非root用户安装caffe

最新推荐文章于 2023-02-21 14:48:13 发布
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分类专栏： python
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版权

踩坑绵绵无绝期，完美总结版

初步整理了一下，不想继续整理了，先这样吧

折腾了5天，我是垃圾

此版适合：

  • 没有root权限的普通孩子

  • 对linux系统不熟悉，里面可能有做的多余的地方

经验

  • 问题一般都是版本问题跟路径问题

  • 有奇怪的问题就卸掉重装

  • caffe重新cmake之前最好删掉cmakecache.txt和cmakefiles文件夹

 

安装依赖项

 

安装protobuf     2.6.1（caffe要安这个版本）

      第一次安的3.15.6，不行

#无法下载，手动下载

下载地址：https://github.com/google/googletest/tree/release-1.5.0

参考：http://www.likecs.com/show-129322.html

#如果permission denied ，修改文件权限：chmod +x autogen.sh

#prefix是指定安装目录，没有root权限的可以随意设置一个，如：$HOME/bin等，

#之后记得修改 ~/.bashrc 文件

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/lib

export PATH=$PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/bin

export PKG_CONFIG_PATH=$PKG_CONFIG_PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/lib/pkgconfig/

  1. 下载解压     https://github.com/protocolbuffers/protobuf/tree/2.7.0

  2. 进入文件夹 cd ./protobuf

  3. 缺少google test库：(用1.5.0的可以），把下载的googletest库放到：/opt/RDB/protobuf-2.6.1，改名为gtest（先删除之前老的），

  4. ./autogen.sh 

  5. ./configure --prefix=$HOME/bin/protocbuf_2_6_1  

  6. make

  7. make install

  8. 变量设置

 

查看版本信息的方法：进入bin目录，有protoc文件。./protoc --version

 

安装boost1_67_0

第一次安了1_75,说版本高，后来又安了1_45，说版本低

include：/home/wangsuwei/program/boost_1_67_0 \

 lib：/home/wangsuwei/program/boost_1_67_0/stage/lib \

报错 permission denied chmod +x bootstrap.sh  

          报错build.sh permission denied  

          chmod +x  ./tools/build/src/engine/build.sh

  1. 下载解压

  2. 进入目录 cd ~/source/

  3. 注意如果有多个python，设置python版本。怎么设置见问题合集，搜索boost，一定要看

  4.  ./bootstrap.sh -with-libraries=all --with-toolset=gcc --with-python=/usr/bin/python2.7 --prefix=$HOME/bin/boost_1_67_0  

  5. ./b2 

  6. ./b2 install --prefix=$HOME/bin/boost_1_67_0     

  7. 进入boost安装目录下/lib，创建软连接指向文件位置，ln -s libboost_python27.so libboost_python.so

 

安装gflags，lunwind,  glog,

需要先安装gflags，unwind,再安装glog。

gflags

#cmake 的时候要指定shared_libs=on，否则之后会很多关于share的error。

  1. 下载解压：手动下载，丰衣足食https://codeload.github.com/gflags/gflags/zip/master

  2. 进入目录

  3. mkdir build && cd build

  4. #ccmake ..  修改DBUILD_SHARED_LIBS=ON，和安装路径！！！！

  5. cmake -DBUILD_SHARED_LIBS=ON -DGFLAGS_NAMESPACE=google -G "Unix Makefiles” ../

  6. make

  7. make  install

参考：

https://cmake.org/cmake/help/v3.10/envvar/LDFLAGS.html

https://blog.csdn.net/whatday/article/details/88410313

 

unwind(glog需要unwind)

  1. 下载地址：https://github.com/libunwind/libunwind

  2. CFLAGS=-fPIC

  3. chmod +x autogen.sh

  4. ./autogen.sh --prefix=$HOME/bin --enable-shared

  5. make CFLAGS=-fPIC 

  6. make CFLAGS=-fPIC install  

 

glog

  1. 下载解压：手动下载，丰衣足食https://github.com/google/glog

  2. 进入目录

  3. mkdir build && cd build

  4. #ccmake ..  修改DBUILD_SHARED_LIBS=ON，安装路径，设置unwind路径（3个）。t进入高级模式往下翻就行！！！！

  5. cmake   

  6. make

  7. make  install

 

 

安装leveldb ，lbdb，hdf5，openblas，snappy

这些的安装跟前面大同小异

      snappy（openblas需要它）

      下载链接： https://codeload.github.com/google/snappy/zip/refs/heads/master

 

openblas

git clone git://github.com/xianyi/OpenBLAS  #https://codechina.csdn.net/mirrors/xianyi/openblas

  1. make USE_MASS=0#因为没有安装mass

  2. make install PREFIX=/home/wangsuwei/bin

LMDB

  1. git clone https://github.com/LMDB/lmdb

  2. cd ./lmdb-mdb.master/libraries/liblmdb

  3.      make

  4. make PREFIX=/home/wangsuwei/bin install 

#??怎么还是往usr/local写？

换下面的做法：

  1. 修改makefile文件，prefix  = /home/wangsuwei/bin

  2. make

  3. make install

LevelDB

  1. git clone https://github.com/google/leveldb

  2. 下载googletest和benchmark，放到thirdparty文件夹中，并修改名字，去掉master

https://github.com/google/benchmark

https://github.com/google/googletest

  1.      mkdir build && cd build

  2. export CXXFLAGS="-fPIC" 

  3.           ccmake ..  #修改安装路径！！！！

  4. cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release .. && cmake --build .

  5. make 

  6. make install

HDF5

这是个大坑，下载了多个版本都不行，最后使用了anaconda带的hdf。

git https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/hdf5-1.10.4.tar   #https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/

  1. chmod +x configure

  2. ./configure --prefix=/home/wangsuwei/bin/hdf_1_8

  3. make

  4. make install

 anaconda虽然解决了这个问题，但是会带来新的坑，就是又多了一个python。

根据后面出现的问题，觉得protobuf的find_package的处理可能有帮助，但是心好累，能用就好了。。。

 

配置caffe

下载caffe，并解压

cd caffe

cp Makefile.config.example Makefile.config

修改配置

修改的文件，

makefile.config

  BLAS := open

  1. opencv是3版本的，取消注释 OPENCV_VERSION=3

  2. 修改cuda，python目录

  3. 设置BLAS方式和include，lib的路径

  4. 如果是用 的anaconda的python，设置其目录和python_include 目录

  5. 修改 INCLUDE_DIRS 和LIBRARY_DIRS，将之前安装的依赖包的 include 和lib文件路径，写进去。

cmakelist

找到下面添加 -std=c++11

if(UNIX OR APPLE)

set(CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS} -fPIC -Wall -std=c++11")

endif()

cmake/Modules中的find文件的路径

  1. moudles中findGFlags，FindGlog，FindLMDB，FindLevelDB

  2. cmake中ProtoBuf的find_package的替换

  3. cmake中Dependencies.cmake中opencv相关变量的设置，不想研究了，直接写成绝对路径了，指定opencv版本

cmake，里面可能有没用的，最后能用就行

cmake . $caffe_root -G "Unix Makefiles" \

-DBLAS=open \

-DGLOG_ROOT_DIR=/home/wangsuwei/bin \

-DGFLAGS_ROOT_DIR=/home/wangsuwei/bin \

-DLMDB_DIR=/home/wangsuwei/bin \

-DLEVELDB_ROOT=/home/wangsuwei/bin \

-DSNAPPY_ROOT_DIR=/home/wangsuwei/bin \

-DBOOST_ROOT=/home/wangsuwei/bin/boost_1_67_0 \

-DProtobuf_DIR=/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1

make -j

make pycaffe

export PYTHONPATH=$(pwd)/python:$PYTHONPATH

参考：https://blog.csdn.net/y_ear/article/details/84622383

 

备用

#进入boost安装目录下/lib，创建软连接指向文件位置，ln -s libboost_python27.so libboost_python.so

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/lib

export PATH=$PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/bin

export PKG_CONFIG_PATH=$PKG_CONFIG_PATH:/home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/lib/pkgconfig/

export PATH=$PATH:/home/wangsuwei/bin

 

 

出现过的问题：

问题1 找不到propoc

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/wangsuwei/bin/lib

export PATH=$PATH:/home/wangsuwei/bin/bin

export PKG_CONFIG_PATH=$PKG_CONFIG_PATH:/home/wangsuwei/bin/lib/pkgconfig/

 

问题2:编译选项问题

https://blog.csdn.net/m_buddy/article/details/88085425

/usr/include/c++/5/bits/c++0x_warning.h:32:2: error: #error This file requires compiler and library support for the ISO C++ 2011 standard. This support must be enabled with the -std=c++11 or -std=gnu++11 compiler options.

 

    /usr/include/c++/4.9/bits/c++0x_warning.h:32:2: error: #error This file requires compiler and library support for the ISO C++ 2011 standard. This support is currently experimental, and must be enabled with the -std=c++11 or -std=gnu++11 compiler options.

    #error This file requires compiler and library support for the

    /usr/local/include/google/protobuf/arena.h:324:36: note: template argument deduction/substitution failed:

    Makefile:600: recipe for target ‘.build_release/src/caffe/proto/caffe.pb.o’ failed

    make: *** [.build_release/src/caffe/proto/caffe.pb.o] Error 1

解决方案

打开Makefile文件，给CXXFLAGS、NVCCFLAGS、LINKFLAGS都使用-std=c++11标准编译：

CXXFLAGS += -pthread -fPIC $(COMMON_FLAGS) $(WARNINGS)

改为：

CXXFLAGS += -pthread -fPIC $(COMMON_FLAGS) $(WARNINGS) -std=c++11

NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)

改为：

NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)  -std=c++11make

LINKFLAGS += -pthread -fPIC $(COMMON_FLAGS) $(WARNINGS)

改为：

LINKFLAGS += -pthread -fPIC $(COMMON_FLAGS) $(WARNINGS) -std=c++11

 

问题3 levelDB 找不到

在生成动态库时，常常习惯性的加上fPIC选项，fPIC有什么作用和意义，加不加有什么区别，这里做下小结：fPIC的全称是 Position Independent Code， 用于生成位置无关代码。什么是位置无关代码，个人理解是代码无绝对跳转，跳转都为相对跳转。

解决方案

重新安装leveldb

make前加入 export CXXFLAGS="-fPIC" 

 

问题4 找不到lsnappy，找不到libboost_python

安装snappy库 https://codeload.github.com/google/snappy/zip/refs/heads/master

cblas，lapack  修改makefile文件：BLAS := open

boost 创建软连接指向文件位置，ln -s libboost_python27.so libboost_python.so

注意：

一开始设置BLAS := open就好，后来不行了，在cmake后加选项 -DBLAS=open

 

问题5,6,7,8本质上是一类问题

问题5 cmake 找不到gflag，glog

原因 参考https://blog.csdn.net/10km/article/details/72967656

这个问题的根本原因在于代码作者对cmake的find_library的查找机制没有全搞明白

简单说就是调用find_library时，会以从一组路径中顺序查找指定的库，这有一个优先序问题，如果没有指定了NO_DEFAULT_PATH，则会先查找默认的系统库路径

如果指定了NO_DEFAULT_PATH，则只查找PATHS提供的路径，不会查找系统库路径。因为所以原始代码中没有加NO_DEFAULT_PATH导致每次只能找到系统路径下的库。

如何保证PATHS指定的路径优先被搜索呢？

解决的办法cmake官网也给出来了，就是调用两次find_library，第一次加NO_DEFAULT_PATH，第二次则不加。

方法

cmake .. $caffe_root -G "Unix Makefiles" \

-DGLOG_ROOT_DIR=/home/wangsuwei/bin \

-DGFLAGS_ROOT_DIR=/home/wangsuwei/bin

修改FindGlog.cmake,FindGFlags.cmake

注意添加/include；  NO_DEFAULT_PATH

 

 

问题6 找不到 protobuf（这个解决方案不行，后面还会出问题，略过，也不是完全错误，而是做了一半，后面有类似问题，采用了两种解决方案）

在问题12中得到解决

参考：

https://blog.csdn.net/fb_941219/article/details/88526157

https://zhuanlan.zhihu.com/p/50829542

方法：

  1. 在caffe/cmake中找到ProtoBUf.cmake。

  2. 在ProtoBUf.cmake找到中加find_package( Protobuf REQUIRED)，前面加入：

set(Protobuf_DIR /home/wangsuwei/bin/)

set(Protobuf_INCLUDE_DIR /home/wangsuwei/bin/include)

set(Protobuf_LIBRARIES /home/wangsuwei/bin/lib)

图示：

问题7  找不到HDF5，找到版本1,12,0！！

 

 

#下载了1.8,1.10,1.12都不行

#最后使用anaconda自带的hdf5，

 

set(HDF5_DIR /home/wangsuwei/bin/)    没用

set(HDF5_INCLUDE_DIRS /home/wangsuwei/bin/include)

set(HDF5_LIBRARIES /home/wangsuwei/bin/lib)

 

加到path里  没用

export HDF5_DIR=/home/wangsuwei/bin 没用

 

猜测是版本不匹配

export HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK=1  没用

 

问题8找不到LMDB

cmake/moudles/FindLMDB中

 

find_path(LMDB_INCLUDE_DIR NAMES  lmdb.h PATHS "$ENV{LMDB_DIR}/include")

find_library(LMDB_LIBRARIES NAMES lmdb   PATHS "$ENV{LMDB_DIR}/lib" )

改为

find_path(LMDB_INCLUDE_DIR NAMES  lmdb.h PATHS ${LMDB_DIR}/include NO_DEFAULT_PATH)

find_path(LMDB_INCLUDE_DIR NAMES  lmdb.h PATHS ${LMDB_DIR}/include)

find_library(LMDB_LIBRARIES NAMES lmdb   PATHS ${LMDB_DIR}/lib NO_DEFAULT_PATH)

find_library(LMDB_LIBRARIES NAMES lmdb   PATHS ${LMDB_DIR}/lib )

LevelDB

find_library(LevelDB_LIBRARY NAMES leveldb

                             PATHS /usr/lib ${LEVELDB_ROOT}/lib

                             DOC "Path to leveldb library." NO_DEFAULT_PATH)

find_library(LevelDB_LIBRARY NAMES leveldb

                             PATHS /usr/lib ${LEVELDB_ROOT}/lib

                             DOC "Path to leveldb library.")

 

export LD_LIBRARY_PATH=/home/wangsuwei/bin/lib:$LD_LIBRARY_PATH #不行

export C_INCLUDE_PATH=/home/wangsuwei/bin/include:$C_INCLUDE_PATH

export CPLUS_INCLUDE_PATH=/home/wangsuwei/bin/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

 

问题9：protobuf requires c++11

在Makefile或者CMakeLists.txt中增加 -std=c++11

if(UNIX OR APPLE)

set(CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS} -fPIC -Wall -std=c++11")

endif()

https://blog.csdn.net/sdlypyzq/article/details/108791239

指定编译器为gcc：没用

export CC=/usr/bin/gcc 

export CXX=/usr/bin/g++

 

问题10 boost版本

下了三个版本，1.75太新，1.46太旧，1.67可以

 

问题解析：版本太新

https://stackoverflow.com/questions/65560775/cmake-new-boost-version-may-have-incorrect-or-missing-dependencies-and-importe

确定cmake对应的版本https://cmake.org/cmake/help/v3.12/module/FindBoost.html

下载地址 ：https://dl.bintray.com/boostorg/release/1.75.0/source/

 

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/wangsuwei/bin/lib

 

问题11  cmake问题

 found thefollowing Boost libraries

could not find boost

python interface is disabled or not all required dependencide found.Builing without it.

 

d

参考：https://www.jianshu.com/p/17a5fdbfa8a9

在\tools\build\example下的user-config.jam中最后一行指定python

# Configure specific Python version.

using python : 2.7 : /usr/bin : /usr/include/python2.7 : /usr/lib/python2.7 ;

  1. 查看boost中的python是不是 libboost_python27.dylib ，我的是 libboost_python38.dylib 得到，就悲剧了。那就重新安装boost

  2. 指定使用的python版本，重新安装

  3. .\bootstrap 中添加参数：--with-python="python/bin/python27"

  4. 安装时出现icu的问题，没管。。。。心累

  5. 别忘了ln -s 那一行

问题12

make -j 错误 undefined reference to `google::protobuf:

之前忽略掉了protobuf的warning，还是得解决

原因：protobuf是自己安装的，使用find_package是找不到的，需要自己找路径

参考：https://www.jianshu.com/p/2946b0e5c45b

修改ProtoBuf.cmake

注释掉#find_package( Protobuf REQUIRED)

替换为：

include(FindPackageHandleStandardArgs)

set(Protobuf_DIR /home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1)

set(PROTOBUF_PROTOC_EXECUTABLE /home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/bin/protoc)

#set(Protobuf_INCLUDE_DIR /home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/include)

#set(Protobuf_LIBRARIES /home/wangsuwei/bin/protocbuf_2_6_1/lib)

find_path(Protobuf_INCLUDE_DIR

    google/protobuf/service.h

    PATHS ${Protobuf_DIR}/include NO_DEFAULT_PATH

)

find_path(Protobuf_INCLUDE_DIR

    google/protobuf/service.h

    PATHS ${Protobuf_DIR}/include

)

find_library(Protobuf_LIBRARIES NAMES libprotobuf.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib NO_DEFAULT_PATH)

find_library(Protobuf_LIBRARIES NAMES libprotobuf.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib )

find_library(Protobuf_LITE_LIBRARIES NAMES libprotobuf-lite.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib NO_DEFAULT_PATH)

find_library(Protobuf_LITE_LIBRARIES NAMES libprotobuf-lite.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib)

find_library(Protobuf_PROTOC_LIBRARIES NAMES libprotoc.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib NO_DEFAULT_PATH)

find_library(Protobuf_PROTOC_LIBRARIES NAMES libprotoc.so   PATHS ${Protobuf_DIR}/lib )

find_package_handle_standard_args(PROTOBUF DEFAULT_MSG Protobuf_INCLUDE_DIR Protobuf_LIBRARIES Protobuf_LITE_LIBRARIES Protobuf_PROTOC_LIBRARIES)

if(PROTOBUF_FOUND)

    set(PROTOBUF_DIR ${Protobuf_DIR})

    set(PROTOBUF_INCLUDE_DIR ${Protobuf_INCLUDE_DIR})

    set(PROTOBUF_LIBRARIES ${Protobuf_LIBRARIES})

    set(PROTOBUF_LITE_LIBRARIES ${Protobuf_LITE_LIBRARIES})

    set(PROTOBUF_PROTOC_LIBRARIES ${Protobuf_PROTOC_LIBRARIES})

    #message(STATUS "Found gflags  (include: ${GFLAGS_INCLUDE_DIR}, library: ${GFLAGS_LIBRARY})")

    mark_as_advanced(PROTOBUF_LITE_LIBRARIES PROTOBUF_PROTOC_LIBRARIES

                     PROTOBUF_LIBRARIES Protobuf_INCLUDE_DIR PROTOBUF_DIR PROTOBUF_PROTOC_EXECUTABLE)

endif()

 

问题13 opencv找不到部分路径

make -j报错

猜测是因为opencv是我自己装的

dependencies强制改：

set(OpenCV_DIR "/home/wangsuwei/program/opencv3")

set(OpenCV_INCLUDE_DIRS "/home/wangsuwei/program/opencv3/include")

set(OpenCV_LIBS "/home/wangsuwei/program/opencv3/libopencv_core.so /home/wangsuwei/program/opencv3/libopencv_highgui.so /home/wangsuwei/program/opencv3/libopencv_imgproc.so /home/wangsuwei/program/opencv3/libopencv_imgcodecs.so")

 

https://blog.csdn.net/haluoluo211/article/details/80559341

https://www.jianshu.com/p/39fc5e548310

 

问题14：undefined reference to 'ULx86_64_step

 

Glog links to libunwind atomically. You can remove libunwind to avoid the dependency. Or you can try to install libunwind-devel.

安装unwind

  1. 下载地址：https://github.com/libunwind/libunwind

  2. CFLAGS=-fPIC

  3. chmod +x autogen.sh

  4. ./autogen.sh --prefix=$HOME/bin --enable-shared

  5. make CFLAGS=-fPIC 

  6. make CFLAGS=-fPIC install  

  7. 重新安装 glog

 

 

 

 

 

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