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刘永鑫的博客——宏基因组公众号

生物信息学-宏基因组学方向

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转载 iMeta 4卷3期封底:HER2抗体药物

期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。封面中破碎的楼房代表癌变的膀胱,膀胱内主要有三种膀胱癌细胞:①穿反光背心(表达HER2)的肿瘤细胞;直升机上的RC48-ADC通过头上的探照灯定位和监测穿反光背心的肿瘤细胞,从而使RC48-ADC有选择性地攻击表达HER2的肿瘤细胞。拿盾牌的肿瘤细胞具有抵抗RC48-ADC进攻的能力,在RC48-ADC的进攻中存活;” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2025-06-10 08:23:21 2

转载 《Cell》综述:人类微生物组研究中的单细胞方法

尽管单细胞细菌分离和培养以及单细胞DNA测序已成功应用于环境和人类相关微生物群,甚至存在一些商业平台,但微生物单细胞转录组学的研究努力仍主要集中在培养菌株上,因为复杂群落中仍有许多挑战需要解决,如细胞壁结构的多样性、mRNA丰度低或mRNA稳定性差。在一项初步研究中,使用该系统从六个人类粪便样本中分离出的约45个物种中,有一半被认为是基于配对16S rDNA宏基因组数据分析的低丰度(<0.2%)分类群,这表明这种类型的微阵列技术有可能恢复肠道微生物群中更罕见的成员。

2025-06-10 08:23:21 4

原创 MicrobiomeStatPlots | 冗余分析教程dbRDA analysis

尽管tb-RDA的应用拓展了RDA的适应范围,但无论常规的RDA或tb-RDA,样方或物种的降维过程实质上均以欧氏距离为举出。db-RDA首先基于物种多度数据计算相异矩阵,作为PCoA的输入,之后将所有PCoA排序轴上的样方得分矩阵用于执行RDA,而不再使用原始的物种数据以及解释变量直接作为RDA的输入。图 1 (C) 进行基于距离的冗余分析 (dbRDA),以可视化与 IBS 状态、年龄、性别、种族/民族、BMI、饮食类别和 HAD-焦虑 (HAD-A) 相关的 beta 多样性变化。

2025-06-09 23:00:16 656

转载 iMetaOmics 2卷2期封面:创生之光

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!以深邃的宇宙为背景,主视觉中一轮日食悬于天际,外围炽热的日冕光晕与暗影交织,象征高海拔地区强烈的紫外线对皮肤菌群的塑造与挑战。日食中心暗处如“放大镜”般聚焦,透出若隐若现的微生物星河,隐喻通过前沿组学技术揭开微生物“暗物质”的神秘面纱,探索微观生命的壮阔图景。iMetaOmics封面。

2025-06-09 23:00:16 26

转载 iMeta 4卷3期封面:微生态护卫联盟

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!六一儿童节的欢快脚步渐近,膳食纤维、益生菌、益生元、合生元与后生元悄然集结,宛若无形的"微生态哨兵",编织成一面透明的防护盾,借短链脂肪酸的魔法星尘,为肠道镀上天然守护光,将牛奶、鸡蛋等九大食物过敏原悄然阻隔。所有过敏的忧虑都消融在精灵们编织的梦幻气泡里,孩童的笑声在阳光下恣意绽放。

2025-06-08 07:18:08 91

转载 【2025肠道大会】6月8日学术分会场详细日程

是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2022年2月正式创刊!2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!

2025-06-08 07:18:08 66

转载 iMeta | 西安交大一附院戴晓峰组-低温常压等离子体医学研究中心

点击蓝字 关注我们基于 Hiplot 的低温常压等离子体高通量乳腺癌数据整合与分析平台iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70045● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70045● 2025年5月25日,西安交通大学第一附属医院戴晓峰,上海交通大学附属瑞金医院王铭杰等在iMeta在线

2025-06-07 09:14:25 361

原创 Cell Host & Microbe | 黄适/徐健/滕飞-菌斑微生物组时空变化进行单牙分辨率的全口早期儿童龋病预测

研究论文● 期刊:Cell Host & Microbe(IF:20.6)● DOI:https://doi.org/10.1016/j.chom.2025.05.006● 原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1931312825001854?via%3Dihub● 第一作者:Fang Yang, Fei Teng(滕飞), Yufeng Zhang● 通讯作者:Fei Teng(滕飞), Jian Xu(徐健), Shi

2025-06-07 09:14:25 614

转载 【2025肠道大会】6月7日开幕式-全体大会详细日程

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!第一次:6月6日14:00 - 6月7日10:00,现场扫码“报到”,同时填写个人基本信息。

2025-06-06 21:58:58 93

转载 iMeta | 浙江省农科院肖英平组建立不同年龄段中国儿童游离氨基酸参考区间

点击蓝字 关注我们中国儿童血浆游离氨基酸的年龄特异性参考区间及其与营养素摄入的关联性iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70051● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70051● 2025年5月29日,浙江省农业科学院肖英平、吕文涛和浙江大学医学院附属儿童医院陈维军等在iMeta在线

2025-06-06 21:58:58 61

转载 iMeta 2024年CiteScore23.2 (2025/6/4)

在Immunology and Microbiology下的Microbiology类别中,iMeta 2024 年排 7/188 ,百分位 96th,对比Nature Biotechnology 等顶级期刊,iMeta 作为2022 年起收录的新刊,与之同处于顶尖梯队,已成为同领域有影响力的学术期刊。近三年(2022 - 2024 )发文量逐年增加,2022 年 57 篇,2023 年 79 篇,2024 年 103 篇,活跃度与稿源吸引力显著提升。2024 年 CiteScore 达 23.2。

2025-06-05 07:07:05 36

转载 iMeta | 电子科技大学林昊/吕昊等-从DNA复制视角预测癌症三维染色质结构

点击蓝字 关注我们RepliChrom:基于DNA复制时序的癌症增强子-启动子互作可解释预测模型iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70052● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70052● 2025年5月27日,电子科技大学林昊、吕昊和新加坡南洋理工大学Melissa Fullwo

2025-06-05 07:07:05 219

转载 The Innovation | 53.4!CiteScore 2024

The Innovation已被DOAJ,ADS,Scopus,PubMed,ESCI,INSPEC,EI,中科院分区表(1区TOP)等收录。秉承“好文章,多宣传”理念,The Innovation刊群在海内外各平台推广作者文章。The Innovation Conference—“前沿科学创新大会”是由国际学术期刊The Innovation发起,围绕“征集问题—讨论问题—解决问题—发表成果—落地转化”的主线,采用圆桌会议模式,实现从“书架”到“货架”的应用转化落地,突破学科壁垒,增进人类福祉。

2025-06-05 07:07:05 72

转载 iMetaOmics | 赵鹏举/顾丽红等揭示鸡基因组结构变异的生物学作用

点击蓝字 关注我们单倍型分辨率基因组和泛基因组图谱揭示结构变异对鸡功能基因组和羽毛颜色的影响iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70027● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70027● 2025年5月24日,浙江大学海南研究院赵鹏举、海南省农业科学院顾丽红、美国农业部George E. L

2025-06-04 07:02:22 51

转载 诚邀宏转录组学合作伙伴:共建生命早期微生物组功能图谱 (>6000份样本,出生-青少年)

【重磅合作邀请】我们拥有全球稀缺的大规模、超长跨度(出生至青少年期)纵向出生队列资源,配套深度多维表型数据,现诚邀具备【宏转录组(meta-transcriptomics)】深度分析能力的顶尖团队/专家,携手解析生命早期微生物组功能动态及其对儿童健康的深远影响!该队列以其样本量大、时间跨度长、表型维度深的特点,为探索微生物组功能与宿主健康的机制联系奠定了坚实基础。期待与志同道合的伙伴携手,解锁生命早期微生物组功能的奥秘,共同推动儿童健康研究迈向新高度!请注明身份,另有海内外微生物PI群供大佬合作交流。

2025-06-04 07:02:22 17

转载 诚邀宏转录组学合作伙伴:共建生命早期微生物组功能图谱 (>6000份样本,出生-青少年)

【重磅合作邀请】我们拥有全球稀缺的大规模、超长跨度(出生至青少年期)纵向出生队列资源,配套深度多维表型数据,现诚邀具备【宏转录组(meta-transcriptomics)】深度分析能力的顶尖团队/专家,携手解析生命早期微生物组功能动态及其对儿童健康的深远影响!该队列以其样本量大、时间跨度长、表型维度深的特点,为探索微生物组功能与宿主健康的机制联系奠定了坚实基础。期待与志同道合的伙伴携手,解锁生命早期微生物组功能的奥秘,共同推动儿童健康研究迈向新高度!请注明身份,另有海内外微生物PI群供大佬合作交流。

2025-06-04 07:02:22 774

转载 iMeta | 被引超9000次,发文304篇,平均引用29.77,百引耗时5天(2025/6/2)

2023年4月1日,累计被引600次,百引耗时34天;根据 Dimensions 网站统计,截止2025年6月2日,iMeta 己发表论文304篇,被引9051,平均引用29.77,百引耗时5天。● iMeta | 被引超7900次,发文275篇,平均引用28.75,百引耗时2天(2025/4/11)● iMeta | 被引超7700次,发文272篇,平均引用28.37,百引耗时4天(2025/4/1)● iMeta | 被引超7800次,发文275篇,平均引用28.63,百引耗时8天(2025/4/9)

2025-06-03 07:02:34 27

转载 Cell Host & Microbe|干旱诱导的植物微生物组及代谢物富集提高耐旱性

四株细菌的植物生长促进特性(E)。箱线图展示了在天然土壤(反馈期1)下,三种处理(干旱、适宜水分、有无植物)在干旱和适宜水分条件下小麦生物量的变化(B)。气泡图展示了在干旱条件下与适宜水分条件相比,在沙质土壤(A)和黏质土壤(B)的总体土壤、根际及根部中显著增加的差异OTU。箱线图显示了沙质土壤中在三种条件(干旱前、干旱及适宜水分)下OTU4 (C)在三种组分(总体土壤、根际、根部)的相对丰度,以及黏质土壤中OTU13 (D)、沙质土壤中OTU1 (E)和黏质土壤中OTU40 (F)相对丰度的变化。

2025-06-02 07:02:31 110

转载 iMeta | 钟雯/李秋/徐涛/刘恩梅等西部联盟团队-西部贝贝出生队列

点击蓝字 关注我们中国西部地区多中心前瞻性出生队列研究iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70049● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70049● 2025年5月26日,重庆医科大学附属儿童医院联合广州国家实验室、成都妇女儿童中心医院、甘肃省妇幼保健院(甘肃省中心医院)、重庆医科大

2025-06-01 07:03:04 218

原创 MicrobiomeStatPlots | 曼哈顿图教程Manhattan plot tutorial

每个点代表表型与顺式遗传调节的血浆蛋白或基因表达水平之间关联的双侧 z 检验的 P 值,按 x 轴上的基因组位置和 y 轴上的关联强度的 −log10(P 值) 排序。最显著的附近 TWAS 基因标有其基因名称和相应的组织。在两个田块中,籼稻中富集的OTU属于广泛的细菌门,包括酸杆菌门、变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门和疣微菌门(FDR调整后的P<0.05,Wilcoxon秩和检验;在常见的应用中,曼哈顿图用于绘制p值,但是通过使用-log10(p)进行转换,使得较小的p值有更高的转换值。

2025-06-01 07:03:04 702

转载 iMeta 2023-2025年最高引论文30篇(2025.5更新)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!iMeta 2023-2025年最高引论文30篇。

2025-05-31 07:03:26 63

转载 【2025博士招生】广东医科大学李雪萌课题组诚招博士生(6月5日12:00前有效)

请添加主编微信meta-genomics带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。有意者请将详细个人简历【包括但不限于:个人基本情况、教育经历、主要研究成果(论文、专著、专利、奖励、成果证书等)、承担及参与项目、联系方式等】以及能体现个人科研能力和学术水平的相关资料。要从事微生物学挖掘及医学检测的相关研究,包括人体微生物菌群与健康衰老机制研究、肠道相关细菌分离培养及功能鉴定及血清代谢物的抗衰老功能验证等。本公众号现全面开放投稿,希望文章作者讲出自己的科研故事,分享论文的精华与亮点。

2025-05-30 13:45:41 86

原创 Advanced Science | 安徽农大刘威组揭示果蝇与共生菌协同抑制机会致病菌新机制

本研究结合混池和单细胞RNA测序技术,基于集成的果蝇-共栖菌-病原菌模型系统,探讨了果蝇共栖菌与病原菌的表型异质性,凸显了生态系统中三方关系的复杂性。更重要的是,在果蝇和植物乳杆菌的双重压力下,粘质沙雷氏菌群体适应性地分化为高毒力和低毒力亚群,伴随着抗性异质性的增加。单细胞分析显示,幼虫和病原菌刺激下,糖酵解相关基因表达存在异质性,部分亚群表达更高(图6C-G)。在包含果蝇幼虫、植物乳杆菌和粘质沙雷氏菌的三物种模型中,幼虫促进植物乳杆菌的生长和乳酸产量,增强其对粘质沙雷氏菌的定植抵抗(图2A)。

2025-05-29 19:15:37 854

转载 iMeta | 南农土壤生态实验室-解析噬菌体介导的全球沙门氏菌毒力基因传播

点击蓝字 关注我们全球病毒组介导沙门氏菌毒力基因传播和宿主反馈机制iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70042● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70042● 2025年5月20日,南京农业大学孙明明和加泰罗尼亚水研究所Jose Luis Balcazar等在iMeta在线发表了题

2025-05-29 19:15:37 178

转载 iMetaOmics | 青能所徐健/张佳-基于拉曼流式细胞术评估益生菌质量

点击蓝字 关注我们基于拉曼流式细胞术的益生菌产品单细胞精度菌种鉴定、活菌计数及活力检测 iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70024● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70024● 2025年5月19日,青岛生物能源与过程研究所张佳、王建美、朱鹏飞、刁志钿等在iMetaOmics在线发表了

2025-05-28 23:20:55 186

转载 顶刊神器,绝对定量,绝对价格!99元惊爆价,三套数据,能绝对何必相对!

上海昊为泰生物以创新破局,正式推出基于华大国产测序平台的微生物扩增子绝对定量测序和相对定量测序服务!技术性能对标国际水准,价格直降一半,让我们以更普惠的价格,护航您的微生物精准研究!中文题目:沼液和生物炭配施通过增强反硝化和厌氧甲烷氧化作用减少了水稻土中的温室气体排放。中文题目:中国玉米种植系统肥料氮素回收效率变化的驱动因素及其微生物机制。中文题目:浓缩厌氧消化接种物的策略:关注产甲烷生成效率和微生物活性。)分析,表示不同土壤之间细菌群落的差异。:细菌群落结构和组成。)在门水平上主要分类群(

2025-05-27 10:03:12 331

转载 iMetaOmics | 北京大学卢言慧组- 2型糖尿病和阿尔茨海默病的肠道微生物群及其代谢产物

点击蓝字 关注我们2 型糖尿病和阿尔茨海默病中肠道微生物群及其代谢产物的变化及机制见解iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imo2.70020● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70020● 2025年5月11日,北京大学卢言慧等人在iMetaOmics在线发表了题为“Alteration

2025-05-27 10:03:12 132

转载 iMetaOmics | 同济大学刘思航开发宏病毒组学一站式高效快速分析流程

点击蓝字 关注我们ViOTUcluster:适用于宏病毒组学的一站式高效快速分析流程iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70023● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70023● 2025年5月20日,同济大学刘思航等在iMetaOmics在线发表了题为“ViOTUcluster: A Hi

2025-05-25 07:53:52 206

转载 iMeta | 王春莉/董念国/王贵学/许康 解析肠道菌群影响脉瓣膜钙化的创新机制

点击蓝字 关注我们肠道微生物群来源的丁酸通过调节GAPDH乳酸化和丁酰化进而抑制钙化性主动脉瓣疾病进程iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70048● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70048● 2025年5月19日,湖北中医药大学许康、王春莉联合重庆大学王贵学、武汉协和医院董念国

2025-05-24 08:55:44 142

原创 Cell | 肠道微生物组介导膳食植物小分子的功能多样性转化

研究论文● 期刊:Cell (IF:45.5)● DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.01.045●原文链接: https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.01.045 ● 第一作者:Gavin A. Kuziel, Gabriel L. Lozano● 通讯作者:Seth Rakoff-Nahoum (seth.rakoff-nahoum@childrens.harvard.edu)● 发表日期:2025-3-7● 主要单位:美国马萨

2025-05-24 08:55:44 974

转载 【2025肠道大会】学术详细日程重磅发布!

肠道内分泌细胞中Secretagogin的缺失会引发肠道菌群失调和年龄相关性糖尿病,并通过损害12,13-diHOME的生成来限制产热作用。miR-29通过调控CD8+ T细胞中岩藻糖基化介导的Ras-GTP-ERK1/2-Fos信号通路,促使结肠癌实现免疫逃逸。妊娠期循环亚油酸与肠道菌群相互作用对妊娠期糖尿病的影响:基于同济-华西-双流出生队列的分析。微生物诱导的 S100B-RAGE 轴介导肠胶质细胞与巨噬细胞之间的串扰并促进结肠炎的发生。

2025-05-23 08:55:57 172

转载 iMeta | 南方医院丁轶组- 靶向“放化疗高应答”患者乳杆菌:放化疗性肠损伤防治新策略

点击蓝字 关注我们“放化疗高应答”患者肠道来源乳杆菌通过蛋氨酸驱动表观遗传修饰缓解放化疗性肠损伤iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70043● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70043● 2025年5月14日,南方医科大学南方医院丁轶、中国人民解放军南部战区总医院刘志锋和南方医科

2025-05-23 08:55:57 913

转载 iMetaOmics | 曹务春/任丽丽/陈玉国-面向蜱病毒组及新发蜱媒病毒的研究:方案、挑战与展望

美国国立卫生研究院(NIH)高度重视蜱媒疾病带来的公共卫生挑战,于2019年发布了《蜱媒疾病研究战略计划》,旨在加速多领域协同研究、深化对蜱媒疾病的认知,并推动有效诊断、预防和治疗工具的研发。为此,我们提出了一套标准化研究方案,涵盖现场调查、样本处理、测序文库构建、病毒组装、系统发育分析和分类鉴定,为蜱病毒组研究提供了统一框架。比较不同蜱种、发育阶段及吸血状态的病毒组特征,能阐明蜱在病毒传播中的作用,并揭示病毒在蜱体内及蜱-宿主间的关键传播线索。标准化的蜱病毒组研究流程可实现新发病毒的主动监测与进化溯源。

2025-05-22 07:02:05 146

转载 高级转录组分析和R数据可视化 (2025.8)

易生信团队独创实现了跨平台的分析流程,在大家的Windows笔记本上可以轻松实现转录组统计、可视化的绝大多数分析,课程带你轻松在自己的本本上搭建数据表统计分析与可视化平台,基于目前最主流的Win10进行优化和测试,让笔记本秒变数据分析可视化平台。针对很多老师缺少系统的生信背景,看不懂分析文章图表,更对绘制各式图表手足无措的情况,在培训时,我们将结合发表的高水平文章,进一步讲解16种常用分析图的原理和使用范围,让你不仅读懂图,更知道如何应用于自己的研究,并亲自轻松完成绘图。基础知识,保证你完成项目分析。

2025-05-22 07:02:05 78

转载 iMeta | 中国农大曹志军组-解析奶业系统中奶牛-犊牛胃肠道抗性组的传播

shiyan点击蓝字 关注我们奶牛“母子”模型中胃肠道抗性组的时空特征及其在奶业生产系统中的环境传播iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70047● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70047● 2025年5月14日,中国农业大学曹志军课题组在iMeta在线发表了题为“Spatio-

2025-05-22 07:02:05 126

转载 Nat Commun | 王亚楠/高福等合作发布全球沙门菌耐药图谱,揭示百年耐药驱动因素

万个沙门菌基因组数据进行分析,首次绘制了全球尺度、高分辨的沙门菌遗传图谱,揭示了百年耐药趋势与驱动因素(如抗生素使用、农业活动、气候变化、环境卫生、城市发展、基础设施、国际贸易和社会经济等因素)。多种沙门菌血清型基因组耐药基因个数呈现增加的趋势,如阿贡纳、鸭、德尔卑、都柏林、海德堡、鼠伤寒单相变种、婴儿、肯塔基、姆班达卡、慕尼黑、山夫登堡和伤寒。(图4),研究还发现多种因素,如动物和人类的抗生素消费、农业活动、气候变化、环境卫生、城市发展、基础设施、国际贸易和社会经济等因素与沙门菌。

2025-05-21 14:41:38 205

转载 iMeta | 2025年4月数据分析报告:全文单月下载量创历史新高

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!iMeta发行以来,207个国家或地区共下载了相关文章,其中中国(包括香港、台湾和澳门)下载量达58万次,位居第一;” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!根据wiley网站统计,截止2025年4月,iMeta文章投稿量。

2025-05-20 07:16:07 108

转载 Advanced Science | 西北农林科技大学韦革宏/焦硕组:基于性状的生活史策略塑造细菌生态位宽度

研究论文● 期刊:Advanced Science(IF:14.3)● DOI:https://doi.org/10.1002/advs.202405947● 原文链接:https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/advs.202405947● 第一作者:彭子恒● 通讯作者:韦革宏(weigehong@nwsuaf.edu.cn); 焦硕(shuojiao@nwsuaf.edu.cn)● 发表日期:2025-05-08● 主要单位:西北

2025-05-20 07:16:07 163

转载 iMetaOmics | 张磊/宁康团队-迁移学习识别用于2型糖尿病跨区域诊断的及阶段特异性膳食纤维干预的细菌特征

点击蓝字 关注我们迁移学习识别用于2型糖尿病跨区域诊断的及阶段特异性膳食纤维干预的细菌特征iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imo2.70021● DOI: http://doi.org/10.1002/imo2.70021● 2025年4月21日,山东大学张磊和华中科技大学宁康等在iMetaOmics在线发表了题为“Tr

2025-05-20 07:16:07 101

转载 俄亥俄州立大学Dr.Shanlin Ke课题组博后学生招生

博士毕业后,他继续在刘教授的实验室担任博士后研究员,专注于微生物组研究。成功的申请者需具备博士学位,并具有以下领域之一或多个的扎实背景:宏基因组学、分子微生物学、生物信息学、机器学习、胰腺疾病、体内和体外实验。他的长期目标是通过体外和体内实验,将计算发现与治疗应用相结合,推动基于微生物组的治疗方法的发展。人类疾病中的人类-微生物组相互作用:特别是胰腺疾病(如胰腺炎和胰腺癌)中的微生物组的作用机制。微生物组数据中的生物信息学与机器学习:开发和应用先进的计算工具,解析复杂的微生物组数据。

2025-05-19 06:37:09 66

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909),可下载后解压,替换Windows中R语包安装目录,如我的文档,R,win-libarary,4.0

2020-09-09

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