韦恩图绘制的常用工具

var1var2var3var4var5var6
col1col1txxmoivexxcol5
col2scol1ncol5music
col3nscol1loveada
sadacol3col10chrin
col5lovexxcol2nalpha

针对多组数据找彼此间的交集(intersection),常用的R包:
1. 小于等于5 个集合:
VennDiagram包
使用教程:http://blog.qiubio.com:8080/archives/2603
或者使用其在线工具:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

EulerAPE

2.大于5个集合:
InteractiVenn(2-6 set data): http://www.interactivenn.net/

Heberle, H.; Meirelles, G. V.; da Silva, F. R.; Telles, G. P.; Minghim, R. InteractiVenn: a web-based tool for the analysis of sets through Venn diagrams. BMC Bioinformatics 16:169 (2015).

VENN DIAGRAMS(2-6 set data): http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
http://bioinformatics.psb.ugent.be/beg/tools/venn-diagrams
http://bioinformatics.psb.ugent.be/beg/

UpSetR包
或者使用其在线工具:http://vcg.github.io/upset/

#Download
#Install the latest released version from CRAN
install.packages("UpSetR")

#Download the latest development code of UpSetR from GitHub using devtools with
devtools::install_github("hms-dbmi/UpSetR")
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值