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韦恩图绘制的常用工具
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datamash 教程
热爱美食的朋友们,安利我朋友目前正在运营的一个美食餐厅公众号:douke_home也非常欢迎大伙儿前来我朋友餐厅探索美味,这是豆壳餐厅地址:苏州市姑苏区学士街418号(距苏州地铁1号线养育巷站3号口390m)文章目录GNU Datamash 1.3简介安装参数详解获取帮助信息参数解释参数选项操作注释实例1. Summary Statistics2. Header Lines and Colum...翻译 2019-07-26 10:53:07 · 1579 阅读 · 0 评论 -
Salmon之Fragment Library Types
library类型library类型可以分解为三个部分:reads的相对方向,library的链型和reads的方向性。如下图所示: reads的相对方向I = inwardO = outwardM = matchinglibrary的链型S = strandedU = unstrandedreads的方向性注意:此项的应用前提是:建库时采用的是stra...翻译 2018-03-22 10:00:57 · 409 阅读 · 0 评论 -
Salmon---a tool for wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
Salmon 概述该软件采用新的双阶段(dual-phase)统计推断程序,以及针对每个样本存在sequence-specific, fragment GC-content, 和 positional biases而应用的sample-specific bias models。该软件由三个部分组成: 一个轻量级的 mapping model, 一个估计初始表达水平的在线阶段( an on...翻译 2018-01-25 22:00:37 · 4829 阅读 · 0 评论 -
StringTie
StringTie参考链接:https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input参数简介翻译 2017-12-04 15:38:46 · 4927 阅读 · 2 评论 -
STAR manual
来源:STARmanual.pdf 来源:Calling variants in RNAseqPART0 准备工作 #STAR 安装前的依赖的工具 #Red Hat, CentOS, Fedora. sudo yum update sudo yum install make sudo yum install gcc-c++ sudo yum i翻译 2017-03-16 10:33:03 · 1769 阅读 · 1 评论 -
Circos 教程___001
安装篇官方安装指导资料 寂寞先生___Circos教程系列由于官方文档基于 Ubuntu和windows给出安装指导,而我平时使用的系统CentOS6.5,所以不得不进行如下操作:perl -v### This is perl, v5.10.1 (*) which perl### /usr/bin/perlsudo yum install gd gd-devel#查看哪些模块需要被安装原创 2017-07-25 14:55:10 · 923 阅读 · 0 评论 -
MultiQC使用指导
MultiQC教程翻译 2017-08-15 22:26:12 · 11206 阅读 · 0 评论 -
OrthoMCL Pipeline 安装
文章目录安装OrthoMCL Pipeline安装perl模块安装其依赖软件数据库设置忘记mysql 密码的解决方案测试运行安装OrthoMCL Pipeline# 下载安装包wget -c https://github.com/apetkau/orthomcl-pipeline/archive/master.zip安装perl模块# 如果如果安装成功,需要单独安装cpanm Bio...原创 2019-09-12 23:16:37 · 2464 阅读 · 1 评论