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RSS订阅原创 基于深度学习的医学图像分割＜十四＞UDC-Net
Dual-Consistency Semi-supervised Learning with Uncertainty Quantification for COVID-19 Lesion Segmentation from CT Images
2022-01-14 11:14:24
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原创 基于深度学习的医学图像分割＜十三＞Mixed Transformer U-Net For Medical Image Segmentation
MT-TransUNet
2022-01-11 21:53:13
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原创 基于深度学习的医学图像分割 ＜十二＞
Patch-Free 3D Medical Image Segmentation Driven by Super-Resolution Technique and Self-Supervised Guidance原文链接提出一种Patch Free三维医学图像分割方法，在低分辨率输入的情况下实现高分辨率分割。1.多任务学习框架：语义分割＋超分辨率（恢复高分辨率细节）＋自监督指导（使用原始高分辨图像作为指导图像，保留高频信息）2.引入Task-Fusion模块，发掘分割和超分辨率的内在联系超分辨率和
2021-12-30 19:50:41
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原创 （十二）MaskFormer
Per-Pixel Classification is Not All You Need for Semantic Segmentation
2021-12-28 21:18:52
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记（十一）nnU-net
nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image Segmentationno-new-Net原文链接nnU-Net可以自动调整架构以适应给定的图像用leaky ReLU代替ReLU，用实例标准化代替批处理标准化。在3D医学分割背景下使用2D U-net不是最优的，因为沿着z轴的有价值的信息不能被聚合和考虑。然而如果数据集是各项异性的，传统的3D分割性能下降。...
2021-12-27 17:28:58
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原创 基于深度学习的医学图像分割（十）TransUnet
TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation原文链接 CVPR2021结合Transformer和UNet，用于医学图像分割。
2021-12-21 21:47:07
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原创 Transformer学习笔记
文章目录一、Transformer二、Vision Transformer（ViT）三、Swin Transformer1.总体架构：2.W-MAS和SW-MAS一、Transformer论文题目：Attention Is All You Need（NIPS2017）Attention Is All You Need参考视频讲解参考笔记Transformer的输入和输出都是序列，它使用了编码器解码器的架构，将self-attention和point-wise和全连接层堆叠起来。模型结构如下图所示
2021-12-20 11:27:46
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记（九）UNet 3+
UNet 3+: A Full-Scale Connected UNet for Medical Image Segmentation原文链接代码dateset：131例腹部增强CT(3D)用于肝脏分割和49例脾脏数据集融合多尺度的特征是实现精确分割的重要因素之一。UNet++没有从全尺度上探索足够信息，本文提出了UNet3+，重新设计跳跃连接，利用full-scale跳跃连接和深度监督。full-scale跳跃连接结合了来自不同尺度的特征图的低级细节和高级语义，深度监督从full-scale聚.
2021-12-15 20:15:40
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翻译 基于深度学习的医学图像分割学习笔记（八）HF U-Net
HF-UNet: Learning Hierarchically Inter-Task Relevance in Multi-Task U-Net for Accurate Prostate Segmentation in CT ImagesIEEE Transactions on Medical Imaging(TMI)原文链接dataset：339张CT图像快速定位精确分割将多任务学习和深度神经网络相结合，提出了多任务卷积网络框架（主任务分割前列腺，辅助任务划定前列腺边界）与整个盆腔CT
2021-12-14 19:30:24
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原创 基于深度学习的医学图像分割笔记(七)Attention U-Net
Attention U-Net: Learning Where to Look for the PancreasMIDL 2018腹部CT胰腺分割数据集：TCIA Pancreas CT-82和multi-class abdominal CT-150原文链接pytorch代码（包含2D/3D版本）将soft-attention合并到标准的U-Net分割网络中的concatenation操作之前，抑制输入图像中的不相关的区域，突出特定局部区域的显著特征。网络结构：Attention Gat
2021-12-12 17:14:51
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记（六）V-Net
V-Net: Fully Convolutional Neural Networks for Volumetric Medical Image Segmentation原文链接
2021-12-08 16:59:38
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原创 基于深度学习的医学图像分割笔记（五）3D U-Net
3D U-Net:Learning Dense Volumetric Segmentation from Sparse AnnotationMICCAI20162018MICCAI脑肿瘤分割挑战赛brats第二名论文地址代码pytorch版本 一二一3D U-Net是UNet的一个简单扩展，将所有2D操作替换为3D操作，适用于三维图像分割问题二...
2021-12-06 17:20:47
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记（四）Prostate12 challenge
MICCAI Grand Challenge：Prostate MR Image Segmentation 2012本次挑战题目：分割前列腺包膜Prostate Segmentation一、Introduction二、Datesets三、 Evaluation论文链接挑战详情及数据集这篇文章主要是介绍数据集和分割算法的评价指标。一、Introduction由于MRI在prostate cancer的临床诊断和治疗上得到了广泛的应用，Prostate MRI图像分割已经成为一个激烈的研究领域
2021-12-03 21:52:04
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原创 基于深度学习的医学图像分割（三）UNet++: A Nested U-Net Architecture for Medical Image Segmentation
UNet++: A Nested U-Net Architecture for Medical Image Segmentation一.UNet++网络架构Re-designed skip pathwaysDeep supervision二.UNet++优势(对比UNet)三.Experiments实现细节四.Result原文链接作者解读一.UNet++网络架构UNet++与UNet相比re-designed skip pathways（图中绿色和蓝色部分）且运用了deep supervision
2021-12-02 20:04:20
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记(二)U-Net:Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation
U-Net:Convolutional Networks for Biomedical Image SegmentationUnet适用于各种生物医学图像分割问题，可以从少量的数据中学习到一个对边缘提取十分鲁棒的模型。Unet继承了FCN思想，但与FCN不同的是：Unet是完全对称的，对Decoder进行了加卷积加深处理，而FCN只是单纯的上采样。降采样对于分割网络是必要的，它可以增加对输入图像的一些小扰动的鲁棒性，减少过拟合的风险，降低运算量，增加感受野的大小。升采样把抽象的特征还原解码到原图的尺
2021-11-26 20:23:31
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原创 FCN-Fully Convolutional Networks
FCN-Fully Convolutional NetworksFCN：模型网络中的所有层都是卷积层，故称为全卷积网络。（从图像级别的分类进一步延伸到像素级别的分类，解决了语义级别的图像分割问题）卷积是下采样，用来提取图片的特征；反卷积是上采样，可以扩大数据维度。在FCN中先用卷积操作提取图像特征，再进行反卷积对特征图进行上采样，使它恢复到输入图像相同的尺寸，从而实现对每一个像素都产生一个预测FCN特点：（1）FCN将CNN中的全连接层转化为卷积层。//可以适应任意尺寸的输入（2）FCN可以接受
2021-11-13 21:12:51
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原创 基于深度学习的医学图像分割学习笔记(一）
基于深度学习的医学图像分割学习笔记(一）文章目录基于深度学习的医学图像分割学习笔记(一）一、医学图像的突出特征二、分割目标一、医学图像的突出特征医学图像相比于自然图像主要有四点区别：1.医学图像的模态更加多样化，不同模态反应的信息不一样。如X-ray观察骨骼更清晰，CT反应出血和组织，MRI观察软组织。2.医学图像的像素值范围与自然图像（0~255）有很大差别3.自然图像的光成像，由于散射的存在，频谱比较宽，所以近似认为自然图像的噪声分布是均匀的，建模为高斯分布；而医学图像的成像中，为尽量消除散
2021-11-11 15:17:56
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原创 leecode笔记-06从尾到头打印链表
leecode笔记-06从尾到头打印链表python3借助栈来实现：class Solution: def reversePrint(self, head: ListNode) -> List[int]: stack=[] while head: stack.append(head.val) head=head.next return stack[::-1]...
2021-06-10 15:40:31
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原创 Mean Teacher学习笔记（一）
Mean Teacher学习笔记（一）模型的核心思想：模型即充当学生，又充当老师。作为老师，用来产生学生学习时的目标，作为学生，利用老师模型产生的目标来学习。为了克服Temporal Ensembling的局限性，我们建议平均模型权重而不是预测。教师模式是连续学生模式的平均值，因此我们叫它Mean teacher。与直接使用最终的权重相比，将模型权重平均到训练步骤会产生更准确的模型，在训练中可以利用这一点来构建更好的目标。教师模型使用学生模型的EMA权重，而不是与学生模型共享权重。同时，由于权值平均改善
2020-11-19 21:22:05
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原创 python报错ModuleNotFoundError: No module named ‘matplotlib‘
ModuleNotFoundError: No module named ‘matplotlib’打开cmd，输入pip3 install --user matplotlib
2020-11-14 20:33:43
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原创 多视角聚类学习（三）Partition level multiview subspace clustering
Partition level multiview subspace clusteringAbstractIntroductionAbstract多视角子空间聚类主要集成数据点所在空间的多视图信息，它的性能可能受到每个单独视图中存在的噪声或异构特征之间不一致的影响。对于多视角聚类，基本前提是所有视图之间存在共享分区， 因此，多视图聚类的自然空间应该是所有分区。我们建议在分区级融合多视图信息，遵循两个直观的假设:(i)每个分区都是一致性聚类的扰动;(ii)对接近一致性聚类的分区赋较大的权值。本文提出了一
2020-11-13 19:47:19
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原创 多视角聚类学习(一)An overview of recent multi-view clustering
An overview of recent multi-view clustering1.Introduction2.Recent multi-view clustering algorithms2.1Graph-based model2.2.1AMLG2.2Space-learning-based model2.3Binary-code-learning-based model3.Current challenges and future directions4.Conclusion and future
2020-11-11 17:11:23
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