AI4S - 蛋白质替换 MSA (多序列比对) 文件的 Target 序列 教程

本文深入探讨了BFD(Bidirectional Forwarding Detection)技术,包括其工作原理、配置方法和在现代网络中的关键作用。BFD是一种快速检测网络路径故障的协议,它通过双向检测确保两端设备间的通信可靠性。通过学习BFD,读者将更好地理解如何提高网络的可用性和性能。

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MSA

在 MSA 文件中,通过处理 Target 序列,影响 MSA 的搜索结果与比对结果,但是在预测的过程中,需要替换为最初的 Target 序列,同时,保持序列长度一致。

常见场景是去除 IDRs 无序区域,进行 MSA 搜索,再替换目标序列,进行蛋白质结构预测。即:

  1. 读取 MSA 文件。
  2. 替换 MSA 中 Target 序列为目标序列 (FASTA文件)。
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