描述
一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。
给定一个很长的DNA序列,以及限定的子串长度N,请帮助研究人员在给出的DNA序列中从左往右找出GC-Ratio最高且长度为N的第一个子串。
DNA序列为ACGT的子串有:ACG,CG,CGT等等,但是没有AGT,CT等等
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1
输入:
ACGT
2
输出:
CG
说明:
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG
示例2
输入:
AACTGTGCACGACCTGA
5
输出:
GCACG
说明:
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>
int main(void)
{
char str[100] = {0};
char *p;
int i, j, k;
int num;
int max;
scanf("%s", str);
scanf("%d", &num);
p = (char* )malloc(num+1);
max = 0;
for(i=0; i<=strlen(str)-num; i++)
{
k = 0;
for(j=i; j<i+num; j++)
{
if(str[j]=='C' || str[j]=='G')
{
k++;
}
}
if(max < k)
{
max = k;
strncpy(p, &str[i], num);
}
}
printf("%s\n", p);
free(p);
return 0;
}