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原创 CLEAN工具成功安装经历——蛋白酶精准预测工具
CLEAN是2023年发表在Science主刊上的一篇文章开发的工具，其对酶蛋白的分类预测（功能预测）为目前行精准度最高。；原作者提供CLEAN程序的github地址。
2025-01-09 11:13:04
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原创 CLEAN蛋白酶功能预测工具介绍 目前最精准的酶功能预测工具
CLEAN蛋白酶预测工具（在线或单机在线版每IP每次只能提交一个任务，序列数量有限；但是对于一般人而言，已经足够；单机版没有蛋白序列书限制，但是需要一定的Linux基础（要么学，要么花钱买方便），但最最重要的，还是这个工具的确是很好很出色。
2025-01-01 13:35:06
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原创 全基因组蛋白分泌表达预测与优化 -- 策略-附流程图
DeepLocfor真核生物，DeeplocProfor原核生物，TargetPfor植物、线粒体、叶绿体等蛋白靶向的预测。另有非信号肽依赖的外分泌途径，不在此列；此处主要是方便外分泌蛋白的分析和信号肽优化目的。•TMHMMv2.0–跨膜结构预测，是否存在跨膜结构–迭代版为。原网站很多国内IP已被屏蔽，每IP有次数、条数限制；提供全基因组（千条）、宏基因组（万至千万条序列批量分析）得到了该菌通过信号肽机制外分泌的全部分泌蛋白。目前最新、最精确的分泌信号肽预测软件。
2024-12-24 13:09:19
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原创 原核生物表达异源蛋白--最佳分泌信号肽筛选策略--思路来自2018年的文献
这些结果表明，通过构建和筛选信号肽库可以有效地提高目标蛋白的分泌效率，并且对于不同的目标蛋白，需要筛选和鉴定个体最优的信号肽。
2024-12-23 07:31:40
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原创 真核生物异源蛋白高效分泌表达策略--分泌信号肽优化方案
不论是古细菌、细菌（革兰氏阳性、革兰氏阴性）还是酵母，都存在这样的表达体系，学界也存在大量有关信号肽的研究和优化策略；这个有些难度，但是也有不少相关文献出现，主要是对表达原件的优化，如-35区、-10区、密码子优化、双重启动子、敲除阻遏蛋白等方案。1 分析该菌株（表达菌株）的全基因组（全蛋白组得到的结果应该更精确些）对应蛋白的分泌信号肽，得到一个信号肽库；通过蛋白或核算测序，得到对应的信号肽序列，或其编码序列。蛋白分泌表达，现在知晓的途径，可大致分两大类：一类是依赖于信号肽，一类是不依赖于信号肽；
2024-12-20 10:33:05
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原创 三代测序数据挖掘特定功能基因--之pacbio测序数据挖掘--纳米孔测序、GenoCare等二代、三代测序--挖掘特定功能基因
从宏基因组测序数据中挖掘特定功能基因--生物信息学；Pfam功能批注、信号肽预测、blastp、CLEAN分析等；
2024-06-28 15:04:56
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原创 Chrome浏览器使用IDM下载时，如何设置对特定站点（网站）的单线程下载（默认所有站点都是多线程下载）？--idm单线程下载--internetdownloadmanager
这样设置以后，对所有网站都是单线程下载（可能不能够发挥对大多数网站资源下载时，网速的最大化优势）比较适用于从特定网站多线程下载出错时的解决方案+预防方案（以后也不给它出错的机会）；方案1：主界面——选项——连接——新建——添加你想要单线程下载的网址即可。给一个图，看着更加一目了然；方案一、二尽在其中；
2025-03-17 16:18:59
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原创 重点介绍 ---- 全蛋白组序列比对 全基因组序列比对 -- 大批量序列比较 -- batch blast
两个蛋白组序列文件的比较——可以是全蛋白组测序得到的序列组文件（轻松拿捏）、可以是三代测序得到的蛋白序列组文件{pacbio、纳米孔等三代测序技术}（后者难度稍大，是否能够分析，取决于数据量的大小）（2）可以对某个基因、某个菌株的连续进化进行分析，在蛋白水平描述这种进化的变异程度——对不同代次的序列有不同的编号；多个蛋白序列与全蛋白组的比较——batch blast——对单个蛋白与蛋白组之间的比较进行批量化。单个蛋白与菌株全蛋白组的比较——匹配相似序列的蛋白、匹配对应的功能关系；比如某宝，比如某鱼；
2025-02-28 11:19:58
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原创 序列进化树-系统进化树-图谱记录-分享个好看的
忙了几天，终于搞定了几个好看的进化树图片，纪念一下；可以输出为高清的，O~yeah ~~!亲缘关系极近的序列进化树图谱构建；
2025-01-21 16:33:23
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原创 台式电脑硬件升级方案——通用版 -- 笔记本硬件升级也可参考
一般可考虑是是，可拔插的CPU，内存条，硬盘这三大件；首先，用360软件管家或是直接去aida官网下载一个免费版的aida x64软件（使用即可满足你的所有硬件检测需求）（很多人鄙视360他们家的东西，可也确实免费好用——设置好了也可以无广告弹窗），aida64这个,在选购内存条时，很实用；
2025-01-15 18:31:32
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原创 小孩感冒嗓子红肿，咽红且痛，微恶风寒，无浑身疼痛，无清鼻涕
符合题目所述，为典型的“空调病”，多见于北方的冬季；室内水暖加热的并不明显，用空调加热，或水暖+空调的，很明显；此阶段的病例，请及时到专业机构就诊，如途中遥远，可考虑稍服用退烧药物，以防高烧烧坏身体，造成不可逆损伤；再进，嗓子肿痛，高烧超过39.5℃——已明显属于重症；咽红肿痛，且有自腐，咳嗽，痰中可能带血，咳嗽时胸中刺痛；此风温化热，逆传心包，防其增重；无基础的各位，有问题、身体不适，最好还是到专业医疗机构及时就诊；出现典型的：咽红且痛，口微渴，舌边尖红，苔薄白，两脉浮数。再进，嗓子肿痛，开始发烧；
2025-01-05 10:56:56
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原创 所谓MRSA -- 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌--惊吓到过一大批人
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种对甲氧西林及其他β-内酰胺类抗生素具有耐药性的金黄色葡萄球菌菌株。MRSA首次发现于1961年。它分为医院相关性MRSA（HA-MRSA）和社区相关性MRSA（CA-MRSA），前者主要在医院环境中传播，而后者则在社区中传播。
2025-01-04 16:21:22
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原创 win10怎么启动开机修复
3、在命令提示符中输入修复命令，例如“sfc /scannow”或“bootrec /fixmbr”。1、在win10登录界面，按住 shift 键，并点击电源图标，选择重启电脑进入高级选项。3、选择“修复计算机” -> “疑难解答” -> “高级选项”。2、选择“疑难解答” -> “高级选项” -> “命令提示符”。2、选择“疑难解答” -> “高级选项” -> “启动修复”。2、选择“疑难解答” -> “高级选项” -> “启动设置”。4、选择要使用的修复工具，例如“启动修复”或“系统还原”。
2024-12-24 13:18:20
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原创 win10系统由于C盘后面存在“恢复分区”而无法扩展（扩容）的解决方案 -- -- 来自thinkbook的成功案例
2）选中“恢复分区”//分区——调整分区大小——把“恢复分区”调整到最后，将未分区（可用于系统分区C的跨容）部分调整到前面紧连C盘的位置【有需要保存时保存……4）此时，采用系统的 “磁盘管理” 模式，进行容量调整【成功了！-- thinkbook成功案例】3）选中C盘，调整分区大小【有可能不可调整//调整按钮不可选】；1）删除“恢复分区”后面的磁盘，不分区。1 首先现在和安装diskgenius。2 调整“恢复分区”的大小及位置：；3 关机——开机，合适了。
2024-12-24 13:16:34
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原创 win10文件资源管理器右键卡死现象解决--win10系统删除后文件夹不自动刷新
2、HKEY_LOCAL_MACHINE，SYSTEM，CurrentControlSet，Control，右击Control，选择新建项，命名为UPdate；4、单击updateMode，在右侧窗口 右击，新建一个可扩充字符串值，命名为DWORD，双击DWORD，修改值为0。即找到这个library location 项，直接删除；3、右击update，新建项，命名为UpdateMode；1、win+R，regedit——打开注册表编辑器；win10文件资源管理器右键卡死现象解决。
2024-12-24 13:14:47
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原创 解决Chrome浏览器访问https提示“您的连接不是私密连接”的问题
2：在弹出的属性对话框中选择"快捷方式"页签，在目标中加入如下起动参数： --test-type --ignore-certificate-errors，点确定按钮。原文链接：https://blog.csdn.net/GGB_GG/article/details/133586963。1： 找到Chrome浏览器的快捷方式，选中该快捷方式，按下鼠标右键，在弹出菜单中选择"属性"；3：开启Chrome浏览器，再次浏览之前出错的https网站，问题应该已经消失。一 ：最简单最粗暴的方法。
2024-12-24 13:11:16
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原创 异源蛋白分泌表达最优化策略--全蛋白组分泌信号肽优化策略--来自2006年的文献
本研究旨在优化革兰氏阳性细菌Bacillus subtilis中异源蛋白的分泌效率。B. subtilis作为一种重要的工业发酵宿主，因其能够分泌大量同源蛋白而被广泛研究。然而，异源蛋白的分泌效率往往较低，因此需要通过系统的方法来识别和优化信号肽（SPs），以提高异源蛋白的分泌。通过这些结果，研究者们展示了通过筛选完整的信号肽库来快速优化几乎任何目标蛋白的出口的强大工具，并强调了开发新的计算机工具以识别信号肽与成熟分泌目标蛋白部分之间复杂相互作用模式的必要性。
2024-12-23 07:38:40
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原创 一个搞生物学研究的人，究竟需要掌握多少基础知识
10）在线数工具及据库：ncbi、CAYZ、kegg、signal、effectorP、protcomp、以及越来越多的新的在线数据库、在线工具的适用；1 序列在线查找和下载：ncbi、欧盟的，日本的（核酸&蛋白）【为什么我们没有呢？2）引物设计：普通pcr，探针（大范围模板条件下，尽可能减少错误引发），荧光定量（其实也就是特定的普通pcr）；9）宏基因组级别的序列的批量分割、抽取、组合、转换（翻译或反向翻译）、特定编号序列的批量抽取。4）（序列水平）引物的特异性分析（不能文献中看到一对引物你就用吧。
2024-12-22 16:09:48
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原创 曝WPS规划求解的一个大bug，Excel软件规划求解的bug也有待fix
则在规划求解种，需要设置每行、每列、每个斜向的单元格数值相加均相等【= 参数】，且个单元格内的数值不同【dif 参数】，且每个单元格的数值【≥1，≤15】，且每个单元格数值为证书【即，取整：int 参数】；Excel的bug就是，它有一个int功能【取整的功能】，可是它偏偏不能直接取整数进行运算，导致25宫格的计算，对于普通计算机【大致3.0的主频，16G的内存的台式机】，耗时达到了2小时以上！而Excel的单变量求解，能够解决这个问题，尽管由他不完美的地方，而且这个bug还不小；
2024-12-03 17:21:40
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原创 发现易数一键还原的一个致命性bug，usb启动盘，usb装机版启动盘，均不能识别pmf格式备份；
3 重启，进入该系统，不论是其自动扫描，还是单击 还原 之后的扫描，都不能对系统重启之前的备份文件 ***.pmf【系统正常，热备份】做出识别；同时，重启按F3之后，能够进入易数还原环境和界面，只是其自身无法找到系统重启之前做的pmf备份文件，无法扫描到或识别到。ghost软件，最起码是在ghost软件本身的还原环境，还是一般的pe环境下，都可以操作的；测试系统，CMGEwindows10，安装了4.3.1的易数，今天刚下载测试的；这个文件只能在正常进入系统的条件下，正常打开软件，才可以正确识别；
2024-12-03 14:46:04
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原创 电脑太慢？鼠标无故反应慢？可行的解决方案--不是鼠标坏，可能是你的设备中招了（中病毒了）
电脑太慢？鼠标无故反应慢？不是鼠标坏，可能是你的设备中招了（中病毒了）
2024-11-15 13:43:39
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原创 完美解决：获取许可时出错。许可服务器通信问题:E STREAM ERROR--:E AUTH BAD DEVICE KEY OR PKCS12
完美解决：获取许可时出错。许可服务器通信问题:E STREAM ERROR--:E AUTH BAD DEVICE KEY OR PKCS12
2024-11-13 17:50:31
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原创 已有纯化蛋白，多抗制备方案参考--制备多克隆抗体
1 抗原准备：抗原可以是 整个金葡菌、别的菌、提取的总蛋白、糖蛋白、脂蛋白、纯化后的蛋白，SDS-PAGE的单个切胶条带；
2024-10-30 16:27:46
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原创 大家有没有觉得腾讯视频越来越恶心了？
什么加更李，要钱就明说嘛，这不是什么可耻的事，你这波操作，愣是让我觉得你可耻不是？2）买会员就是为了要避免广告打扰，你偏偏在页面放各种小广告！龌龊啊，真他娘的流氓，都跟美国鬼子的霸权思维有得一拼了。你等着，我追完这个剧，立即卸载这不要脸的玩意。1）明明买了他们会员，又给你弄出来一个加更礼？我就受累点击关闭吧，你还要我选择为什么要关闭？
2024-09-06 08:47:00
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原创 联想台式机M610更新BIOS后报错，Machine Type or Serial Number is INVALID；解决方案
于是乎，准备好了对应机型的最新版BIOS程序，和下面的两组数据（主机类型和型号//主机序列号），进入win10pe X64版，在pe环境下直接运行BIOS更新程序，过程中选了更新这两组信息（即选择Yes，并输入相应数据）；个人就是吃了这个大亏，从出厂附带的bios（2017年的），莫名的升级为了2023年的版本，升级过程，提示是否需要更新下面这连个信息，个人选择不更新（默认不应该是使用原先的对应信息吗？3，这些数据，在BIOS无重大异常，可以进入桌面系统，或winpe系统时，运行aida软件即可得到；
2024-05-06 14:33:52
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微生物细胞壁中S层蛋白的功能与结构解析及其应用前景
2025-01-04
Physics of Solar Cells - From Principles to New Concepts.pdf
2016-12-04
Virus-host interactions - 病毒与宿主互作
2016-12-04
Molecualr Cloning 3rd edition - 分子克隆 第三版
2016-12-18
磁盘低级格式化工具--支持U盘、硬盘 请谨慎使用
2016-04-10
universal viewer pro 6.7- 万能文件查看器 6.7
2019-04-02
Avian influenza and Newcastle disease
2016-12-04
mega6 setup - 序列比对 进化树分析
2016-12-30
重复文件查找与删除-duplicate file finder
2016-11-21
空空如也
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