酵母展示技术与噬菌体展示技术异同点|泰克生物

酵母展示服务与噬菌体展示服务在生物技术和纳米抗体研发领域中均扮演着重要角色,但两者之间存在显著的差异和各自的优缺点。
酵母展示服务
原理:酵母展示技术是一种真核蛋白表达系统,通过将外源靶蛋白基因与特定的载体基因序列融合后导入酵母细胞,利用酵母细胞壁的特殊结构将融合蛋白锚定在其表面。
优点:
真核表达系统:酵母为真核生物,其表达的蛋白质在结构、折叠和修饰等方面更接近哺乳动物细胞,有助于保持蛋白的原始结构和功能。
高亲和力筛选:在筛选/淘选步骤中,酵母展示适用于流式细胞仪(FACS)等技术,能够精确筛选出具有所需结合特性的抗体。
缺点:
设备要求高:酵母展示技术需要配置流式分选仪等高端设备,对实验室的硬件条件有一定要求。
转化效率较低:与噬菌体相比,酵母的转化效率较低,可能影响抗体多样性的筛选。
噬菌体展示服务
原理:噬菌体展示技术利用噬菌体颗粒的表面来展示外源蛋白或多肽片段。通过将外源蛋白质或多肽插入噬菌体的基因组中,使其能够与噬菌体颗粒的表面蛋白相连,从而在噬菌体感染宿主细胞时展示在噬菌体外部。
优点:
实验设备要求低:噬菌体展示技术对实验设备的要求较低,常规分子生物学实验室即可开展。
大容量文库库容:通过构建包含多个变种的噬菌体文库,可以筛选出具有特定功能或结合能力的蛋白质或多肽。
缺点:
筛选精度有限:在噬菌体展示中,抗体与抗原的亲和力通常只能通过调整洗涤缓冲液成分来粗略分层,筛选精度相对较低。
原核表达系统:噬菌体为原核生物,其表达的蛋白质在结构和修饰方面可能与哺乳动物细胞存在差异。
综上所述,酵母展示服务与噬菌体展示服务各有其特点和优缺点。在选择使用哪种技术时,需要根据具体的研究需求、实验条件和资源等因素进行综合考虑。

 

【使用教程】 一、环境配置 1、建议下载anaconda和pycharm 在anaconda中配置好环境,然后直接导入到pycharm中,在pycharm中运行项目 anaconda和pycharm安装及环境配置参考网上博客,有很多博主介绍 2、在anacodna中安装requirements.txt中的软件包 命令为:pip install -r requirements.txt 或者改成清华源后再执行以上命令,这样安装要快一些 软件包都安装成功后才算成功 3、安装好软件包后,把anaconda中对应的python导入到pycharm中即可(不难,参考网上博客) 二、环境配置好后,开始训练(也可以训练自己数据集) 1、数据集准备 需要准备yolo格式的目标检测数据集,如果不清楚yolo数据集格式,或者有其他数据训练需求,请看博主yolo格式各种数据集集合链接:https://blog.csdn.net/DeepLearning_/article/details/127276492 里面涵盖了上百种yolo数据集,且在不断更新,基本都是实际项目使用。来自于网上收集、实际场景采集制作等,自己使用labelimg标注工具标注的。数据集质量绝对有保证! 本项目所使用的数据集,见csdn该资源下载页面中的介绍栏,里面有对应的下载链接,下载后可直接使用。 2、数据准备好,开始修改配置文件 参考代码中data文件夹下的banana_ripe.yaml,可以自己新建一个不同名称的yaml文件 train:训练集的图片路径 val:验证集的图片路径 names: 0: very-ripe 类别1 1: immature 类别2 2: mid-ripe 类别3 格式按照banana_ripe.yaml照葫芦画瓢就行,不需要过多参考网上的 3、修改train_dual.py中的配置参数,开始训练模型 方式一: 修改: a.--weights参数,填入'yolov9-s.pt',博主训练的是yolov9-s,根据自己需求可自定义 b.--cfg参数,填入 models/detect/yolov9-c.yaml c.--data参数,填入data/banana_ripe.yaml,可自定义自己的yaml路径 d.--hyp参数,填入hyp.scratch-high.yaml e.--epochs参数,填入100或者200都行,根据自己的数据集可改 f.--batch-size参数,根据自己的电脑性能(显存大小)自定义修改 g.--device参数,一张显卡的话,就填0。没显卡,使用cpu训练,就填cpu h.--close-mosaic参数,填入15 以上修改好,直接pycharm中运行train_dual.py开始训练 方式二: 命令行方式,在pycharm中的终端窗口输入如下命令,可根据自己情况修改参数 官方示例:python train_dual.py --workers 8 --device 0 --batch 16 --data data/coco.yaml --img 640 --cfg models/detect/yolov9-c.yaml --weights '' --name yolov9-c --hyp hyp.scratch-high.yaml --min-items 0 --epochs 500 --close-mosaic 15 训练完会在runs/train文件下生成对应的训练文件及模型,后续测试可以拿来用。 三、测试 1、训练完,测试 修改detect_dual.py中的参数 --weights,改成上面训练得到的best.pt对应的路径 --source,需要测试的数据图片存放的位置,代码中的test_imgs --conf-thres,置信度阈值,自定义修改 --iou-thres,iou阈值,自定义修改 其他默认即可 pycharm中运行detect_dual.py 在runs/detect文件夹下存放检测结果图片或者视频 【备注】 1、该资源内项目代码都经过测试运行成功,功能ok的情况下才上传的,请放心下载使用!有问题请及时沟通交流。 2、适用人群:计算机相关专业(如计科、信息安全、数据科学与大数据技术、人工智能、通信、物联网、自动化、电子信息等)在校学生、专业老师或者企业员工下载使用。
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