图像分割
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lynnhgwang
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【图像分割】KiTS19 肾脏肿瘤分割数据集获取方法
比赛官网:KiTS19 Challenge Homepage数据集下载方法1. 找到官方提供的项目的github地址2. 将该项目clone或者下载本地。data目录下就是数据集300个标签数据,但没有原图数据。根据README的提示,需要运行项目进行原图数据的获取。我在命令行里面运行了该项目,发现数据下载的速度非常缓慢,并且有些数据只能下载一部分。解决.........原创 2020-04-15 11:27:10 · 6204 阅读 · 11 评论 -
【论文写作】图像分割学术论文中常用词汇记录
养成良好的读论文记笔记习惯,记一些高级的词汇、表达,便于论文写作学术论文用词名词connectivity patterns 连接模式fashion 方式preprocessing 预处理patch size 补丁大小bells and whistles 花里胡哨,额外的修饰物texture 纹理processing 处理,加工gains 收益evaluation 评估plugand-play 即插即用inference 推断mechanism 机制feedforward.原创 2022-03-24 21:36:14 · 803 阅读 · 1 评论 -
【图像分割】医学图像分割入门实践(附源码)
有一定深度学习图像分割基础,至少阅读过部分语义分割或者医学图像分割文献前面的一篇医学图像分割多目标分割(多分类)实践文章记录了笔者在医学图像分割踩坑入门的实践,当时仅仅贴了一些代码不够详细。通过博客的评论互动和私信发现有很多同学同样在做这个方向,这也让我下决心要将文章写的更详细一点,希望对该方向入坑的同学提供一些帮助。先上源码。1 完整源码【完整源码地址】: pytorch-medical-image-segmentation重新整理了之前的代码,利用其中一个数据集(前面文章提到的基于磁共振成.原创 2021-10-22 13:25:29 · 47137 阅读 · 173 评论 -
实现一个ROI裁剪,最大程度减少背景区域的保留
文章目录1 效果预览2 思路3 代码实现4 总结1 效果预览(原图)(获取ROI框)(裁剪后)2 思路使用scikit-image包的相关函数来获取原图像的联通区域;联通区域有多个的时候,通过坐标计算找到一个框能够框下多个连通区域;得到这个框的坐标作为裁剪大小的参考。3 代码实现获取ROI区域import osimport cv2import sysimport numpy as npfrom skimage import measureimport matpl原创 2020-08-21 19:08:17 · 832 阅读 · 4 评论 -
【论文解读】DANet: 利用双注意力捕获全局上下文信息解决场景分割任务
1. 相关资源原文地址:Dual Attention Network for Scene Segmentation [ 2019] [CVPR] [DANet] [场景分割] [双重注意力]源码地址:https://github.com/junfu1115/ DANet/2. 问题描述场景分割的目标是识别每一个像素。要分割的对象或内容经常受尺度,光照,遮挡的影响,由于卷积运算本身属于local operation,导致局部感受野。因此,具有相同标签的像素的特征可能具有一些差异,这些差异引入了类内原创 2020-06-01 12:34:26 · 7813 阅读 · 9 评论 -
【论文解读】语义分割&医学图像分割论文合集
description: 整理自己看过和待看的一些主要关于图像分割包括其他领域的论文,不定时更新…综述篇Deep learning for cardiac image segmentation: A review [2019]Deep Semantic Segmentation of Natural and Medical Images: A Review [2019]Understanding Deep Learning Techniques for Image Segmentation原创 2020-05-14 15:24:26 · 3994 阅读 · 2 评论 -
【图像分割】医学图像分割多目标分割(多分类)实践
文章目录1. 数据集2. 数据预处理3. 代码部分3.1 训练集和验证集划分3.2 数据加载和处理3.3 One-hot 工具函数3.4 网络模型3.5 模型权重初始化3.6 损失函数3.7 模型评价指标3.8 训练3.9 模型验证3.10 实验结果1. 数据集来自ISICDM 2019 临床数据分析挑战赛的基于磁共振成像的膀胱内外壁分割与肿瘤检测数据集。(原始数据)(ground truth)灰度值:灰色128为膀胱内外壁,白色255为肿瘤。任务是要同时分割出膀胱内外壁和肿瘤部分,加上背景原创 2020-05-13 21:37:55 · 25308 阅读 · 71 评论 -
【论文解读】Gated-SCNN:提高小物体和细物体分割效果
相关资源原文地址: Gated-SCNN : Gated Shape CNNs for Semantic Segmentation [2019] [ICCV]源码地址: https://nv-tlabs.github.io/GSCNN/问题描述 论文中提到,语义分割主要遇到的问题是低分辨率和语义信息不足等。许多研究者也提出了融合不同层的语义信息,以及利用多尺度分辨率的上采样模块等,来缓解这些问题。 语义分割在细小的目标分割上还存在一些问题。这个问题可以从网络结构的内在出发,单一网络的结构融原创 2020-05-13 16:28:48 · 9521 阅读 · 7 评论 -
【图像分割】图像分割中数据预处理 One-hot 编码的两种实现方式
简要说明one-hot编码这里只做简单解释,详细说明请查看相关资料。假设我们有3个分类标签[1, 2, 3],one-hot则将其编码为:1 -> 1 0 02 -> 0 1 03 -> 0 0 1即有多少个分类标签,就要用多少位来进行one-hot编码,这里的位数通常也就对应语义分割中网络模型最后输出的特征图(即预测图)的通道数(num_classes)。语义......原创 2020-04-15 10:58:33 · 11838 阅读 · 4 评论 -
【Pytorch】 Dice系数与Dice Loss损失函数实现
由于Dice系数是图像分割中常用的指标,而在Pytoch中没有官方的实现,下面结合网上的教程进行详细实现。先来看一个我在网上经常看到的一个版本。def diceCoeff(pred, gt, smooth=1, activation='sigmoid'): r""" computational formula: dice = (2 * (pred ∩ gt)) ...原创 2020-03-31 11:38:55 · 23105 阅读 · 24 评论