Linux 三剑客：grep、awk、sed

Linux 三剑客：grep、awk、sed

(介绍并不仔细，只是分享曾经用过的命令行，也作为自己的一个笔记，后续会不断填充命令)
输入文件：testchr01.vcf.gz
输出文件：chr01.vcf

1.grep

优势：查找功能
举例：
1.1 输出 testchr01.vcf.gz中带##（表头部分）
less -S testchr01.vcf.gz | grep -v ’ ^## ’ > chr01.vcf
1.2 输出已用命令行中关于grep的命令
history | grep ‘grep’

2.sed

优势：处理行
举例：
2.1 输出 testchr01.vcf.gz 中前2行
sed -n ‘1,2p’ testchr01.vcf.gz >chr01.vcf

3.awk

优势：处理列
举例：
3.1 输出 testchr01.vcf.gz 文件中的第二列
less -S testchr01.vcf.gz | awk -F ‘\t’ ‘{print $2}’ >chr01.vcf