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原创 用AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接
四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn),专业从事分子模拟,量子化学等计算服务,欢迎咨询!Autodock分子对接教程Autodock是一款分子对接软件包,开源且免费,官方网址是http://autodock.scripps.edu/,目前最新的版本是AutoDock4.2.6,包括AutoDock和AutoGrid两个模块,AutoDock软件包下载地址为http:...
2017-12-20 21:14:42 45428 7
原创 如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正!四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn),专业从事分子模拟,量子化学等计算服务,欢迎咨询!大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图,现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享,希望对大家的科研工作有所帮助,效果图如下:1、在蛋白质数据、Genbank、Uniprot等数据库搜索得到蛋白质...
2017-12-16 21:35:49 65159
原创 计算表面静电势_APBS工具
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正!四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn),专业从事分子模拟,量子化学等计算服务,欢迎咨询! APBS工具是一种可以绘制表面静电势的工具,目前在多个软件中均有APBS的插件,如VMD、PyMOL等,但是笔者都使用过这些工具,发现Chimera软件的APBS工具是最方便的,效果图如下所示,适合于初学者,下面我...
2017-12-14 20:50:51 9603 2
原创 采用Modeller进行同源建模_单模板建模
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结,如有错误,欢迎批评指正!四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn),专业从事分子模拟,量子化学等计算服务,欢迎咨询! Modeller是一款比较优秀的同源建模软件,包括单模板和多模板建模,Discovery Studio软件中就是采用的Modeller建模模块。Modeller目前最新的版本是9.19,下载网址为http...
2017-12-12 21:55:12 13665 1
空空如也
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