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RSS订阅原创 从Ensemble来源的基因注释信息抓取人类基因组上5号染色体的编码miRNA基因并统计数量
1.首先得到人类基因组注释文件并解压wget -c ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human/release_29/gencode.v29.annotation.gtf.gzgunzip -f gencode.v29.annotation.gtf.gz2.从中抓取出5号染色体的注释信息并新建一个注释文件grep chr...
2019-05-23 14:10:46
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原创 MCAS2安装及遇到问题解决
MCAS2安装及遇到问题解决MACS2（Model-based Analysis for ChIP-Seq）介绍：由Tao Liu实验室开发的一款在ubuntu上运行的专门处理CHIP-Seq数据的下游软件，是bowtie2处理数据得到sam文件后，或者samtools处理数据后的下游工具。官网 网上下载安装方式很多，推荐使用python从源代码安装，首先在python的软件包网站pypi使...
2018-08-19 11:18:00
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