32
51
转载 JGG｜方晓东/魏泓团队发现微生物群塑造小鼠脾脏解剖结构和免疫功能
点击蓝字 关注我们肠道微生物与其宿主表现出复杂的相互作用，并在整个生命周期中塑造生物体的免疫系统。脾脏作为最大的次级淋巴器官，是进行免疫应答的重要场所。然而，目前仍不清楚微生物与脾脏相互作用的分子机制以及微生物群对脾脏免疫细胞转录过程的影响。2023年5月6日，Journal of Genetics and Genomics在线发表华大生命科学研究院方晓东研究员和中山大学魏泓研究员团队合作题为“M...
2023-05-11 07:03:32
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转载 手把手教你用FAPROTAX和FUNGuild进行菌群功能预测分析
关注“微生态”公众号，了解更多微生科研干货生科云网址：https://www.bioincloud.tech01课程简介FAPROTAX是一款基于16S测序的功能预测软件。它整合了多个已发表的可培养菌文献的原核功能数据库，预测准确性较好。FAPROTAX较适用于对环境样本(如海洋、湖泊等)的生物地球化学循环过程(特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环)进行功能注释预测。FUNGuild是一款基于ITS...
2023-05-10 07:05:52
105
转载 CGM第343期：植物微生物组专题研讨(2)夏雨/文涛/王亚玉/庞志强(今晚7点)
CGM将于北京时间5月10日星期三7:00 PM举办在线沙龙活动。本期活动，我们联合Ad植物微生物公众号和iMeta期刊设置“植物微生物组”专题研讨，并就主题“宏基因组测序、分析及其与植物学研究的交叉”（更多主题见文末）邀请到南方科技大学夏雨博士带来“宏基因组测序与分析ONT-based Metagenomic Study on High-altitudePermafrost Micro...
2023-05-10 07:05:52
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转载 Cell | 黄三文 研究员：开发进化透镜，加速杂交马铃薯育种（5月12日15:00）
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2023-05-10 07:05:52
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原创 Nature Biotechnology | 自动化和机器学习的高通量微生物培养组学分离微生物组
自动化和机器学习高通量分离微生物组High-throughput microbial culturomicsusing automation and machine learningArticle，2023-2-20，Nature Biotechnology， [IF 68.16]DOI：https://doi.org/10.1038/s41587-023-01674-2通讯作者：Harris ...
2023-05-09 07:02:14
186
Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
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