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转载 iMeta | 林昊/吕昊/黄健-解析2型糖尿病进程中胰岛风险细胞的异常扰动
点击蓝字 关注我们scRiskCell:用于量化 2 型糖尿病中的胰岛风险细胞及其适应性动力学的单细胞框架iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70060● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70060● 2025年6月24日,电子科技大学林昊,吕昊和黄健等在iMe
2025-07-11 08:03:08
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转载 iMetaOmics | 左志向/陈志航/刘炜-开发癌症组织偏向性基因数据库TBCancer
点击蓝字 关注我们TBCancer:探索癌症中组织偏向性基因特征与功能的数据库iMeta主页:http://www.imeta.science方法论文● 原文: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70039● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70039● 2025年6月29日,中山大学左志向、陈志航、刘炜等团队在iMetaOmics在线发表了题为“TBCancer: A d
2025-07-11 08:03:08
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原创 纳米孔宏基因组宿主序列去除方法
此外,其他的针对三代纳米孔长读数据的去宿主方法有待开发,例如基于机器学习的序列预测方法等。从动物(包括人类)或植物宿主身上采集的样本(如粪便、血液、组织、拭子、植物根系等)中,宿主自身的DNA通常占测序数据的绝大部分(可能高达99%以上),如果不去除宿主序列,目标微生物(细菌、病毒、真菌、古菌等)的序列会被淹没在庞大的宿主序列中,使得后续分析效率低下且成本高昂。将测序reads与宿主参考基因组进行比对(Minimap2为最常用的纳米孔测序数据比对工具),然后去除比对到参考基因组上的reads。
2025-07-10 11:10:25
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转载 iMeta | 尹佟明组和汪阳东组-开发用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包PMAT2
点击蓝字 关注我们PMAT2:用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包iMeta主页:http://www.imeta.science方法论文● 原文: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70064● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70064● 2025年7月1日,南京林业大学尹佟明和中国林科院汪阳东等在iMeta在线发表了题为“PMAT2:
2025-07-09 07:03:55
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原创 MicrobiomeStatPlots | 误差棒点图教程Error bar plot tutorial
颜色表示不同的队列,点表示用Fisher精确检验作为OR估计的效应大小,误差条表示95%的CI(Inova、CHILD和CP分别为n=203178和314)。在考虑了植物和环境变量后,真菌官能团内的多样性对生态系统稳定性的显著影响得以维持,这表明微生物多样性的稳定作用在现实世界的生态系统中是不可替代的(图3)。C:N,土壤碳氮比;在与CP和NDD相关的基因集中,在CP队列中观察到ExpansionHunter Denovo在与轴突引导和突触后密度相关的基因中检测到的大TR的过度传递(图2和补充表4)。
2025-07-09 07:03:55
615
转载 Bio-protocol | 近一年“生物信息”实验方案合集
Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台,通过与上百个国内优秀科研团队的合作,已出版了多本同行评审、免费获取的中文实验方案电子书。多种方法,重点展示不同生物样本的数据处理与组学分析、细胞显微成像技术优化,以及从序列组装、差异分析到代谢网络构建的实用工具与流程,希望能为研究人员提供思路与参考。,强调使用无需外源参照物的siQ-ChIP和标准化覆盖度方法,实现更严谨、可复现的蛋白–DNA互作信号定量与比较,适用于多种物种的研究。
2025-07-09 07:03:55
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转载 iMeta | 北京大学白凡组-揭示巨噬细胞内沙门氏菌表型耐药现象的机制
点击蓝字 关注我们巨噬细胞活性氧促进沙门氏菌蛋白质聚集体形成有助于抗生素耐药iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70059● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70059● 2025年6月22日,北京大学白凡课题组在iMeta在线发表了题为“Macrophage-d
2025-07-08 20:40:20
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转载 重磅消息!Bio-protocol正式拓展至生物信息学和计算生物学领域
是 Bio-protocol 旗下一份同行评审的国际学术期刊,专注于发表高质量的生命科学实验方案。该期刊已被PubMed Central、Web of Science 等国际权威数据库收录,是全球为数不多的拥有影响因子的生物学实验方案期刊之一。Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台,通过与上百个国内优秀科研团队的合作,已出版了多本同行评审、免费获取的中文实验方案电子书。Bio-protocol 于2011年在斯坦福大学创建,旨在提高科研的可重复性,以助力科学发现。
2025-07-08 20:40:20
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转载 iMeta | 中农任发政院士团队-益生菌改善终末期肾病患者预后的多维度解析
点击蓝字 关注我们益生菌恢复肠道HDL3分泌并改善终末期肾病患者的预后iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70062● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70062● 2025年7月1日,中国农业大学任发政院士、王晓玉副教授,岳麓山实验室印遇龙院士和中国航天科工集团
2025-07-08 20:40:20
467
转载 iMeta大会2025第一轮通知(8.23-25, 湖北武汉,早鸟价最后2周)
东院与东湖公园相邻,西院与珞珈山、磨山隔岸相望,院内高树如云,鸟语花香,鹭飞鹤翔,自然环境优美,政治人文资源丰厚,素有“湖北国宾馆”之称。张天缘、白德凤、彭凯、侯辉宇、马闯、朱志豪、曾美尹、罗豪、荀佳妮、杨海飞、周远平、周扬、徐锦波、王瑶、高云云、万锈琳、韩维、丁霞、魏勇军、许鹏飞、周文、刘亚勇、孟佳林、赵纪伟、于小晶、何天乐、赵婧瑄、陈怡、陶永富、沈鹤霄等,约。地铁:轨道交通4号线(武汉火车站-柏林方向),岳家嘴换乘轨道交通8号线(军运村方向),省博湖北日报站下车后步行2.2公里到达,全程约1小时。
2025-07-07 10:13:50
236
原创 纳米孔长读宏基因组简介及分析方法概述
纳米孔宏基因组测序数据的数据特征包括读长长、读长分布不均、准确性差等,因此相对应的分析方法不同于传统的二代高通量宏基因组测序,EasyNanoMeta的开发不仅补全了纳米孔宏基因组数据分析流程的空白,同时具备简单易用以及高度灵活的特征,能够满足不同人群的分析需求。EasyNanoMeta是一个专为纳米孔宏基因组数据分析设计的流程,该流程整合了超过100个不同的生物信息工具,能够实现从下机数据到结果汇总的全部分析。包括全部分析步骤的运行脚本,该脚本提供了详细的、可重复的纳米孔宏基因组分析步骤。
2025-07-06 07:01:42
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转载 iMeta|龚文平/张灵霞/刘艳华组-综述肠道微生物菌群与结核病互作机制
点击蓝字 关注我们肠道微生物菌群与结核病iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70054● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70054● 2025年6月22日,解放军总医院第八医学中心龚文平、张灵霞和刘艳华团队联合国内外22家单位的科研人员在iMeta在线发表了题为
2025-07-06 07:01:42
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转载 iMeta讲坛 | 李长超-如何打造高影响力论文:第一作者的全流程攻略(视频+PPT)
2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!如何打造高影响力论文:第一作者的全流程攻略。
2025-07-05 09:02:02
56
原创 MicrobiomeStatPlots | 分面排序堆叠柱状图教程Faceted sorted stack bar plot
根际和内生菌群的细菌负荷随着植物的发育呈现增加趋势,1-14天的细菌丰度相当(根际5.8×109 拷贝/g,内生菌群1.5×108 拷贝/g),但逐渐增加并在第72天达到最高丰度(根际2.3×1010 拷贝/g,内生菌群4.7×109拷贝/g)(图3,补充图6)。施肥处理对细菌负荷有显著影响(补充表 5),与对照相比,-P 处理根际的微生物负荷持续降低,尤其是在后期发育阶段,在第 42、60 和 72 天,细菌负荷分别减少了 54%、61% 和 75%(P < 0.05,图 3B)。
2025-07-05 09:02:02
973
转载 iMeta 近3年医学相关文章合集(25.06更新)
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!iMeta医学相关文章共106篇,涉及肠道菌群、高脂饮食、铜死亡、肺部、口腔、肿瘤、脂肪肝等方向。” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!
2025-07-04 07:03:15
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原创 MicrobiomeStatPlots | 批次效应矫正教程Batch effects correction
相关的软件或分析方法包括MMUPHin, Limma, emoveBatchEffect, ComBat, Surrogate Variable Analysis和PLASDA-batch等,这里介绍利用R语言中的MMUPHin软件包进行批次效应的观察和去除。批次效应的特点包括:1.数据不一致性:批次效应导致同样的生物样本在不同批次中产生不一致的测量结果。批次效应(Batch effect)往往是不同时间、不同操作者、不同试剂、不同仪器导致的实验误差,与研究中的生物或科学变量无关。组合多个子图为发表格式。
2025-07-04 07:03:15
836
转载 iMeta大会2025第一轮通知(8.23-25, 湖北武汉)
东院与东湖公园相邻,西院与珞珈山、磨山隔岸相望,院内高树如云,鸟语花香,鹭飞鹤翔,自然环境优美,政治人文资源丰厚,素有“湖北国宾馆”之称。地铁:轨道交通2号线(汉口火车站-佛祖岭方向),范湖站换乘轨道交通3号线(宏图大道方向),赵家条站换乘轨道交通8号线(军运村方向),省博湖北日报站下车后步行2.2公里到达,全程约1小时20分钟。8月23-25日在湖北武汉举行。白德凤、王瑶、周远平、朱志豪、罗豪、杨海飞、曾美尹、荀佳妮、张天缘、Salsabeel Yousuf等,约500余名参会的(青年)编委和科研同行。
2025-07-03 12:11:36
123
转载 会议|施春林:分会场十三-主编面对面(青岛7.5)
2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!长期从事植物发育和植物小肽信号传导的研究,在Nature Plants、Plant Cell、Molecular Plant、PNAS、JXB等期刊发表论文20余篇。” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!分会场十三:主编面对面。
2025-07-03 12:11:36
67
原创 MicrobiomeStatPlots | 边绑定图教程Edge Bundling Plot
与普通的network的差别在于,它使用曲线来展示节点间的连接,而非直线,并会把相同趋势的曲线捆绑再一起,就像整理数据线的“环”。边的颜色表示微生物节点和基因节点的Spearman相关性。结果显示,大多数与免疫相关的基因(如CXCL13)的表达水平与肿瘤内细菌(如牙龈卟啉单胞菌)的丰度呈负相关(见补充材料1中的图eFigure 17)。这里实现两种类型对象数据进行Spearman相关性检验,并通过筛选符合条件的r和p值数据,利用Edge Bundling图展示正负相关性,通过连线的粗细展示相关性的强弱。
2025-07-02 16:44:21
972
转载 iMeta讲坛20|李长超-如何打造高影响力论文:第一作者的全流程攻略
李长超,香港理工大学杰出博士后研究员,香港研资局新晋学者计划研究员。目前发表学术论文四十篇,其中以第一作者在Nature、The Innovation、iMeta、Environmental Science & Technology、Water Research等国际权威期刊上发表论文十余篇。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!
2025-07-02 16:44:21
33
转载 iMetaOmics|杨光/贾书磊等发布BioMGCore:在复杂微生物组中批量提取生物代谢基因簇
点击蓝字 关注我们BioMGCore:用于检测微生物组中生物代谢产物的工具包iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70036● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70036● 2025年6月22日,江苏海洋大学杨光副教授、天津医科大学贾书磊副教授等合作在iMetaOmics在线发表了题为“Bio
2025-06-30 17:13:24
87
转载 iMetaOmics | 高引论文10篇 (2025.6)
目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!
2025-06-29 07:03:19
125
转载 6.27世界微生物组日|看不见的“微力量”,正在重塑医学与生物技术
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。是 Wiley旗舰期刊 Advanced 系列中的一种完全开放获取的跨学科科学期刊,发表材料科学、物理、化学、医学、生命科学、环境科学、工程和社会科学等领域的前沿基础和应用研究。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!
2025-06-29 07:03:19
34
转载 iMeta 近3年生态环境类文章合集 (25.06更新)
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!iMeta近三年生态环境类相关文章共41篇,涉及干旱、高寒、草地、盐胁迫、微塑料等方向。
2025-06-28 07:03:45
112
原创 MicrobiomeStatPlots | 蜂窝图教程Hexbin Plot
蜂窝图的主要目的是更好的呈现高密度区域的数据趋势,并减少在这些区域可能出现的重叠。结果表明,与历史上的爪哇人和已灭绝的犀牛基因组相比,现在的犀牛基因组表现出显著较低的GWH(单因素方差分析,n=8,F=7.4,p=0.04)。图3.c,坍塌的DNA链在模拟耗竭、凝聚素耗竭和凝聚素耗竭的提取物中保持在一起的时间,其中纯化的凝聚素预加载到DNA上。与粘着蛋白缺失的提取物相比,在模拟缺失的提取物中,坍塌的姐妹DNA保持显著且可重复的关联时间更长,这表明粘着蛋白有助于子链的物理关联。
2025-06-28 07:03:45
964
转载 iMeta 近3年方法类文章合集 (25.06更新)
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585。” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!iMeta近三年方法相关文章共91篇,涉及在线工具、云平台、R包、软件、数据库等。
2025-06-27 07:02:58
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转载 iMeta 近3年动物类文章合集 (25.06更新)
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!
2025-06-26 07:04:21
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转载 MODA新文│植物与促生菌的“表观对话”
这些改变的表观遗传标记进而调控植物基因表达模式,包括参与植物代谢物合成(如根系分泌物)的相关基因。(植物根际促生菌)通过固氮、分泌激素、抗逆调控等方式,助力植物生长与抗逆,同时减少农药、化肥使用量,显著提升作物产量。蛋白编码基因)的甲基化修饰,激活其表达,从而促进根瘤分化与固氮功能;导致的植物表观遗传修饰的改变调控了哪些基因的表达,这些表达的基因如何影响代谢物的合成,进而影响根际分泌物和土壤的。在植物的根际土壤中,一场无声的。)修饰,使染色质维持开放状态,确保干旱胁迫下基因快速响应,显著提升植物存活率。
2025-06-26 07:04:21
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转载 Science|细菌中的高通量空间转录组学
Gao lab文献分享发表期刊Science发表年份2025文章题目Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria通讯作者Jeffrey R. Moffitt 教授 (波士顿儿童医院)原文链接DOI:10.1126/science.adr0932在复杂多变的环境中,细菌作为单细胞生物,其个体层面的表现影响细菌群体的行为模式。基于图像的转录组学方法可以为研究此类行为提供途径,但由于细菌mRNA的密度极高,这些方法也受到了一定的限制。为突破这一挑战,
2025-06-25 07:02:44
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转载 iMeta | 被引超9500次,发文308篇,平均引用31,百引耗时4天(2025/6/24)
引超4200次,百引耗时14天;根据 Dimensions 网站统计,截止2025年6月24日,iMeta 己发表论文308篇,被引9548,平均引用31,百引耗时4天。● iMeta | 被引超1400次,发文122篇,平均引用11.55,百引耗时18天(2023/10/5)● iMeta | 被引超2100次,发文151篇,平均引用13.96,百引耗时16天(2024/1/23)● iMeta | 被引超2800次,发文179篇,平均引用15.88,百引耗时16天(2024/4/17)
2025-06-25 07:02:44
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转载 中国科学院动物研究所冯桂海/王皓毅等合作揭示可变剪接调控干细胞多能性转化新机制
该发现不仅深化了对多能性调控网络的理解,也为干细胞重编程、早期胚胎发育异常及转座子相关疾病的研究提供了新靶点。本公众号现全面开放投稿,希望文章作者讲出自己的科研故事,分享论文的精华与亮点。事件,这些基因可以通过使用不同的第一个外显子产生naïve状态特异性(产生状态特异性异构体,不同的异构体通过招募不同的转录因子激活或抑制。发现基于剪接差异的细胞聚类与基于基因表达的结果一致,证实。学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。)事件在不同多能性状态间的关键作用,并发现了。
2025-06-25 07:02:44
61
原创 QIIME 2 2025.4视频教程7使用q2-ITSxpress插件修剪 ITS 序列的保守侧翼区域
我们将使用来自两个土壤样品的数据,这些样品的 ITS2 区域已用真菌引物扩增。用于快速修剪内部转录的间隔序列的软件,并具有标记基因分析的质量分数。ITSxpress 通过获取 FASTQ 数据、反复制序列,然后使用 HMMSearch 识别起始和终止位点(Rivers等, 2018)。在本教程中,我们将从两个双端样本开始,这两个样本已经拆分为正向和反向 FASTQ 文件。本公众号现全面开放投稿,希望文章作者讲出自己的科研故事,分享论文的精华与亮点。学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。
2025-06-24 07:04:22
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转载 iMeta | 徐艳组-多组学洞察表面电荷效应 解码纳米塑料与细菌抗生素耐药性的相互作用
点击蓝字 关注我们多组学洞察表面电荷效应解码纳米塑料与细菌抗生素耐药性的相互作用iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70056● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70056● 2025年6月14日,农业农村部环境保护科研监测所李厚禹、徐艳和法国里昂第一大学、日内瓦大学Wei Liu等
2025-06-24 07:04:22
116
转载 iMeta | 申莉莎组-解析METTL5调控脱落酸响应的机制
A抗体在结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.4,150 mM NaCl,0.5% NP-40)中孵育,缓冲液中添加RNase抑制剂,在4°C下轻轻旋转孵育2小时。孵育后,使用高盐洗涤缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.4,1 M NaCl,1 mM EDTA,1% NP-40,0.5%脱氧胆酸钠,0.1% SDS)洗涤珠子两次,再用洗涤缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 7.4,10 Mm MgCl。与METTL5相似,RPL24A介导GST基因的翻译效率(图2I)。
2025-06-23 07:03:25
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转载 QIIME 2 2025.4S视频教程6使用q2-FMT插件评估粪菌移植后的植入范围
在得到的云雨图中,我们看到在癌症治疗后(时间点 0-2),受体与供体的距离相对较远。在 FMT 干预后(时间点 3),受体与供体的距离变近了,两者的微生物组看起来更相似。(2)识别供体微生物组指示特征:找出在受体中定植的供体微生物组特征,帮助了解哪些微生物在移植后能够在受体中存活并发挥作用。(1)评估嵌合不对称群落融合:通过分析受体微生物组与供体微生物组的融合情况,判断移植后的微生物组是否成功定植。(3)分析时间稳定性:研究移植后微生物组随时间的变化情况,评估其在受体中的稳定性和持久性。
2025-06-23 07:03:25
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转载 iMetaOmics | 吉林大学付守鹏/郭文晋组-解析高脂饮食通过肠肝轴对孕期小鼠及其子代的影响
点击蓝字 关注我们高脂肪饮食对妊娠小鼠及其后代肝脏健康的影响:肠- 肝轴的作用iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70026● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70026● 2025年6月3日,吉林大学动物医学院付守鹏/郭文晋课题组在iMetaOmics在线发表了题为“The Impact
2025-06-22 15:35:18
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原创 QIIME 2 2025.4视频教程5使用q2-picrust2插件进行功能预测
本教程将重点介绍如何运行SEPP,它占用的内存较少。请添加主编微信meta-genomics带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。输出结果文件有ec_metagenome.qza-EC 宏基因组预测、ko_metagenome. qza-KO宏基因组预测和pathway_abundance.qza-MetaCyc 通路丰度预测。查看结果pathabun_core_metrics_out/bray_curtis_emperor.qzv,它显示了此数据集在食肉动物和啮齿动物之间的明显差异。
2025-06-22 15:35:18
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转载 2024年影响因子:全球微生物和生物技术期刊
2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!2024年影响因子: 全球微生物和生物技术期刊。
2025-06-20 07:04:39
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转载 Science:温度上升正在改变植物微生物群落的生态平衡
为了应对气候变暖带来的压力,科学家们正在探索利用有益的微生物(如开发微生物肥料或益生菌产品)来增强作物的抗热和抗病能力,减少对化肥农药的依赖。周围土壤(根际),虽然整体多样性变化不大,但具体种类发生更替:有益的真菌(比如帮助植物吸收养分的菌根真菌)数量大幅减少,而像根瘤菌这样能与豆科植物共生固氮的细菌却可能增多,这可能影响植物营养和全球氮循环。同时,高温还可能破坏植物地上部分(叶片微生物)和地下部分(根部微生物)的平衡,进而影响整个食物链(比如吃叶子的昆虫和分解土壤有机物的生物),威胁生态系统的稳定。
2025-06-20 07:04:39
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转载 2024年影响因子:中国SCI收录期刊
2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!2025年6月18日Clarivate发布了最新的期刊引证报告(Journal Citation Reports, JCR),官网显示2024年中国 (包括香港、澳门和台湾) SCI收录期刊共有600本,我们对影响因子排名前100的期刊进行了汇总,影响因子超过30分的有7本,较去年增加3本;
2025-06-19 07:07:27
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Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
空空如也
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