Python 化学教程之标准化机制：SMILES 中的 Diers-Alder 反应

最新推荐文章于 2024-07-21 11:38:08 发布

code2day

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分类专栏： Python源码技巧大全文章标签： bash 开发语言 python

本文链接：https://blog.csdn.net/code2day/article/details/128758024

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本文介绍了Diers-Alder反应在有机化学中的应用，该反应通过二烯与乙烯作用形成环己烯。文章利用Python解释了如何在SMILES表示法中描述这种反应机制，并展示了如何将SMILES转换为化学结构图。

摘要由CSDN通过智能技术生成

Diers-Alder 反应是教授有机化学学生形成环的常见反应。

反应非常简单，二烯与乙烯反应形成环己烯：

在这里插入图片描述

那么让我们继续我们写反应的方式：

starting_material = 'C=CC=C'
reactant_one = 'C=C'

那么会发生什么，这种机制会同时发生以形成环。每个箭头都可以被视为虚拟键，直到它成为一个。

在这里插入图片描述
所以我们可以像这样在 SMILES 中写这个

first_step_mechanism = 'C1~CC~CC~C1'

最终产品是环己烯，我们可以将其复制/粘贴到 ChemDraw 中：

final_product = 'C1=CCCCC1'

在这里插入图片描述

我们可以将这个完整的机制写成：

diers_alder = { 
    'reactants' : [ 'C=CC=C' , 'C=C' ] 
    'step_1' : 'C1~CC~CC~C1' , 
    'step_2' : [ 'C1=CCCCC1' ] 
}

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