小杜的生信筆記
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个人简介:“小杜的生信筆記”,主要发表生物信息学的教程和基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等)。 相关教程资料可以到公众号中获得!!!

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BioinfoDu

博客描述:
​小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程和基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等)。
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    2024年
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  • R语言精美图形绘制教程
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当你在NCBI中提交了fq数据,但数据未公开,审稿专家要求你提供数据访问链接,怎么办呢?

推荐大家购买最新的教程,若是已经购买以前WGNCA教程的同学,可以在对应教程留言,即可获得最新的教程。(注:此教程也仅基于自己理解,不仅局限于此,难免有不恰当地方,请结合自己需求,进行改动。今天,我们的教程就教大家如何获得自己在NCBI数据中未公开的数据访问链接。,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);但是,在发文章时,审稿专家要求你将数据连接附在文章中,已方便对方访问。此外,若是大家需要如何在NCBI中上传数据教程,可以在本文中留言。
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发布博客 2024.11.13 ·
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使用Bioconda管理R语言

使用conda管理R语言,安装包,与传承的方式不一样。
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发布博客 2024.10.15 ·
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使用Copilot自动在Rstudio中写代码,提高效率!

copilot类似于open AI,可以自动给你撰写R代码,以及根据你的提示给你可能想要的分析。到这里,你在Rstuido中的设置就已经结束,现在需要注册copilot账号。OK,今天的教程到这里就结束了,很多Copilot的玩法等你来探索。但是,也有可能是网络的问题,那么你就需要进行。在解决R中的问题,是比较好用的。
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发布博客 2024.10.12 ·
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Genome varScant | 基因组结构变异 | 基于TBtools

今分享基因组结构变异检测的教程,大家常用的软件基本是minimap2软件,这个软件也是出自李恒大佬之手,但是对于新手小白,或是没有服务器的同学而言,直接在本地使用minimap2是不现实的。然而,今天可以啦。这个主要是归功于CJ老师开发的TBtools软件。非常厉害的一个生信化软件,TBtools问世以来真是造福了多少生信小白。。自己在19年开始了解TBtools,一直到现在,中间换过多台电脑,但是首选安装的软件中一定会有它。我们前面做过等几个教程。minimap2。
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发布博客 2024.10.09 ·
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Genome varScant | 基因组结构变异 | 基于TBtools

分享基因组结构变异检测的教程,大家常用的软件基本是minimap2软件,这个软件也是出自李恒大佬之手,但是对于新手小白,或是没有服务器的同学而言,直接在本地使用minimap2是不现实的。然而,今天可以啦。这个主要是归功于CJ老师开发的TBtools软件。非常厉害的一个生信化软件,TBtools问世以来真是造福了多少生信小白。。自己在19年开始了解TBtools,一直到现在,中间换过多台电脑,但是首选安装的软件中一定会有它。我们前面做过等几个教程。minimap2。
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发布博客 2024.10.09 ·
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基于R语言 | LASSO分析

发布动态 2024.10.08

基于R语言 | LASSO分析 (PS:大家可以直接去“订 * 阅 * 号”看原文,获得教程代码和数据)。 今天分享文章复现 | LASSO分析教程。 获得代码方式一: 根据图中所给自行敲打一下即可。 获得代码和数据方式二: 转发“教程”,并在圈子保留2小时,截图发送到后台。(PS:人工回复,消息可能会不及时哦,需等待,若是未收到回复,可在教程留言)。 获得代码和数据方式三: 可以直接查看LASSO分析教程原文,并支持一下,即可获得数据和代码。 获得代码和数据方式四: 若要获得,往期全部教程数据和代码,以及未来教程代码,可以加入我们“社群”。 最后,若是你有整理且愿意分享的教程,可以给我们投稿哦!我们会给予一定的稿费!随不多,但至少可以改善自己“一餐”的生活。 #知识分享

发布动态 2024.10.08

Nat Med.作者提供全文的绘图代码,对于学习作图很有帮助

获得本期教程全文代码:在订阅号后台回复关键词:20240923。
原创
发布博客 2024.09.23 ·
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Nat Med.作者提供全文的绘图代码,对于学习作图很有帮助(二)

推荐大家购买最新的教程,若是已经购买以前WGNCA教程的同学,可以在对应教程留言,即可获得最新的教程。(注:此教程也仅基于自己理解,不仅局限于此,难免有不恰当地方,请结合自己需求,进行改动。,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!
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发布博客 2024.09.23 ·
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Nat Med.作者提供全文的绘图代码,对于学习作图很有帮助(一)

对于学习绘图提供充分的素材。也是一个学习作图具重大意义的文章。但是,依旧是基于你有一定基础技能之上。由于微信改版,一直有同学反映。那么请跟随以下步骤,将。期刊中,来自上海交通大学医学院的文章,作者提供了全文的绘图代码,确实。获得本期教程全文代码:在订阅号后台回复关键词:20240923。:若你有好的教程或想法,可添加小杜个人微信。文中并未给你提供作图原数据,因此,这些都是需要自己去摸索。,但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》!>,不错过每一条推文教程。
原创
发布博客 2024.09.23 ·
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“他人笑我太疯癫,我笑他人看不穿“,关于做知识分享,被Diss,哇哦,真厉害

其实,在这里(网络),我们并不知道谁是谁的誰。大家没必要如此的咄咄逼人,对于知分享博主而言,一直坚持在分享的基本大多数是情怀吧(PS:对于个人账号,以及未和提相关公司建立合作)。此外,我们只是分享,仅仅是做自己的学习的记录。建立付费教程,若是你认为可以,那么就购买,若是不行,直接不购买就可以。我们没做任何要求,强制某一个人来购买,都是自愿行为。其实,类似的事情发生了很多。
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发布博客 2024.09.12 ·
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“他人笑我太疯癫,我笑他人看不穿“,关于因回复慢后,被骂事件,做知识分享,不是你理所应当的索要

因此,我们这里就不在建立免费社群(PS:早期关注的同学可能知道,早期建立过免费QQ群和V群,但是后面都全部解散),因为,免费事情做多了,你就可能成为。由于,推文中的教程数据和代码链接失效了,只能我这边后台收到消息后,手动将连接发送给对方,也会发消息,但XX同学并未关注我,我后台无法发送消息。XX同学,分别在11:22和12:07时间段加我好友,OK,完美错过,11:22时候,没看到(表示抱歉),11:30下班时间,去吃饭,一直要到下午上班时间。我时常在友圈或是推文中看到类似的话语,类似的情节,类似的无语。
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发布博客 2024.09.12 ·
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R语言绘图 | 气泡热图绘制(NC期刊)

发布视频 2024.09.07

简单的棒棒图绘制教程

表棒棒图绘制教程,基于R 语言
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发布博客 2024.09.02 ·
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GO、KEGG等富集棒棒图

棒棒图绘制教程
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发布博客 2024.09.02 ·
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多个数据的维恩图的绘制教程

对于维恩图的绘制教程,我们在前面分享过基于R语言绘制VennPlot图 | 可以绘制大于等于7个类别的码。但是,随着使用的R包的升级,我们绘制的维恩图会出现不显示数值的情况。因此,这个教程的码,若是不做修改的话,就不能使用。维恩图是我们日常分析中常用到的图形,使用的频率非常高(包括自己)。因此,我们今天再分享一篇制作维恩图的教程。此教程使用的R包也是很简单,内容非常丰富。
原创
发布博客 2024.09.01 ·
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维恩图绘制教程

维恩图绘制教程
原创
发布博客 2024.09.01 ·
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R语言 | 还在为绘制多个数据的维恩图而烦恼吗?

维恩图绘制教程
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发布博客 2024.09.01 ·
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8月图形更新总汇

8月份,我们一共更新了16个教程,上半个月文本教程相对占的比例较高(PS:这段时间在捣鼓这些内容),下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文,我们的就没有统计上去,自己在本地也没有保存这些文档。,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助,请。,这是对我们最大的支持。
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发布博客 2024.09.01 ·
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2024年8月份更新教程汇总

8月份,我们一共更新了16个教程,上半个月文本教程相对占的比例较高(PS:这段时间在捣鼓这些内容),下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文,我们的就没有统计上去,自己在本地也没有保存这些文档。,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助,请。,这是对我们最大的支持。
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发布博客 2024.09.01 ·
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