核磁数据分析学习笔记[02_预处理、GLM相关]

一、关于shell

1、环境变量

• env|grep xx # 查找环境变量中包含xx的环境变量

• PATH 各种路径

  • 路径之间用：隔开
  • PATH=……：$PATH
  • 命令是在PATH中寻找的

2、补充一些常用命令

• 在文件夹中搜索包含特定字符的文件

  • find
    • find 路径 -name ‘* 字符 *’

• echo 输出

• ls -l dir # 查看权限
  ls -v 自然排序
  ls -a 显示所有（包括隐藏）

• grep （global search regular expression(RE) and print out the line，全面搜索正则表达式并把行打印出来）是一种强大的文本搜索工具，它能使用正则表达式搜索文本，并把匹配的行打印出来。用于过滤/搜索的特定字符。可使用正则表达式能配合多种命令使用，使用上十分灵活。

---

二、核磁数据分析

1、预处理

• 1、预处理在做什么

  • 结构：去皮、场不匀校正（磁场不均匀）、对齐到模板
    • 皮层重建：vertex-based会把沟的褶皱打开，平滑时会基于真实的距离，所以比volume-based更精准【皮层重