paste and join (Linux)

paste格式：

paste -d -s file1 file2

paste将按行将不同文件行信息放在一行。缺省情况下，paste连接时，用空格或tab键分割新行中不同文件，但是可以用-d来指定分隔符。

选项含义如下：

-d    指定不同于空格或tab键的域分隔符。但是请注意：分隔符此时限定为一个字符，如果给定多个字符，那么将依次使用。

另外，-d还有一项功能就是指定每行含有的元素个数，比如：

ls | paster -d "＂- - - 就是指每行含有三个元素。要是所有的内容归结为一行，那么用下面的

-s  作用是将每个文件的内容合并为一行，并列出。

Example：

[10:38:09@test]$ cat aa

a1

a2

a3

a4

a5

[10:38:19@test]$ cat bb

b1

b2

b3

b4

b5

[10:41:43@test]$ cat  cc

c1

c2

c3

c4

c5

[10:38:21@test]$ paste aa bb  #合并两个文件，默认分隔符为tab键或者空格

a1      b1

a2      b2

a3      b3

a4      b4

a5      b5

[10:38:30@test]$ paste bb aa #指定先后合并

b1      a1

b2      a2

b3      a3

b4      a4

b5      a5

[10:38:36@test]$ paste -d@ aa bb #指定分隔符合并

a1@b1

a2@b2

a3@b3

a4@b4

a5@b5

[10:42:02@test]$ paste aa bb cc  #可以合并多个文件，但是速度很慢

a1      b1      c1

a2      b2      c2

a3      b3      c3

a4      b4      c4

a5      b5      c5

[10:42:12@test]$ paste -d"@#" aa bb cc #指定多个分割符的情况，会依次排列使用

a1@b1#c1

a2@b2#c2

a3@b3#c3

a4@b4#c4

a5@b5#c5

[10:40:55@test]$ ls  #下一种情况，直接从管道符中提取数据

aa  bb  cc  dd  ee  ff  gg

[10:40:48@test]$ ls | paste -d" "   #默认情况是一行中指含有一个数据

aa

bb

cc

dd

ee

ff

gg

[10:41:14@test]$ ls | paste -d" " - - - -  #指定每行中含有元素的个数

aa bb cc dd

ee ff gg

[10:41:22@test]$ ls | paste -s  #一行显示参数

aa      bb      cc      dd      ee      ff      gg

注1：paste对我来说的作用在于替代join来合并有共同列的文件合并。具体操作是，排列好对应的列，然后合并，并用cut或者awk用管道符提取所需要的字段。

cut和awk提取字段的区别在于，cut没有对列排序的功能，但提取数据显示很快速并可以简写，但是awk就不能简写，必须一个字段一个字段的慢慢的弄，弄死你，但是awk的好处也非常明显，就是排序功能，下面是一个MANTOU的一个例子的命令行：

paste fre.xls fre2.xls | awk '{print $1"\t"$2"\t"$3"\t"$4"\t"$8"\t"$9"\t"$5"\t"$15"\t"$6"\t"$16"\t"$7}' > anno.fre.xls

注2：paste和join都是对文件进行合并，join的好处在于可以指定字段进行匹配，并找出相同或者不同的对应元素，但是缺点是我还没有完全能使用join，具体是（1）分隔符不能灵活使用，比如tab就加不上（2）指定字段的时候老师报错（3）-v寻找不同值测试失败。

所以，现在paste基本能代替join的功能：直接合并对应文件，再使用awk或者其他linux命令进行操作。

期待高手出现，解决join的问题。