HDU 2457 DNA repair

给定n个模式串，一个目标串，求目标串修改最少多少次可以使其不包含任何模式串。用二维dp来求，主要是要构建出DFA，具体看之前的的poj2778里的链接。然后就是判断转移时是否需要+1，和利用end数组判断当前是否可以转移。代码如下

#include<stdio.h>
#include<iostream>
#include<string.h>
#include<algorithm>
#include<queue>
using namespace std;
const int INF=1e9;
const int MOD=20090717;

int a[110];
int dp[1010][1010];
char str[1010];
struct Tree
{
	int next[1200][5],end[1100],fail[1100];
	int L,root;
	int newnode()
	{
		for(int i=0;i<4;i++)
		{
			next[L][i]=-1;
		}
		end[L++]=0;
		return L-1;
	}
	void init()
	{
		L=0;
		root=newnode();
	}
	int getch(char ch)
	{
		if(ch=='A') return 0;
		else if(ch=='G') return 1;
		else if(ch=='C') return 2;
		else if(ch=='T') return 3;
	}
	void insert(char *s)
	{
		int len=strlen(s);
		int p=root;
		for(int i=0;i<len;i++)
		{
			int id=getch(s[i]);
			if(next[p][id]==-1)
			{
				next[p][id]=newnode();
			}
			p=next[p][id];
		}
		end[p]++;
	}
	void build()
	{
		queue<int>q;
		int p=root;
		fail[root]=root;
		for(int i=0;i<4;i++)
		{
			if(next[p][i]==-1)
			{
				next[p][i]=root;
			}
			else
			{
				fail[next[p][i]]=root;
				q.push(next[p][i]);
			}
		}
		while(!q.empty())
		{
			p=q.front();
			q.pop();
			if(end[fail[p]]) end[p]=1;
  			for(int i=0;i<4;i++)
			{
				if(next[p][i]==-1)
				{
					next[p][i]=next[fail[p]][i];
				}
				else
				{
					fail[next[p][i]]=next[fail[p]][i];
					q.push(next[p][i]);
				}
			}
		}
	}
	void query(char *s)
	{
		int len=strlen(s);
		int p=root,ans=0;
		for(int i=0;i<len;i++)
		{
			int id=s[i]-'a';
			p=next[p][id];
			int temp=p;
			while(temp!=root)
			{
				if(end[temp])
				{
					ans+=end[temp];
					end[temp]=0;
				}
				temp=fail[temp];
			}
		}
	}
	void debug()
    {
        for(int i = 0;i < L;i++)
        {
            printf("id = %3d,fail = %3d,end = %3d,chi = [",i,fail[i],end[i]);
            for(int j = 0;j < 26;j++)
                printf("%2d",next[i][j]);
            printf("]\n");
        }
    }
    void solve()
    {
    	int len=strlen(str);
    	for(int i=0;i<=len;i++)
    	{
    		for(int j=0;j<L;j++)
    		{
    			dp[i][j]=INF;
    		}
    	}
    	dp[0][0]=0;
    	for(int i=0;i<len;i++)
    	{
    		for(int j=0;j<L;j++)
    		{
    		//	printf("!%d %d\n",i,j);
    			for(int k=0;k<4;k++)
    			{
    				int id=getch(str[i]);
    				int nextj=next[j][k];
    		//		printf("%d %d %d %d %d %d\n",k,id,nextj,end[nextj],dp[i][j],dp[i+1][j]);
    				if(end[nextj]) continue;
    				int tmp;
    				if(id==k) tmp=dp[i][j];
    				else tmp=dp[i][j]+1;
    				dp[i+1][nextj]=min(dp[i+1][nextj],tmp);
     			}
    		}
    	}
    	int ans=INF;
    	for(int i=0;i<L;i++)
    	ans=min(ans,dp[len][i]);
    	if(ans==INF) printf("-1\n");
    	else printf("%d\n",ans);
    }
};
Tree ac;
char s[22];

int main()
{
	int cas=1;
	int n;
	while(~scanf("%d",&n))
	{
		if(n==0) break;
		ac.init();
		for(int i=0;i<n;i++)
		{
			scanf("%s",s);
			ac.insert(s);
		}
		scanf("%s",str);
		ac.build();
		printf("Case %d: ",cas++);
		ac.solve();
	}
}