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RSS订阅原创 使用Copilot自动在Rstudio中写代码，提高效率！
copilot类似于open AI，可以自动给你撰写R代码，以及根据你的提示给你可能想要的分析。到这里，你在Rstuido中的设置就已经结束，现在需要注册copilot账号。OK，今天的教程到这里就结束了，很多Copilot的玩法等你来探索。但是，也有可能是网络的问题，那么你就需要进行。在解决R中的问题，是比较好用的。
2024-10-12 20:36:37
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原创 Genome varScant | 基因组结构变异 | 基于TBtools
今分享基因组结构变异检测的教程，大家常用的软件基本是minimap2软件，这个软件也是出自李恒大佬之手，但是对于新手小白，或是没有服务器的同学而言，直接在本地使用minimap2是不现实的。然而，今天可以啦。这个主要是归功于CJ老师开发的TBtools软件。非常厉害的一个生信化软件，TBtools问世以来真是造福了多少生信小白。。自己在19年开始了解TBtools，一直到现在，中间换过多台电脑，但是首选安装的软件中一定会有它。我们前面做过等几个教程。minimap2。
2024-10-09 16:52:00
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原创 Genome varScant | 基因组结构变异 | 基于TBtools
分享基因组结构变异检测的教程，大家常用的软件基本是minimap2软件，这个软件也是出自李恒大佬之手，但是对于新手小白，或是没有服务器的同学而言，直接在本地使用minimap2是不现实的。然而，今天可以啦。这个主要是归功于CJ老师开发的TBtools软件。非常厉害的一个生信化软件，TBtools问世以来真是造福了多少生信小白。。自己在19年开始了解TBtools，一直到现在，中间换过多台电脑，但是首选安装的软件中一定会有它。我们前面做过等几个教程。minimap2。
2024-10-09 16:49:33
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原创 Nat Med.作者提供全文的绘图代码，对于学习作图很有帮助（二）
推荐大家购买最新的教程，若是已经购买以前WGNCA教程的同学，可以在对应教程留言，即可获得最新的教程。（注：此教程也仅基于自己理解，不仅局限于此，难免有不恰当地方，请结合自己需求，进行改动。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!
2024-09-23 15:23:12
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原创 Nat Med.作者提供全文的绘图代码，对于学习作图很有帮助（一）
对于学习绘图提供充分的素材。也是一个学习作图具重大意义的文章。但是，依旧是基于你有一定基础技能之上。由于微信改版，一直有同学反映。那么请跟随以下步骤，将。期刊中，来自上海交通大学医学院的文章，作者提供了全文的绘图代码，确实。获得本期教程全文代码：在订阅号后台回复关键词：20240923。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。文中并未给你提供作图原数据，因此，这些都是需要自己去摸索。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！>，不错过每一条推文教程。
2024-09-23 15:18:54
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原创 “他人笑我太疯癫，我笑他人看不穿“，关于做知识分享，被Diss，哇哦，真厉害
其实，在这里（网络），我们并不知道谁是谁的誰。大家没必要如此的咄咄逼人，对于知分享博主而言，一直坚持在分享的基本大多数是情怀吧（PS：对于个人账号，以及未和提相关公司建立合作）。此外，我们只是分享，仅仅是做自己的学习的记录。建立付费教程，若是你认为可以，那么就购买，若是不行，直接不购买就可以。我们没做任何要求，强制某一个人来购买，都是自愿行为。其实，类似的事情发生了很多。
2024-09-12 11:30:16
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原创 “他人笑我太疯癫，我笑他人看不穿“，关于因回复慢后，被骂事件，做知识分享，不是你理所应当的索要
因此，我们这里就不在建立免费社群（PS：早期关注的同学可能知道，早期建立过免费QQ群和V群，但是后面都全部解散），因为，免费事情做多了，你就可能成为。由于，推文中的教程数据和代码链接失效了，只能我这边后台收到消息后，手动将连接发送给对方，也会发消息，但XX同学并未关注我，我后台无法发送消息。XX同学，分别在11:22和12:07时间段加我好友，OK，完美错过，11:22时候，没看到（表示抱歉），11:30下班时间，去吃饭，一直要到下午上班时间。我时常在友圈或是推文中看到类似的话语，类似的情节，类似的无语。
2024-09-12 11:27:50
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原创 多个数据的维恩图的绘制教程
对于维恩图的绘制教程，我们在前面分享过基于R语言绘制VennPlot图 | 可以绘制大于等于7个类别的码。但是，随着使用的R包的升级，我们绘制的维恩图会出现不显示数值的情况。因此，这个教程的码，若是不做修改的话，就不能使用。维恩图是我们日常分析中常用到的图形，使用的频率非常高（包括自己）。因此，我们今天再分享一篇制作维恩图的教程。此教程使用的R包也是很简单，内容非常丰富。
2024-09-01 20:46:45
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原创 8月图形更新总汇
8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-09-01 20:36:29
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原创 2024年8月份更新教程汇总
8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-09-01 20:32:57
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原创 多线程解压SRA格式 | pfastq-dump工具
下载组学数据一般为SRA文件格式，需要将其拆分为FQ文件格式，常用的工具是NCBI中的fastq-dump软件进行拆分。但是，fastq-dump软件只能使用单线程运行，速度非常慢。可以看教程**那么如何实现多线程快速拆分呢？**今天我们推荐大家使用工具，实现多线程运行，提供工作效率。
2024-08-23 21:41:53
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原创 如何实现多线程快速拆分将SRA文件解压到FQ文件
下载组学数据一般为SRA文件格式，需要将其拆分为FQ文件格式，常用的工具是NCBI中的fastq-dump软件进行拆分。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；由于微信改版，一直有同学反映。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。软件只能使用单线程运行，速度非常慢。工具，实现多线程运行，提供工作效率。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。下载后解压，操作上同。
2024-08-23 21:38:37
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原创 知识星球开通了 | 更好的学习交流
誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。
2024-08-21 14:16:58
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原创 关于我的生信笔记开通《知识星球》
从很早关注我的同学应该了解小杜的知识分享历程，小杜是从2021年11月底开始进入此“坑”，一直坚持到现在，马上3年了（24年11月底到期）。自己也从一个小青年，变成一个大青年。也许后面，会一直更新下去，但是也许我某一天突然间就停止。誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。
2024-08-21 14:12:46
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原创 R语言绘图系列专栏 | 更新中
关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于R语言绘制图形。每个图形我们会提供对应的R代码数据和文本文档。此系列将会是一个长期更新的系列。本系列教程，我们计划发表及收录使用R语言绘制。这是个长期的过程，计划花费3-4个的时间完成。
2024-08-21 10:16:59
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原创 关于《R语言绘图专栏》
关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于R语言绘制图形。每个图形我们会提供对应的R代码数据和文本文档。此系列将会是一个长期更新的系列。本系列教程，我们计划发表及收录使用R语言绘制。这是个长期的过程，计划花费3-4个的时间完成。
2024-08-21 10:12:29
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原创 全网最全的云雨图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。将图形进行翻转，使用。
2024-08-19 21:38:57
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原创 R语言绘图 | 最全的云雨图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。将图形进行翻转，使用。
2024-08-19 21:36:24
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原创 R语言绘制Upset图
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于。此系列将会是一个长期更新的系列。每个图形我们会提供对应的。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-15 14:10:47
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原创 ATGC数量柱状图 |Nature
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:55:28
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原创 R语言绘制 | ATGC数量柱状图
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:50:57
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原创 我5分钟做了模式植物的GO和KEGG富集分析，并创建了orgDb数据库
我们在前面的教程分享了模式植物构建orgDb数据库 | 以org.Slycompersicum.eg.db为例,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。现在我们的代码，可以直接读取eggnog分析获得数据，非常的方便。此外，我们在这里依旧推荐大家使用本地的Egg-mapper进行注释，我自己使用下来，非常的快捷。
2024-08-12 19:49:11
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原创 你敢相信，我5分钟做了模式植物的GO和KEGG富集分析，并创建了orgDb数据库
我们的代码可能在运行时候会出现不同的问题，也会出现，在我这里正常运行，而在你那边程序中却报错的情况。虽然网页版的Egg-mapper工具，现在可以支持最多10000条的序列，但是速度依旧是比较慢的。好比，这个教程，我昨天的运行时，也各种报错，内心是发狂的，不知道为什么。自己的代码或教程，在前面分析过程中可以运行，但是现在再去使用时也会报错。,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。，这是对我们最大的支持。
2024-08-12 19:45:33
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原创 气泡图绘制教程
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-10 10:25:58
287
原创 R语言绘制气泡图，并在指定位置添加标识 | Nature
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!由于微信改版，一直有同学反映。存在长时间接收不到公众号的推文。那么请跟随以下步骤，将。请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！：思来想去、不再成立QQ群。若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。
2024-08-10 10:23:38
382
原创 黑群晖NAS挂载到服务器中，直接传输数据
我们在使用NAS的时候，是否遇到无法将服务器中的文件无法直接使用Xftp工具下载到NAS中，在下载界面出现你你没有权限下载此文件夹，因此，对于大数据储存下载非常麻烦。今天，我们的来分享一篇，直接将NAS直接挂载到服务器的教程。我们这里服务器是处于同一局域网，本教程可以正常挂载。
2024-08-10 10:22:43
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原创 一串代码将黑群晖挂载到服务器中，直接传输数据
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。我们在使用NAS的时候，是否遇到无法将服务器中的文件无法直接使用。这些操作结束后，恭喜你，已经完成80%了。挂载成功后，直接将Linux中的文件，，因此，对于大数据储存下载非常麻烦。文件位置，结合自己需求，可以直接在。运行后，输入密码即可挂载成功。到此文件中，即可实习同步。，这是对我们最大的支持。，本教程可以正常挂载。在NAS中设置共享文件。
2024-08-10 10:20:28
408
原创 R语言绘图总汇
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-08 10:42:00
307
原创 生信技能总汇，总有一个技能可以帮助你！
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-08 10:38:52
1058
原创 Linux中多线程压缩软件
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若是你的git无法使用安装，也可以只用源码安装。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-06 14:47:48
519
原创 Linux中多线程压缩软件 | Mingz
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。若是你的git无法使用安装，也可以只用源码安装。若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。
2024-08-06 14:45:07
476
原创 Nature | 肾癌基因组突变 | 全文open源代码
主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。请大家看清楚回复关键词，每天都有很多人回复错误关键词，我这边没时间和精力一一回复。本文对学习R和python的同学非常友好，若你感兴趣可以自行学习。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。全文开放了分析代码，提供大家学习。，但支持小问题2-3个免费咨询。若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。
2024-08-05 23:10:57
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