【error】ImportError: /lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found (required by

报错信息：

ImportError: /lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found 
(required by anaconda3/lib/python3.6/site-packages/scipy/sparse/_sparsetools.cpython-36m-x86_64-linux-gnu.so)

报错位置：

Traceback (most recent call last):
  File "XXX.py", line 9, in <module>
    import preprocessing
  File "/。。rocessing.py", line 11, in <module>
    from sklearn.metrics.pairwise import cosine_similarity

报错原因：单独运行python preprossing却未报错。怀疑是因为升级了pytorch0.1->0.3导致某些库没有更新对应不上。

参考网址：http://libowei.net/ImportError-usr-lib64-libstdc-so-6-version-CXXABI-1-3-7%E2%80%99-not-found.html出现这个问题的原因是没有链接到CXXABI库的最新的版本。下面贴上我的步骤：

步骤一：通过下面的命令查看/usr/lib64/下的动态库版本，发现没有`CXXABI_1.3.9'

[zs@gpu]$ strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep 'CXXABI'
CXXABI_1.3
CXXABI_1.3.1
CXXABI_1.3.2
CXXABI_1.3.3
CXXABI_1.3.4
CXXABI_1.3.5
CXXABI_1.3.6
CXXABI_1.3.7
CXXABI_TM_1

步骤二：用下面命令查找动态库文件：太多，此处只贴两个有用的动态库。其中6.0.21为最新,包含所需的1.3.9

[zs@gpu]$ find / -name "libstdc++.so.6*"
/usr/lib64/libstdc++.so.6
/usr/lib64/libstdc++.so.6.0.19
/opt/intel/linux/brew/linuxbrew/lib/libstdc++.so.6.0.21

步骤三：

检查[zs@gpu lib64]$ strings /opt/intel/linux/brew/linuxbrew/lib/libstdc++.so.6.0.21 | grep 'CXXABI'可以使用
CXXABI_1.3
CXXABI_1.3.1
CXXABI_1.3.2
CXXABI_1.3.3
CXXABI_1.3.4
CXXABI_1.3.5
CXXABI_1.3.6
CXXABI_1.3.7
CXXABI_1.3.8
CXXABI_1.3.9
CXXABI_TM_1
CXXABI_FLOAT128

步骤四：

$ cp /opt/intel/linux/brew/linuxbrew/lib/libstdc++.so.6.0.21  ~/anaconda3/lib/

再次运行程序却发现仍有错误。

 

一个原因是：文件指向不对

[zsun@gpu09 ~]$ ll ~/anaconda3/lib/libstdc++.so*
lrwxrwxrwx. 1 zsun users      19 2月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so -> libstdc++.so.6.0.21
lrwxrwxrwx. 1 zsun users      19 2月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6 -> libstdc++.so.6.0.21
-rwxrwxr-x. 2 zsun users 1055192 11月 15 2016 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.19
-rw-rw-r--. 1 zsun users    2335 1月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.19-gdb.py
-rwxr-xr-x. 3 zsun users 8167184 1月   6 09:02 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.24

于是执行ln -s libstdc++.so.6.0.24 libstdc++.so.6重新构建动态库libstdc++.so.6

[zsun@gpu09 ~]$ mv /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.bak21
[zsun@gpu09 ~]$ ll ~/anaconda3/lib/libstdc++.so*
lrwxrwxrwx. 1 zsun users      19 2月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6 -> libstdc++.so.6.0.21
-rwxrwxr-x. 2 zsun users 1055192 11月 15 2016 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.19
-rw-rw-r--. 1 zsun users    2335 1月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.19-gdb.py
-rwxr-xr-x. 3 zsun users 8167184 1月   6 09:02 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.24
lrwxrwxrwx. 1 zsun users      19 2月   5 2018 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.bak21 -> libstdc++.so.6.0.21
[zsun@gpu09 ~]$ ln -s /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.24 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so
[zsun@gpu09 ~]$ mv /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.bak21
[zsun@gpu09 ~]$ ln -s /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6.0.24 /users4/zsun/anaconda3/lib/libstdc++.so.6

重新运行，发现错误解决

 

另一种原因是：程序未找到anaconda下的动态库存放地点。是因为：个人的LD_LIBRARY_PATH中不包括anancoda的路径

解决方法：

$ vim  ~/.bash_profile 

在文件中添加如下代码

LD_LIBRARY_PATH=/~/anaconda3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH

$ source  ~/.bash_profile

 

再次运行最初想运行的程序。

成功，错误解决。

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如果具有root权限，则可以直接按照链接所示方法，操作/usr下的链接库（若没有则按照文章所示方式）

把anaconda下包含CXXABI_1.3.9的libstdc++.so.6.0.21放到usr/lib64/内重新链接升级。

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也有一种简单的方法：由于观察到报错内容与scipy有关，于是卸载了scipy与sklearn，重新安装。

再次运行最初想运行的程序。

成功，错误解决。