与Python的速度较量：C++究竟有多快？

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对于数据科学家而言，热爱Python的理由数不胜数。但你是否也曾问过这样的问题：Python和C或C++等更专业的低级编程语言究竟有何不同呢？我想这是很多数据科学家或者Python用户曾经问过或者将来会问自己的问题。

 

Python和C++类语言之间存在许多区别，本文将通过一个十分简单的例子向你展示，与Python相比，C++究竟有多快。

 

为了说明这种区别，本文选择一个简单实用而非想象虚构的任务：生成固定值为“k”的所有可能DNA k-mers。选择该示例，是因为与基因组相关的许多数据处理和任务分析（例如k-mers生成）都是计算密集型的，而这同样也是很多生物信息学领域的数据科学家对C++感兴趣的原因。

 

请注意，本文目标并不是以最有效的方式比较C++和Python。这两种代码均可采用更高效的方式和更优化的方法编写。本文的唯一目标，就是比较这两种语言在使用完全相同的算法和指令时的速度。

 

DNA K-mers简介

 

DNA是一种称为核苷酸的长链单位。在DNA中，共有4种核苷酸类型，分别用字母A、C、G和T表示。人类（更准确地说是智人）拥有核苷酸对30亿个。例如，人类DNA的一小部分可能类似于：

 

ACTAGGGATCATGAAGATAATGTTGGTGTTTGTATGGTTTTCAGACAATT

 

在此示例中，如果从该字符串