学校的服务器费拉不堪,无论我如何设置conda的镜像源都下载不了软件,所以我只好去软件的官网或github上下载程序或代码。
显然,这种方法有一个缺点,就是比较麻烦。下载、解压后还需要自己在bashrc中设置环境变量,才能在别的工作路径中使用该软件。
之前按网上设置环境变量的方法,加入程序的可执行路径,但是就是不成功,令我捉急了很久。
export PATH='/home/user/XXX/XXX/XXX:'$PATH
无意中我发现了一种新方法,更像windows中的快捷方式,还可以自定义名字:alias
使用方法简单,先打开bashrc文件
vim ~/.bashrc
alias plink='/home/xiang/biosoft_package/plink/plink'
alias star="/home/xiang/biosoft_package/STAR-2.7.8a/bin/Linux_x86_64/STAR"
alias gcta='/home/xiang/biosoft_package/gcta_1.94.0beta/gcta64'
alias gatk='/home/xiang/biosoft_package/gatk-4.0.10.1/gatk'
alias gemma='/home/xiang/biosoft_package/gemma-0.98.1-linux-static'
在文件末尾,加上所需文件的可执行路径,再自定义一个你喜欢的名字就可以了。
相比于添加环境变量的方法,免去了打上一大坨字符的麻烦。