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原创 R路径下下载的R包不能够写入library

解决 Windows 10 首次安装R及Rstudio 遇到的问题R路径下下载的R包不能够写入library解决方法:找到R路径下的library文件夹,鼠标右击找到下拉菜单中的属性,修改它的“安全”权限。此时“写入”是没有被选中的,选择“编辑”,然后修改不同用户下的权限即可。...

2020-12-21 15:12:57 4917 5

原创 LINUX安装SNPlyho

LINUX安装SNPlyhoSNPhylo可以从包含大量SNP数据的文件中构建系统发育树。1 官网链接 http://chibba.pgml.uga.edu/snphylo/2 Linux的安装方法2.1 依赖的软件和包(1) Rscript链接:http://www.r-project.org/.(2)Python链接: http://www.python.org/.(3)MUSCLE链接:http://www.drive5.com/muscle/.(4)dnaml在PHYLIP

2020-09-03 17:28:30 951

原创 Linux 三剑客:grep、awk、sed

Linux 三剑客:grep、awk、sed(介绍并不仔细,只是分享曾经用过的命令行,也作为自己的一个笔记,后续会不断填充命令)输入文件:testchr01.vcf.gz输出文件:chr01.vcf1.grep优势:查找功能举例:1.1 输出 testchr01.vcf.gz中带##(表头部分)less -S testchr01.vcf.gz | grep -v ’ ^## ’ > chr01.vcf1.2 输出已用命令行中关于grep的命令history | grep ‘gre

2020-08-28 10:05:54 207

原创 在Linux中去除文件中符合条件的行

在Linux中去除文件中符合条件的行例如需要去掉test1.vcf.gz中含##的行文件:1.输入文件(即需处理文件): test1.vcf.gz2. 输出文件(即处理好的文件):1.vcf方法(grep):less -S test1.vcf.gz | grep -v ‘^##’>1.vcf欢迎使用Markdown编辑器你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章,了解一下Markdown的基本语法

2020-08-27 11:20:05 1606

空空如也

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