主要阅读下面的这一篇paper,关于怎么用 spm 12 中新增的 toolbox 做的 longitudinal registration,然后在这里面提到的一些概念的解读以及data的来源都可以在下面的网页中找到。
这篇paper 是:Symmetric diffeomorphic modeling of longitudinal structural MRI
John Ashburner* and Gerard R. Ridgway 2013 frontiers in neuroscience
首先这个功能只有在 spm 12 中才有
那么里面提到的几个概念可以看下面:
1. image registration
可以直接看 wikipedia ENG. 版本
2. rigid-body transformation
依然是 wikipedia的 理论 https://en.wikipedia.org/wiki/Rigid_body_dynamics
以及 牛顿的 水桶 https://www.jianshu.com/p/da05201a4b88
3. inhomogeneity correction
在 BrainVoyger的官网上有详细的解释,以及在这个软件中也可以操作
http://www.brainvoyager.com/bvqx/doc/UsersGuide/Segmentation/IntensityInhomogeneityCorrection.html
4. Diffeomorphic
这个是 数学上的 微积分同胚
主要概念看知乎的解释 https://www.zhihu.com/question/27551225
和中文的维基百科 https://zh.wikipedia.org/wiki/%E5%BE%AE%E5%88%86%E5%90%8C%E8%83%9A
但是呢,因为这是一个涉及到牛顿的时空概念,所以可以看简书上的一个关于时空概念的解读
https://www.jianshu.com/p/da05201a4b88
然后是,这篇paper后面有用 mri real data 来进行测试这个toolbox,那么这些data可以自行download
分别是 longitudinal和 cross-section的data http://www.oasis-brains.org/