Image registration (longitudinal studies) in SPM

主要阅读下面的这一篇paper,关于怎么用 spm 12 中新增的 toolbox 做的 longitudinal registration,然后在这里面提到的一些概念的解读以及data的来源都可以在下面的网页中找到。


这篇paper 是:Symmetric diffeomorphic modeling of longitudinal structural MRI

John Ashburner* and Gerard R. Ridgway   2013 frontiers in neuroscience


首先这个功能只有在 spm 12 中才有


那么里面提到的几个概念可以看下面:

1. image registration

可以直接看 wikipedia ENG. 版本


2. rigid-body transformation

依然是 wikipedia的 理论 https://en.wikipedia.org/wiki/Rigid_body_dynamics

以及 牛顿的 水桶  https://www.jianshu.com/p/da05201a4b88


3. inhomogeneity correction

在 BrainVoyger的官网上有详细的解释,以及在这个软件中也可以操作

http://www.brainvoyager.com/bvqx/doc/UsersGuide/Segmentation/IntensityInhomogeneityCorrection.html


4. Diffeomorphic

这个是 数学上的 微积分同胚

主要概念看知乎的解释  https://www.zhihu.com/question/27551225

和中文的维基百科 https://zh.wikipedia.org/wiki/%E5%BE%AE%E5%88%86%E5%90%8C%E8%83%9A

但是呢,因为这是一个涉及到牛顿的时空概念,所以可以看简书上的一个关于时空概念的解读

https://www.jianshu.com/p/da05201a4b88


然后是,这篇paper后面有用 mri real data 来进行测试这个toolbox,那么这些data可以自行download

分别是 longitudinal和 cross-section的data   http://www.oasis-brains.org/





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