ITK-snap实现seg添加到其他模态中
标题写得比较土,原因是我担心很多人不知道该怎么学术地去描绘这个过程。
第一步
首先,你需要有数据集,比如brats 2018、brats 2019,这两个数据集数据类型是一样的,但是HGG与LGG的数目是不一致的。
以上是一个简单的brats_2019展示样例,包含4种模态以及seg
第二步
其次,你需要一个可视化软件,或许服务器上对.nii.gz文件进行切片展示也是一个不错的主意。我个人建议使用ITK-SNAP,如图:
ITK-SNAP就是最上面的那个红色快捷键
第三步
打开某一个模态,比如 t1 模态
第四步
将seg拉入此时的ITK-SNAP操作框,就可以看到脑瘤及其子区域标记后的分割结果啦。
选择 load as segmentation就ok啦
以上就是一个非常简单的.nii.gz展示方案。数据集的获取有多种途径,cbica注册以后申请数据集就可以,或者别人分享的百度网盘。祝你顺利!