- 博客(67)
- 收藏
- 关注
RSS订阅转载 从输入 URL 到页面加载完的过程中都发生了什么事情？
1）把URL分割成几个部分：协议、网络地址、资源路径。其中网络地址指示该连接网络上哪一台计算机，可以是域名或者IP地址，可以包括端口号；协议是从该计算机获取资源的方式，常见的是HTTP、FTP，不同协议有不同的通讯内容格式；资源路径指示从服务器上获取哪一项资源。 例如：http://www.guokr.com/question/554991/ 协议部分：http 网络地址：www.guo...
2015-07-29 20:28:00
228
转载 R语言中的if-else语句写法
结构 1 ： if() xx else yy 一行；结构 2： if() {xx} else {yy} 或者 if(){ xx }else #此处不能两行写 ...
2015-07-27 12:26:00
6418
转载 AP聚类算法(转)
Affinity Propagation (AP) 聚类是2007年在Science杂志上提出的一种新的聚类算法。它根据N个数据点之间的相似度进行聚类,这些相似度可以是对称的,即两个数据点互相之间的相似度一样(如欧氏距离);也可以是不对称的,即两个数据点互相之间的相似度不等。这些相似度组成N×N的相似度矩阵S(其中N为有N个数据点)。AP算法不需要事先指定聚类数目,相反它...
2015-07-27 10:56:00
295
转载 如何在Eclipse下安装myeclipse插件
来自http://www.blogjava.net/show911/archive/2008/04/27/86284.html下载myeclipse插件支持eclipse3.1.x， 具体安装步骤：下载完成后，开始安装：1. 选择任意你的喜欢所在目录(根目录 如：E:\eclipse)，其它都点下一步，默认安装。2.安装完毕之后，找到myeclipse的安装目...
2015-05-13 14:25:00
223
转载 升级R版本后，更新Package
升级R版本后，若重新安装所有的package将非常麻烦，可以尝试运行一下程序：1）在旧版本中的R中运行#--run in the old version of R setwd("C:/Temp/") #注意要在C盘中新建Temp文件夹 packages <- installed.packages()[,"Package"] save(packages, file="...
2015-04-14 11:20:00
1119
转载 Ubuntu命令
查看ubuntu版本号方法一：cat /etc/issue返回结果：Ubuntu 6.06.2 LTS \n \l方法二：sudo lsb_release -a返回结果：No LSB modules are available. Distributor ID: Ubuntu Description: Ubuntu 6.06.2...
2015-04-10 09:59:00
124
转载 WGCNA算法研究笔记
转自：http://www.gogoqq.com/ASPX/8390905/JournalContent/1303140588.aspx研究了近半年的算法，记录下来给自己一个交代，也应该是考G前地最后一篇日志了。 Weighted Gene Co-Expression Network Analysis中文名有翻译成加权关联网络分析的，感觉不是很恰当，英文来得比较直接。本来...
2015-04-03 22:52:00
335
转载 Pearson相关系数
理解皮尔逊相关的两个角度其一, 按照高中数学水平来理解, 皮尔逊相关（Pearson Correlation Coefficient）很简单, 可以看做将两组数据首先做Z分数处理之后, 然后两组数据的乘积和除以样本数Z分数一般代表正态分布中, 数据偏离中心点的距离.等于变量减掉平均数再除以标准差.(就是高考的标准分类似的处理)标准差则等于变量减掉平均数的平方和,再除以样本数,...
2015-01-20 15:32:00
216
转载 JAVA中用于处理字符串的“三兄弟”
JAVA中用于处理字符串常用的有三个类：java.lang.String、java.lang.StringBuffer、java.lang.StringBuilder，这三者的共同之处都是final类，不允许被继承，这主要是从性能和安全性上考虑的，因为这几个类都是经常被使用着的，且考虑到防止其中的参数被修改影响到其它的应用。StringBuffer与StringBuilder两个基本上差...
2015-01-02 22:00:00
117
转载 相关系数
相关系数：考察两个事物（在数据里我们称之为变量）之间的相关程度。如果有两个变量：X、Y，最终计算出的相关系数的含义可以有如下理解：(1)、当相关系数为0时，X和Y两变量无关系。(2)、当X的值增大（减小），Y值增大（减小），两个变量为正相关，相关系数在0.00与1.00之间。(3)、当X的值增大（减小），Y值减小（增大），两个变量为负相关，相关系数在-1.00与0.00...
2014-12-19 15:57:00
563
转载 fold change(ratio)
fold change英文简称 : FC中文全称 : 倍性变化所属分类 : 生物科学词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如，第一个样本和第二个样本的量是50/10，那么FC（Ratio）就是5，反之就是0.2。用这种方法分析微阵列的数据可以说明：1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的；2）这种方法可以说明基因表达变化是...
2014-12-12 10:48:00
1712
转载 Win7快捷键
F2 重命名选定的项目桌面上右键+N 下一个桌面背景ALT+F4 关闭当前应用程序Win+L：如果你连接到网络，则锁定计算机，如果没有连接到网络的，则切换用户Win+D：切换桌面显示窗口或者gadgets小工具Win+Tab：3D切换窗口Win+M：快速显示桌面,最小化所有窗口Win+R：打开运行窗口Win+Space：桌面窗口透明化显示桌面，如果开...
2014-11-25 16:21:00
77
转载 卡方检验
http://baike.baidu.com/view/852140.htm?fr=aladdinhttp://baike.baidu.com/link?url=dRHhreYsYLHNBYIb8GA5wQjG5hLQqXMDhIw7hPYgMpNG4bJMSxfbQ7gY9NR-4VSjQp_jqlAitiR8zVKglOGJ5ahttp://zh.wikipedia.org/...
2014-10-09 18:02:00
189
转载 Bonferroni校正法
Bonferroni校正：如果在同一数据集上同时检验n个独立的假设，那么用于每一假设的统计显著水平，应为仅检验一个假设时的显著水平的1/nhttp://baike.baidu.com/view/1217813.htm?fr=aladdinBonferroni校正法: 此方法是在进行两两比较时对检验水准进行调整的办法，但是该方法在比较的次数较多时，就不太适合，因为校正后的检验...
2014-10-08 17:06:00
9437
转载 职业定位(系统运维、架构师、测试)
系统运维系统运维：http://baike.baidu.com/view/5427870.htm?fr=aladdin运维工程师：http://baike.baidu.com/view/3118292.htm?fr=aladdin系统运维秘诀大分享：http://os.51cto.com/art/201101/244021.htm系统运维工程师：1、对Linux...
2014-09-27 18:10:00
91
转载 职业定位(云计算、并行计算、分布式计算)
云计算云计算：http://baike.baidu.com/view/1316082.htm云平台：http://baike.baidu.com/view/3749171.htm?fr=aladdin云平台 开发 Intel官网：http://www.intel.cn/content/www/cn/zh/cloud-computing/hybrid-cloud-solutio...
2014-09-27 12:10:00
92
转载 职业定位(移动端、ios开发、Android开发)
移动端移动端webapp开发必备知识：http://www.chinaz.com/manage/2012/1128/283974.shtml设计一款好的移动App，有哪些基本规则？http://www.uisdc.com/rules-about-apps经验分享：移动端设计开发流程：http://www.uisdc.com/mobile-design-process经验分...
2014-09-27 11:20:00
118
转载 职业定位(Web前端、后台、PC端)
Web前端Web前端开发工程师：http://baike.sogou.com/v18499271.htmWEB前端开发面试题集锦：http://wenku.baidu.com/view/47bbcbdc50e2524de5187eae.html浅谈前端开发的水有多深：http://www.w3cfuns.com/blog-5446428-5400629.html前端网：h...
2014-09-26 11:56:00
164
转载 数据缺失值的4种处理方法
一、缺失值产生的原因缺失值的产生的原因多种多样，主要分为机械原因和人为原因。机械原因是由于机械原因导致的数据收集或保存的失败造成的数据缺失，比如数据存储的失败，存储器损坏，机械故障导致某段时间数据未能收集（对于定时数据采集而言）。人为原因是由于人的主观失误、历史局限或有意隐瞒造成的数据缺失，比如，在市场调查中被访人拒绝透露相关问题的答案，或者回答的问题是无效的，数据录入人员失误漏录了...
2014-09-22 11:26:00
10496
转载 Borda count
波达计数法（Borda Count）是较为简单的排序投票法，每个选项借由选票上的排序来取得积分，积分最高者获胜。另一个类似的方法则是位置投票制。投票人按喜好排列候选者。如果候选者在选票的排第一位，它就得某个分数；排第二位得一个较小的分数……如此类推。分数累计下来最高分的候选者便取胜。名字的由来：历史上有许多人曾提出使用波达计数法。它曾是罗马议会采用的投票制度之一。13世纪的雷...
2014-09-18 17:17:00
395
转载 降维中的特征选择(转)
在数据挖掘过程中，高维数据是非常棘手的研究对象。特别是在文本挖掘、图像处理和基因数据分析中，维度过高使很多学习器无法工作或效率降低，所以降维也是数据预处理过程的一项必要任务。降维大致有两大类别，一类是从原始维度中提取新的维度，例如主成分分析或因子分析，再或者是奇异值分解或是多维标度分析。另一类是从原始维度中选择一些子集，即称为特征选择（Feature Selection），或者叫作最佳子...
2014-09-17 11:23:00
245
转载 java的WindowBuilder可视化插件
一直做在安卓用xml作界面，对于java的控件不熟悉，也不习惯用代码做UI尤其是布局。找了一下发现可以安装windowbuilder来实现java的可视化编程，但是很多资料里的连接都失效了。刚自己弄完比较熟悉，总结一下希望能帮到。我是直接在线安装的windowbuilder一.找到对应版本的windowbuilder打开这个链接：http://www.eclipse....
2014-09-12 21:11:00
78
转载 《R包的分类介绍》
R分析空间数据（Spatial Data） R机器学习包(Machine Learning) R多元统计包（Multivariate Statistics） R药物（代谢）动力学数据分析包 R计算计量经济学包（Computational Econometrics）R机器学习包(Machine Learning) Machine Learning & Statistical ...
2014-09-11 09:46:00
165
转载 MI & CI
目前，很多特征选择文献主要是依据对共信息的直观认识使用它，即：正值表示表型的存在使特征间依赖程度增加，是特征间存在相互作用的证据；负值表示表型的存在使特征间冗余性增加；零表示特征是相互独立的，或者说，是特征间的增益与冗余相互抵消了。因此，从理论上深入认识共信息是一项创新工作。识别阶段的第一项工作是使用共信息测度穷举搜索候选 SNP 集合中的 SNP 交互作用。当 ...
2014-09-01 10:29:00
119
转载 统计学常用概念：T检验、F检验、卡方检验、P值、自由度
1,T检验和F检验的由来一般而言，为了确定从样本(sample)统计结果推论至总体时所犯错的概率，我们会利用统计学家所开发的一些统计方法，进行统计检定。通过把所得到的统计检定值，与统计学家建立了一些随机变量的概率分布(probability distribution)进行比较，我们可以知道在多少%的机会下会得到目前的结果。倘若经比较后发现，出现这结果的机率很少，亦即是说，是...
2014-08-22 18:00:00
2985
转载 cocharan-Armitage trend test
Cochran-Armitage trend test是我们常说的趋势卡方检验，一般是针对基因型的2*3列联表的。譬如说三种基因型，如果按照某一个allele来看，可以有0、1、2个拷贝，是有序的，我们要观察随着allele数目的增多，发病的比例是否有差异，那么就要用Trend test。而Pearson卡方则不考虑该有序关系，只是简单的比较两个组中某一个allele的频率分布有无差异。...
2014-08-22 16:19:00
983
转载 H-W平衡
hardy-weinberg平衡:标准定义————如果一个种群符合下列条件:1.种群是极大的；2.种群个体间的交配是随机的,也就是说种群中每一个个体与种群中其他个体的交配机会是相等的；3.没有突变产生；4.种群之间不存在个体的迁移或基因交流；5.没有自然选择,那么,这个种群的基因频率(包括基因型频率)就可以一代代稳定不变,保持平衡。这就是遗传平衡定律,也称哈代c温伯格平衡。 实际应用中—...
2014-08-20 19:55:00
1576
转载 旅行目录
登封少林寺、开封北京（长城、故宫）天津上海深圳苏州杭州西湖（西湖十景.龙井）嘉兴乌镇湖南张家界安徽黄山哈尔滨冰雕广西桂林山水（漓江）山西平遥古镇四川九寨沟陕西（华山、兵马俑）山东（济南大明湖、崂山、泰山）厦门鼓浪屿云南昆明大理丽江.玉龙雪山青海湖新疆西藏拉萨（布达拉宫、香格里拉）海南三亚（天涯海...
2014-08-19 17:35:00
100
转载 java相关
看牛人如何学习JAVAhttp://wenku.baidu.com/link?url=qmrPPsRjENp5vUNG-wfwdYYG20lCqr3oC5-jLgfVLksVCopMgIcnONlXmI56p8aHKYpQCgufhJLSZRB1_BnftxoiZh6wYllbIuLM85PgZ3KJAVA编程题全集(50题及答案)http://wenku.baidu.com...
2014-08-15 11:48:00
62
转载 如何迅速成为Java高手
很多网友朋友问我学习Java有没有什么捷径,我说“没有，绝对没有!”。但是我却很愿意将自己学习的一些经验写出来，以便后来者少走弯路,帮助别人是最大的快乐嘛！要想学好Java，首先要知道Java的大致分类。我们知道，自从Sun推出Java以来，就 力图使之无所不包，所以Java发展到现在，按应用来分主要分为三大块：J2SE,J2ME和 J2EE,这也就是SunONE(...
2014-08-15 11:25:00
41
转载 新手如何学习java(java学习建议路线图)
怎么学习Java，这是很多新手经常会问我的问题，现在我简单描述下一个Java初学者到就业要学到的一些东西： 首先要明白Java体系设计到得三个方面：J2SE,J2EE,J2ME（KJAVA）。J2SE，Java2PlatformStandardEdition，我们经常说到的JDK，就主要指的这个，它是三者的基础，属于桌面级应用开发，这部分如果学得好很容易拓展J2EE和J2...
2014-08-15 11:20:00
150
转载 单倍型
单倍型，是单倍体基因型的简称，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合；通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。按照某一指定基因座上基因重组发生的数量，单倍型甚至可以指至少两个基因座或整个染色体。与基因型的区别更进一步的讲，单倍型也是指一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性（SNPs）。一个单倍型内的这类统计学关联性...
2014-08-11 11:16:00
2065
转载 eQTL
首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位，与连续变化的数量性状表型有密切关系表达数量性状基因座（expressi...
2014-08-11 10:12:00
703
转载 GWAS
GWAS的数据形式：SNP数据，即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态（0正常，1患病）的样例-对照数据。在遗传流行病学上，全基因组关联研究（Genome Wide Association Studies,GWAS）是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因，从而了解不同个体间的基因变化有多大的一种方法。不同的变化带来不同的性状，如各种疾病的不同。这些研究通常比...
2014-08-11 10:04:00
2102
转载 基因
具有遗传效应的DNA片段，是控制生物性状的基本遗传单位。结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。（1）原核生物结构基因：连续的，RNA合成不需要剪接加工；（2）真核生物结构基因：由外显子（编码序列)和内含子（非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列)，参与基因表达调控。把基因区分为结构基因和调节基因是...
2014-08-11 09:41:00
309
转载 【经验】研究生导师的肺腑之言
1. 如果平时几乎没看过英文原文，读不懂怎么办？ 其实我以前也根本没读过原文，也看不懂。这儿有个好办法：找一本中文经典的书籍，仅看某一节你感兴趣或与你相关的内容，然后先找一两篇英文的综述（review）认真阅读一下，不会的单词可用金山词霸查一查，也许你读第一篇文章需要花两天，你过两天再读第2遍时，你也许只要一天；然后你再读第2篇时也许你只要半天！然后你一定会真正发现读英文文献的快感！...
2014-08-08 10:44:00
120
转载 基因表达数据
基本概念基因表达数据反映的是直接或间接测量得到的基因转录产物 mRNA在细胞中的丰度，这些数据可以用于分析哪些基因的表达发生了改变，基因之间有何相关性，在不同条件下基因的活动是如何受影响的。它们在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面有重要的应用。目前，高通量检测基因组 mRNA 丰度的方法主要是 cDNA 微阵列、寡核苷酸芯片，随着 cDNA 微阵列和寡核苷酸芯片等...
2014-08-07 09:56:00
1622
转载 怎样看paper 最有效率
thinking more after reading. Don't just read the papers.in addition, at begining, you'd better focus on abstract, introduction and discussion. little by little, spend more time on materials and ...
2014-08-06 21:17:00
175
转载 基因探针富集分析（GSEA）& GO & pathway
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.htmlGO是Gene Ontology的简称，是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目，从分子功能（molecular function）、生物学过程（biological process）和细胞定位（cellular component）三个面对基因功能进行全面定义。基因本体...
2014-08-06 17:18:00
607
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人