R语言绘图基础教程

R语言绘图基础教程

一、R语言绘图初阶

首先下载包，绘制一张图：

#install.packages(c("Hmisc", "RColorBrewer"))
#install.packages(c("vcd", "plotrix", "sm", "vioplot"))
library(ggplot2, lib.loc=""~/R/lib"")

#生存一个可以修改的当前图形参数列表
par(ask=TRUE)
opar <- par(no.readonly=TRUE)

#载入数据集
attach(mtcars) # mtcars是R中自带的数据集，包含多种汽车的数据
plot(wt, mpg)
abline(lm(mpg~wt)) #abline是画一条或多条直线，lm是线性模型
title("Regression of MPG on Weight")

#不用了一定要detach
detach(mtcars)

1、图形参数

字体、颜色、坐标轴、标签等通过**函数par()**来指定选项。以这种方式设定的参数值除非被再次修改，否则将在
会话结束前一直有效。其调用格式为：

par(optionname=value,optionname=name,...)

不加参数地执行par()将生成一个含有当前图形参数设置的列表。添加参数no.readonly=TRUE可以生成一个可以修改的当前图形参数列表

例如一个药品的例子：

# Input data for drug example
dose  <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16, 20, 27, 40, 60)
drugB <- c(15, 18, 25, 31, 40)
plot(dose, drugA, type="b")
opar <- par(no.readonly=TRUE) #很重要

2、符号和线条

对上面的例子，现修改一些参数：

par(lty=2, pch=17)            # change line type and symbol
plot(dose, drugA, type="b")   # generate a plot
par(opar)                     # restore the original settings，恢复原设置 

plot(dose, drugA, type="b", lty=3, lwd=3, pch=17, cex=2)

3、颜色

# choosing colors
library(RColorBrewer)
n <- 7
mycolors <- brewer.pal(n, "Set1")
barplot(rep(1,n), col=mycolors)

n <- 10
mycolors <- rainbow(n)
pie(rep(1, n), labels=mycolors, col=mycolors)

把饼图改成灰色：

mygrays <- gray(0:n/n)
pie(rep(1, n), labels=mygrays, col=mygrays)

4、文本属性

# View font families 
opar <- par(no.readonly=TRUE)
par(cex=1.5)
plot(1:7,1:7,type="n")
text(3,3,"Example of default text")
text(4,4,family="mono","Example of mono-spaced text")
text(5,5,family="serif","Example of serif text")
par(opar)

仍用上方药物例子：

par(lwd=2, cex=1.5)
par(cex.axis=.75, font.axis=3)
plot(dose, drugA, type="b", pch=19, lty=2, col="red")
plot(dose, drugB, type="b", pch=23, lty=6, col="blue", bg="green")
par(opar)				

5、图形尺寸与边界尺寸

par(pin=c(2, 3))#图形大小

6、添加文本、自定义坐标轴和图例

可使用title()函数为图形添加标题和坐标轴标签，调用格式：

 title(main="maintitle", sub="subtitle", xlab="x-axis label", ylab="y-axis label")

plot(dose, drugA, type="b",  
     col="red", lty=2, pch=2, lwd=2,
     main="Clinical Trials for Drug A", 
     sub="This is hypothetical data", 
     xlab="Dosage", ylab="Drug Response",
     xlim=c(18, 60), ylim=c(0, 70)) #x轴刻度大小

你可以使用函数axis()来创建自定义的坐标轴，而非使用R中的默认坐标轴，其格式为：

axis(side, at=, labels=, pos=, lty=, col=, las=, tck=, ...)  #例子在下面