题意:
给定两个基因,对比两个基因的相似度。即给定一个表,行列项均为ACTG-,表示基因,表内数字表示行和列对应基因的相似度,-为空。先给定两个字符串表示基因a和b,长度分别为n和m,我们可以在字符串中间加入-,使得两个字符串长度相同;现在问通过加入-,最大的基因相似度是多少?
题解:
dp题目,dp[i][j]表示用了a串用了前i个字符,b串用了前j个字符的情况下,得到的最大基因值。答案就是dp[n][m]。
由于‘-’不能和‘-’配对,所以可以得出dp公式:dp[i][j]=max(dp[i-1][j-1]+get_num(a[i-1],b[j-1]),dp[i-1][j]+get_num(a[i-1,]'-'),dp[i][j-1]+get_num('-',b[j-1]));
代码:
#include <iostream>
#include <queue>
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <algorithm>
#include <ctime>
#include <vector>
#include <cmath>
#include <map>
#include <cstdlib>
using namespace std;
const int maxn=110;
int dp[maxn][maxn];
int e[5][5]={
{5,-1,-2,-1,-3},
{-1,5,-3,-2,-4},
{-2,-3,5,-2,-2},
{-1,-2,-2,5,-1},
{-3,-4,-2,-1,-100000}};
map<char,int>mm;
char a[maxn],b[maxn];
void init()
{
mm['A']=0;mm['C']=1;mm['G']=2;mm['T']=3,mm['-']=4;
}
int get_num(char a,char b)
{
return e[mm[a]][mm[b]];
}
int main()
{
init();
int T;
scanf("%d",&T);
while(T--)
{
int i,j,k,n,m;
scanf("%d%s%d%s",&n,a,&m,b);
memset(dp,0,sizeof(dp));
for(i=1;i<=n;i++)
dp[i][0]=dp[i-1][0]+get_num(a[i-1],'-');
for(i=1;i<=m;i++)
dp[0][i]=dp[0][i-1]+get_num('-',b[i-1]);
//printf("%s %c\n",a,a[3]);
//printf("%d %d\n",get_num('-',b[1]),dp[0][2]);
for(i=1;i<=n;i++)
{
for(j=1;j<=m;j++)
{
//printf("%d\n",j);
dp[i][j]=max(dp[i-1][j]+get_num(a[i-1],'-'),dp[i][j-1]+get_num('-',b[j-1]));
dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+get_num(a[i-1],b[j-1]));
}
}
printf("%d\n",dp[n][m]);
}
return 0;
}