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RSS订阅原创 “他人笑我太疯癫，我笑他人看不穿“，关于做知识分享，被Diss，哇哦，真厉害
其实，在这里（网络），我们并不知道谁是谁的誰。大家没必要如此的咄咄逼人，对于知分享博主而言，一直坚持在分享的基本大多数是情怀吧（PS：对于个人账号，以及未和提相关公司建立合作）。此外，我们只是分享，仅仅是做自己的学习的记录。建立付费教程，若是你认为可以，那么就购买，若是不行，直接不购买就可以。我们没做任何要求，强制某一个人来购买，都是自愿行为。其实，类似的事情发生了很多。
2024-09-12 11:30:16
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原创 “他人笑我太疯癫，我笑他人看不穿“，关于因回复慢后，被骂事件，做知识分享，不是你理所应当的索要
因此，我们这里就不在建立免费社群（PS：早期关注的同学可能知道，早期建立过免费QQ群和V群，但是后面都全部解散），因为，免费事情做多了，你就可能成为。由于，推文中的教程数据和代码链接失效了，只能我这边后台收到消息后，手动将连接发送给对方，也会发消息，但XX同学并未关注我，我后台无法发送消息。XX同学，分别在11:22和12:07时间段加我好友，OK，完美错过，11:22时候，没看到（表示抱歉），11:30下班时间，去吃饭，一直要到下午上班时间。我时常在友圈或是推文中看到类似的话语，类似的情节，类似的无语。
2024-09-12 11:27:50
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原创 多个数据的维恩图的绘制教程
对于维恩图的绘制教程，我们在前面分享过基于R语言绘制VennPlot图 | 可以绘制大于等于7个类别的码。但是，随着使用的R包的升级，我们绘制的维恩图会出现不显示数值的情况。因此，这个教程的码，若是不做修改的话，就不能使用。维恩图是我们日常分析中常用到的图形，使用的频率非常高（包括自己）。因此，我们今天再分享一篇制作维恩图的教程。此教程使用的R包也是很简单，内容非常丰富。
2024-09-01 20:46:45
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原创 8月图形更新总汇
8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-09-01 20:36:29
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原创 2024年8月份更新教程汇总
8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-09-01 20:32:57
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原创 多线程解压SRA格式 | pfastq-dump工具
下载组学数据一般为SRA文件格式，需要将其拆分为FQ文件格式，常用的工具是NCBI中的fastq-dump软件进行拆分。但是，fastq-dump软件只能使用单线程运行，速度非常慢。可以看教程**那么如何实现多线程快速拆分呢？**今天我们推荐大家使用工具，实现多线程运行，提供工作效率。
2024-08-23 21:41:53
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原创 如何实现多线程快速拆分将SRA文件解压到FQ文件
下载组学数据一般为SRA文件格式，需要将其拆分为FQ文件格式，常用的工具是NCBI中的fastq-dump软件进行拆分。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；由于微信改版，一直有同学反映。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。软件只能使用单线程运行，速度非常慢。工具，实现多线程运行，提供工作效率。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。下载后解压，操作上同。
2024-08-23 21:38:37
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原创 知识星球开通了 | 更好的学习交流
誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。
2024-08-21 14:16:58
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原创 关于我的生信笔记开通《知识星球》
从很早关注我的同学应该了解小杜的知识分享历程，小杜是从2021年11月底开始进入此“坑”，一直坚持到现在，马上3年了（24年11月底到期）。自己也从一个小青年，变成一个大青年。也许后面，会一直更新下去，但是也许我某一天突然间就停止。誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。
2024-08-21 14:12:46
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原创 R语言绘图系列专栏 | 更新中
关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于R语言绘制图形。每个图形我们会提供对应的R代码数据和文本文档。此系列将会是一个长期更新的系列。本系列教程，我们计划发表及收录使用R语言绘制。这是个长期的过程，计划花费3-4个的时间完成。
2024-08-21 10:16:59
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原创 关于《R语言绘图专栏》
关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于R语言绘制图形。每个图形我们会提供对应的R代码数据和文本文档。此系列将会是一个长期更新的系列。本系列教程，我们计划发表及收录使用R语言绘制。这是个长期的过程，计划花费3-4个的时间完成。
2024-08-21 10:12:29
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原创 全网最全的云雨图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。将图形进行翻转，使用。
2024-08-19 21:38:57
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原创 R语言绘图 | 最全的云雨图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。将图形进行翻转，使用。
2024-08-19 21:36:24
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原创 R语言绘制Upset图
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-15 14:10:47
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原创 ATGC数量柱状图 |Nature
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:55:28
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原创 R语言绘制 | ATGC数量柱状图
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:50:57
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原创 我5分钟做了模式植物的GO和KEGG富集分析，并创建了orgDb数据库
我们在前面的教程分享了模式植物构建orgDb数据库 | 以org.Slycompersicum.eg.db为例,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。现在我们的代码，可以直接读取eggnog分析获得数据，非常的方便。此外，我们在这里依旧推荐大家使用本地的Egg-mapper进行注释，我自己使用下来，非常的快捷。
2024-08-12 19:49:11
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原创 你敢相信，我5分钟做了模式植物的GO和KEGG富集分析，并创建了orgDb数据库
我们的代码可能在运行时候会出现不同的问题，也会出现，在我这里正常运行，而在你那边程序中却报错的情况。虽然网页版的Egg-mapper工具，现在可以支持最多10000条的序列，但是速度依旧是比较慢的。好比，这个教程，我昨天的运行时，也各种报错，内心是发狂的，不知道为什么。自己的代码或教程，在前面分析过程中可以运行，但是现在再去使用时也会报错。,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:45:33
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原创 气泡图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-10 10:25:58
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原创 R语言绘制气泡图，并在指定位置添加标识 | Nature
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!由于微信改版，一直有同学反映。存在长时间接收不到公众号的推文。那么请跟随以下步骤，将。请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！：思来想去、不再成立QQ群。若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。
2024-08-10 10:23:38
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原创 黑群晖NAS挂载到服务器中，直接传输数据
我们在使用NAS的时候，是否遇到无法将服务器中的文件无法直接使用Xftp工具下载到NAS中，在下载界面出现你你没有权限下载此文件夹，因此，对于大数据储存下载非常麻烦。今天，我们的来分享一篇，直接将NAS直接挂载到服务器的教程。我们这里服务器是处于同一局域网，本教程可以正常挂载。
2024-08-10 10:22:43
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原创 一串代码将黑群晖挂载到服务器中，直接传输数据
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。我们在使用NAS的时候，是否遇到无法将服务器中的文件无法直接使用。这些操作结束后，恭喜你，已经完成80%了。挂载成功后，直接将Linux中的文件，，因此，对于大数据储存下载非常麻烦。文件位置，结合自己需求，可以直接在。运行后，输入密码即可挂载成功。到此文件中，即可实习同步。，这是对我们最大的支持。，本教程可以正常挂载。在NAS中设置共享文件。
2024-08-10 10:20:28
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原创 R语言绘图总汇
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-08 10:42:00
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原创 生信技能总汇，总有一个技能可以帮助你！
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-08 10:38:52
1026
原创 Linux中多线程压缩软件
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若是你的git无法使用安装，也可以只用源码安装。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-06 14:47:48
490
原创 Linux中多线程压缩软件 | Mingz
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若是你的git无法使用安装，也可以只用源码安装。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-06 14:45:07
429
原创 Nature | 肾癌基因组突变 | 全文open源代码
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。本文对学习R和python的同学非常友好，若你感兴趣可以自行学习。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。全文开放了分析代码，提供大家学习。，但支持小问题2-3个免费咨询。若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。
2024-08-05 23:10:57
732
原创 模式植物构建orgDb数据库 | 以org.Slycompersicum.eg.db为例
在我们制作分析是会遇到的问题，随着前面教程推出，也有同学咨询如何制作KEGG背景文件。最开始的目标是，将我们注释文件进行本地打包建库，使用时就会更加的方便。diamond在多于千条序列时才会体现速度优势，少量序列会感觉非常慢，而且结果也没有hmmer的更准确，尤其是对远源注释方面。本教程，我们会提供分布式的步骤教程，大家可以直接跟随教程直接做即可。对于这个问题，每个人分析的环境不同以及资源不同，我们根据自己的环境和资源进行合理调整即可。若手中的有充足资源服务器，可以自己搭建，有利于后续流程的搭建和分析。
2024-08-02 20:41:44
1133
原创 环状柱状图+散点柱状组合图
本期的教程代码是基于SCIPainter中的如何绘制Nat Commun同款环状+散点柱形图组合图表？进行调整，大家若是需要可直接进行访问此教程。在原文中，两个图形的组合是使用AI工具进行合图。为了方便大家后期的绘图，我们基于此教程的代码，使用cowplot包进行两个图形的合并。注意：在我们此教程中只是展示部分的绘图代码，详细的教程代码可以访问如何绘制Nat Commun同款环状+散点柱形图组合图表？或是在我们后台绘图关键词，获得全部代码和数据。
2024-07-25 16:45:50
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原创 环状柱状图+散点柱状组合图绘制，基于SCIPainter
获得本期教程文本文档，在后台回复：20240725。请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。
2024-07-25 16:43:19
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原创 全网最全 | Linux（Ubuntn）系统安装 | 硬盘挂载 | 用户创建 | 生信分析配置
昨天（2024年7月23日）我们分享了学生及科研人员电脑配置推荐 | 笔记本+外置显卡配置，性能足够支持完成你博士论文文本内容,那么今天我们就分享一文解决 | Linux（Ubuntn）系统安装 | 硬盘挂载 | 用户创建 | 生信分析配置的教程，我们使用一文来解决大家在做生信时遇到安装系统、配置环境的问题。在此文中，我们尽快可能给出一套全网最全的教程。目标是解决新手小白同学查资源的困惑和难题。但是，每个童鞋遇到的问题不一样，此教程也不可能把你遇到的每个问题都归纳在其中。我们也希望，
2024-07-24 08:54:07
1052
原创 一文解决 | Linux（Ubuntn）系统安装 | 硬盘挂载 | 用户创建 | 生信分析配置
注意：我们文章中只是总结了一部分内容，很多详细的内容，都需要自己有正对性的设置，大家可以尽情地“度娘”。中，@九筒同学的教程，这个教程他在23日刚做了更新，比较全面，我们就直接引用他的教程即可。若是这个教程，无法满足您的需求，那么你也可以继续查找其他的教程，在网上一搜索，会有很多个教程。用户还需要一个密码。是一个用于更改用户密码的命令，或者具有管理员权限的用户可以更改其他用户的密码。对于制作启动盘的工具更多，我们这里只是进行介绍我们本次安装时所使用到的工具，其余的工具，大家可以结合自己实际情况而定。
2024-07-24 08:51:26
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原创 比mamba都快4倍的生信软件安装工具 | Pixi
今天中午看到通哥分享的教程，conda转圈圈，为何不试试pixi，Pixi是第一次了解。但是，通过他们的介绍，确实牛X,速度是conda的10倍以上，mamba的4倍。对于自己而言，自从使用了mamba以后，基本不会在使用conda安装软件。conda很多时候，速度让我劝退了。Pixi确实有这么牛X？那么就实际操作一下吧。
2024-07-04 16:52:34
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空空如也
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