DJJ5210的博客

去rdkit-pypi官网（https://pypi.org/project/rdkit-pypi/#description）找到对应版本的。ImportError: DLL load failed while importing rdmolfiles: 找不到指定的程序。除非修改python版本到较低版本如python3.7或python3.6，使用下面两种方法都是安装的之前版本的rdkit，找到对应版本的支持python3.8的安装指令。

Rdkit|化学指纹（fingerprint）化学指纹（fingerprint）RDKit中还有许多其他类型的分子指纹可供选择，以下是其中几个常见的分子指纹类型：Morgan指纹（Circular fingerprints）：基于分子的拓扑结构和半径参数生成的二进制指纹，可以用于描述分子的结构和相似性。MACCS指纹（MACCS keys）：基于分子的结构和功能团片段生成的二进制指纹，可以用于进行药物相似性和虚拟筛选。

标准化之前：O=C(N[C@@H](C)C1=CC=C(C(O)=O)C=C1)C2=C(CC3=CC=C(OC(F)F)C(OC(F)F)=C3)SC4=C2CCOC4。其中重要的一个参数：“isomericSmiles”，它表示是否保存原始分子的手性，当时做分子生成的时候坑惨了，我说怎么生成的分子都是不带有手性的呢？"C@@H"和"C@H"这两种手性也是不一样的，以下两幅图的手性也是不同的，他们对应的化学反应可能也是不同的，"C@@H"和"C@H"区别以及和rdkit的标准化方法。

需要注意一点的是，文件目录和直接复制下来的，转折符需要换个方向。

SDF (Structure Data File)是常见的化学数据文件，SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification)是一种用ASCII字符串明确描述分子结构的规范。它们被广泛应用于计算化学，化学信息学等领域。本文将介绍如何使用化学信息学工具RDKit实现这两者的相互转化。